Description du projet
Une nouvelle manière d’aborder la résistance aux médicaments anticancéreux
Les avancées en génétique du cancer ont permis la découverte de nombreux traitements anticancéreux prometteurs et ciblés. Toutefois, la médecine de précision du cancer est souvent freinée par l’émergence de la résistance aux médicaments. Les scientifiques du projet COMBAT-RES, financé par l’UE, entendent répondre à ce problème en développant des méthodes d’identification de la résistance aux médicaments, de détection des biomarqueurs associés, et de prédiction ultérieure des combinaisons de médicaments visant à surmonter la résistance inévitable aux médicaments découlant de la monothérapie. Pour y parvenir, ils développeront des méthodes informatiques innovantes pour des criblages à haut débit de médicaments in vitro, et valideront ces prédictions in vivo. L’objectif à long terme est d’anticiper l’évolution du cancer et de prévenir la résistance à la monothérapie en identifiant des combinaisons intelligentes de médicaments qui présentent une action synergique et améliorent l’index thérapeutique.
Objectif
Personalising treatments based on tumour genetic profiles enables cancer precision medicine. However, treating cancers using targeted therapies often fails due to the emergence of drug resistance. Here, my goal is to use drug high-throughput screens (HTS) combined with computational methods to identify resistance and its biomarkers, and to overcome it with smart drug combinations to empower cancer precision medicine.
Identifying resistance in HTS is challenging: dissecting meaningful drug responses at high concentrations is impossible due to cytotoxicity, making non-responders and resistant cell lines indistinguishable, thus limiting resistance biomarker discovery to frequently mutated cancer genes. To address this, I will employ three approaches: 1) systematically identify non-responding cell lines carrying low-frequency resistance markers; 2) reveal intrinsic resistance driven by gene expression plasticity by conducting my own RNA sequencing experiments and modelling the maximal effect at high drug concentration; 3) identify drugs which increase cell viability, combined with drugs targeting fast proliferating cells. My paradigm shift, that resistance biomarkers become synergy markers, empowers smart drug combinations.
Additionally, I aim to predict drug synergy based on multi-task deep learning using molecular characterisation, QSAR modelling and monotherapies; and, to boost biomarker discovery by identifying clinically-relevant cancer subtypes based on transfer and reinforcement learning.
COMBAT-RES will benefit from data access to a phase III clinical trial in colorectal cancer (COREAD) and access to the largest human pancreas adenocarcinoma (PAAD) combination HTS (currently unpublished) accelerating the delivery of medicine for COREAD and PAAD patients. COMBAT-RES will interrogate the underpinnings of drug resistance, clinically-relevant subtypes and overcome it with highly synergistic drug combinations, enabling the next generation of precision medicine.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie cancer de la prostate
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
85764 Neuherberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.