Description du projet
Comment les réseaux de régulation des gènes contribuent à une ingénierie cellulaire précise
Les cellules humaines modifiées cultivées en laboratoire ont considérablement amélioré notre capacité à modéliser la biologie et les maladies humaines. Cependant, la transcriptomique unicellulaire révèle que ces cellules diffèrent souvent des cellules naturelles présentes dans le corps humain. Il est difficile de réaliser une ingénierie cellulaire précise si l’on ne comprend pas les réseaux de régulation des gènes (RRG) qui définissent l’identité cellulaire. Le projet DECIPHER, financé par le CER, vise à relever ce défi en décodant les RRG à l’aide de technologies unicellulaires avancées. Il convertira des cellules souches pluripotentes induites humaines en sous-types neuronaux et gliaux spécifiques et étudiera comment ces cellules interagissent dans un environnement multicellulaire. En révélant comment les RRG contrôlent l’identité cellulaire et conduisent la maturation, DECIPHER cherche à permettre une ingénierie plus précise des cellules humaines pour la modélisation des maladies, la thérapie cellulaire et la médecine régénérative.
Objectif
Human cells engineered in vitro have revolutionized our ability to model human biology and diseases, offering exciting opportunities for therapeutic screening and intervention. However, single-cell transcriptomics (scRNA-seq) reveals that engineered cells often remain heterogeneous, immature, and dissimilar to primary counterparts. Precise cell engineering remains challenging without systematic interrogation of gene regulatory networks (GRNs) that establish cell identity. Here, we propose to engineer precise cell fates and states by coupling GRN decoding, perturbation screening, and single-cell technologies. Our vision is to decode GRNs that shape cell identities in fate specification, multicellular communication, and maturation, and use this insight to 1) engineer precise cell subtypes, 2) reconstruct niche-specific signatures, and 3) accelerate maturation. Using human induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived neural cells, we will first couple combinatorial transcription factor screening with scRNA-seq to directly induce iPSCs into specific neuron subtypes guided by primary neuron GRNs. Second, we will program glial cell subtypes and reconstruct multi-cellular niche with neurons, analyze how niche cross-talk impacts cell fates and states, and use emerged GRNs to engineer niche-specific signatures. Finally, we will decode dynamic GRNs during neural maturation and screen for determinants to accelerate maturation. DECIPHER aims to dissect the causal links between GRNs and cell identities, offering mechanistic insights into drivers of cell identity changes with the ambitious goals to engineer precise and mature cell subtypes for disease modeling, cell therapy, and regenerative medicine. Our approach holds great potential to study diverse cell fate and state transition events, such as development, reprogramming, regeneration, and cancer. The perturbation atlas generated here will empower AI-driven predictive modelling to guide future cell engineering.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
08003 Barcelona
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.