Obiettivo
Current models present an increasingly complex picture of mRNA translation, in which several pathways work together to define protein output in a context-dependent way. Disruptions can lead to disease, yet we are only beginning to crack the combinatorial code that links mRNA features to correct translation levels. Yet, translation is characterized by a confined and modular cis-regulatory space, making it ideal for dissecting function with cutting edge genomics and machine learning (ML).
TRANS-DECODE will deliver a systematic, data- and model-driven strategy for decoding the regulation of mRNA translation at unprecedented resolution and interpretability. Our innovative approach will combine high-throughput massively parallel reporter assays (MPRAs), ribosome profiling, and CRISPR based validation screens with explainable AI and RNA foundation models. We will use iterative design-build-test cycles in human cells and zebrafish as vertebrate model to construct interpretable, predictive models of translation initiation, elongation, and mRNA stability. The project is structured into four ambitious and synergistic aims:
1. Determine the RNA sequence/structure determinants of translation initiation in 5’UTRs using MPRAs and interpretable ML.
2. Connect sequence features to regulatory pathways by perturbing translation initiation factors.
3. Dissect spatial-temporal translation control in vertebrates by adapting MPRAs to spatial single-cell resolution in zebrafish development.
4. Develop generative models of translation that encompass initiation, elongation, and RNA stability to identify pathogenic sequence variants.
The insights gained will not only unravel the molecular logic of translation and open new paths to correct non-coding mutations in human disease, but also enable a directed design of RNA for therapeutic and synthetic biology applications. This will position the project as a blueprint for an AI-driven systematic dissection of cis-regulatory mechanisms.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biologia sintetica
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale intelligenza artificiale generativa
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione intelligenza artificiale apprendimento automatico
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
13125 Berlin
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.