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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Algorithmics for Metagenomics on Grids

Objectif

Numerous critical problems in bioinformatics and computational biology are computationally intensive and could benefit from being solved on a computational Grid, that is a network of geographically distributed computers. Most works that combine bioinformatics and Grids focus on biological problems that can be trivially adapted to Grids, staying clear of more complex problems. In this fellowship we propose to address, in an interdisciplinary research, the resolution on Grids of two complex and demanding problems: metagenomics assembly and metagenomics annotation. Metagenomics is the study of the genomes of an entire community of microbes; metagenomics assembly is the problem of assembling the genome of each of the microbial species in the studied community. The applicant, a Grid computing expert, proposes to work with experts in bioinformatics and experts in Grid computing to design new algorithmic solutions to solve these two metagenomics problems. In this proposal, the applicant would simultaneously visit for a year, and work with, Prof. Guylaine Poisson's Bioinformatics Lab (BiL) and Prof. Henri Casanova's Concurrent Research Group (CoRG), both located at the University of Hawai`i at Manoa, USA.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2007-4-1-IOF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Coordinateur

INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE EN INFORMATIQUE ET AUTOMATIQUE
Contribution de l’UE
€ 118 572,06
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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