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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Personalized bioinformatics for global cancer susceptibility identification and clinical management

Objectif

Cancer sequencing studies have extensively investigated the landscape of somatic mutations that drive tumor development, however the importance of germline variation for cancer susceptibility has been neglected. We hypothesize that for cancer types affecting a large proportion of the population, a shared set of genes with variants of different levels of penetrance leads to the clinical phenotype. While rare germline variants are not interrogated by array-based genome-wide association studies (GWAS), these can be effectively studied by whole-genome or whole-exome sequencing. Here, we propose in-depth pan-cancer analyses, which will be implemented as part of the International Cancer Genome Consortium (ICGC) initiative, as a model to develop and apply the necessary bioinformatics tools and pipelines to fully exploit the cancer-genome datasets, and to harness the diagnostic power of genome sequencing in day-to-day clinical practice. Our proposal addresses the full chain of computational and statistical tools that are needed for clinically relevant diagnosis and intervention, including discovery in large cohorts, validation of putative causal sites in model systems and development of targeted cancer-risk panels. The consortium combines complementary expertise to extend the computational discovery of novel variants that influence cancer susceptibility to intergenic and regulatory variants; to integrate genomic, molecular phenotype, biomarker and clinical data; and to develop novel statistical methods for variant association and eQTL analysis. The project will deal with essential aspects on how data are collected, stored, organized, integrated, analyzed and exploited in cancer genetic clinics. We aim to provide a concerted, cross-disciplinary framework for a better understanding, integration and use of cancer clinical data in the evaluation of the multitude of genetic variants and mutations involved in cancer susceptibility, for the direct benefit of cancer patients.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

RIA - Research and Innovation action

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-PHC-2014-2015

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

FUNDACION PUBLICA GALEGA DE MEDICINA XENOMICA
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 558 350,00
Adresse
Hospital Clínico Universitario. Edif. consultas planta -2. Choupana s/n
15706 Santiago De Compostela
Espagne

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Région
Noroeste Galicia A Coruña
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 558 350,00

Participants (5)

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