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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Molecular Dynamics Data Bank. The European Repository for Biosimulation Data

Description du projet

Simuler la dynamique moléculaire pour soutenir la recherche en biologie et en chimie

Les simulations de dynamique moléculaire (DM), largement utilisées, ont permis de réaliser de grandes avancées dans de nombreuses disciplines scientifiques. Des millions d’heures de supercalculateur sont consacrées à la compilation de données sur les trajectoires pour produire une multitude d’informations de simulation. Cependant, en raison de la faible tradition de partage des données et du manque d’infrastructures appropriées, la communauté reste dans l’incapacité de les analyser correctement. La conséquence de ce manque d’analyse est la perte de données. Dans ce contexte, le projet MDDB, financé par l’UE, concevra un référentiel de simulations de DM (et des outils d’analyse y afférents) à l’échelle européenne, qui sera intégré à la recherche en biologie et en chimie. Le projet optimisera les ressources informatiques, favorisera l’analyse (et la méta-analyse) des trajectoires pour plusieurs perspectives et domaines, et garantira un échange d’informations rapide et efficace entre les groupes.

Objectif

After decades of development and a Nobel prize, Molecular Dynamics (MD) has reached maturity. It is no longer an exotic technique used by a small group of theoreticians but rather a method extensively used by a very large community of users. Millions of supercomputer hours are devoted to collecting trajectories, thus producing a deluge of simulation data that the community is unable to handle. A poor tradition of data sharing and the lack of appropriate infrastructures to do so lead to the loss of data after limited analysis that most likely revealed only a small fraction of the information contained. Sparse initiatives to build trajectory repositories have encountered difficulties related to: i) the lack of trust of the community in the reliability of the data deposited; ii) the lack of interoperable standards and simulation ontologies; iii) uncertainties regarding the database technology required; v) difficulties of the users to interact in an open manner with the data; and vi) disconnection of the MD-field with neighboring communities. The MDDB projects intends to design a European-scale repository of MD simulation (and associated analysis tools), which will: i) optimize computational resources; ii) favor the analysis (and meta-analysis) of trajectories for many different perspectives and fields; iii) guarantee a fast and efficient interchange of information between groups; and iv) facilitate the integration of the MD simulation field into neighboring communities. The overall result will be a more efficient use of MD and the integration of the MD field into mainstream biology and chemistry research.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-RIA - HORIZON Research and Innovation Actions

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-INFRA-2022-DEV-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA (IRB BARCELONA)
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 737 814,00
Adresse
CARRER BALDIRI REIXAC 10-12 PARC SCIENTIFIC DE BARCELONA
08028 Barcelona
Espagne

Voir sur la carte

Région
Este Cataluña Barcelona
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 737 815,00

Participants (4)

Partenaires (2)

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