Obiettivo
DNA-protein cross-links (DPCs) are common DNA lesions caused by endogenous, environmental, and chemotherapeutic agents. Cells are susceptible to these lesions during S phase, as DPCs impede replication fork progression and are likely to induce genomic instability, a cause of cancer and aging. Despite its relevance to human health, the repair of DPCs is poorly understood. Research on DPC repair has mainly involved testing cellular responses to compounds such as formaldehyde, but these agents induce a wide variety of DNA lesions, and conflicting results have been reported. To overcome these obstacles, I have developed the first in vitro system that recapitulates replication-coupled DPC repair. In this system, a plasmid containing a site-specific DPC is replicated in Xenopus egg extracts. Using this approach, I demonstrated that DPC repair requires DNA replication. When a replication fork encounters a DPC, the DPC is degraded into a peptide-adduct, which allows replication bypass by translesion DNA synthesis. Importantly, these experiments identified a novel proteolytic pathway whose activity is regulated by replication.
This in vitro system now provides a powerful means to identify and characterize the different factors that participate in S phase DPC repair. I speculate that for DPC processing to occur, the protein-adduct must first be detected, then marked for degradation and ultimately degraded. Using a series of complementary strategies, which will take advantage of the in vitro system combined with proteome and genome wide approaches, I seek to uncover the different players that participate in each of these events. This project will enable a detailed mechanistic outlook of a complex multi-step reaction that has not been feasible to achieve using existing methodologies. It will also improve our understanding of how DPCs impact genomic stability and the consequences of not repairing these lesions for human health.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/it/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia scoperta di farmaci
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica aldeidi
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-STG - Starting Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2016-STG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1165 KOBENHAVN
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.