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Repeat variants shaping disease risk in FinnGen and Estonian Biobank cohorts

Obiettivo

A substantial proportion of the human genome consists of repetitive content, until recently discarded as “junk DNA”. These include tandem repeats (TRs)—stretches of short sequence motifs repeated consecutively—and mobile elements (MEs), or interspersed repeats capable of replicating and inserting themselves into new genomic locations. Despite their abundance and likely major contribution to disease, repeat variants have been largely neglected in genetic association studies, primarily due to the limited resolution of standard discovery and genotyping methods.

The aim of my MSCA Postdoctoral Fellowship project is to systematically detect and characterise the effects of repeat variants on human traits and diseases. To make TRs and MEs accessible in large population biobanks with mainly microarray data available, I will develop an advanced haplotype-informed framework for repeat variant discovery and imputation, applying it to FinnGen and Estonian Biobank—two cohorts distinguished by exceptionally high population representation and dense familial relatedness in Europe. In the Estonian Biobank specifically, I will leverage long-read sequencing data to construct what will be, to my knowledge, the most comprehensive reference panel of repeat variants to date. The imputed variants will then undergo association testing with rich registry-linked phenotypic data.

Given the overall scarcity of repeat-focused studies at biobank-scale, this project is well positioned to uncover a substantial number of previously unreported phenotype associations. By filling this gap, the project has the potential to deliver novel biological insights into how repeat variants influence human traits and diseases, leading to improved risk prediction and population health.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

HELSINGIN YLIOPISTO
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 242 116,80
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
Il mio fascicolo 0 0