Objectif
Current models present an increasingly complex picture of mRNA translation, in which several pathways work together to define protein output in a context-dependent way. Disruptions can lead to disease, yet we are only beginning to crack the combinatorial code that links mRNA features to correct translation levels. Yet, translation is characterized by a confined and modular cis-regulatory space, making it ideal for dissecting function with cutting edge genomics and machine learning (ML).
TRANS-DECODE will deliver a systematic, data- and model-driven strategy for decoding the regulation of mRNA translation at unprecedented resolution and interpretability. Our innovative approach will combine high-throughput massively parallel reporter assays (MPRAs), ribosome profiling, and CRISPR based validation screens with explainable AI and RNA foundation models. We will use iterative design-build-test cycles in human cells and zebrafish as vertebrate model to construct interpretable, predictive models of translation initiation, elongation, and mRNA stability. The project is structured into four ambitious and synergistic aims:
1. Determine the RNA sequence/structure determinants of translation initiation in 5’UTRs using MPRAs and interpretable ML.
2. Connect sequence features to regulatory pathways by perturbing translation initiation factors.
3. Dissect spatial-temporal translation control in vertebrates by adapting MPRAs to spatial single-cell resolution in zebrafish development.
4. Develop generative models of translation that encompass initiation, elongation, and RNA stability to identify pathogenic sequence variants.
The insights gained will not only unravel the molecular logic of translation and open new paths to correct non-coding mutations in human disease, but also enable a directed design of RNA for therapeutic and synthetic biology applications. This will position the project as a blueprint for an AI-driven systematic dissection of cis-regulatory mechanisms.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biologie synthétique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles informatique et science de l'information intelligence artificielle intelligence artificielle générative
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences naturelles informatique et science de l'information intelligence artificielle apprentissage automatique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
13125 Berlin
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.