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An RNA-based mechanism for the nutritional control of bacterial DNA replication initiation

Obiettivo

DNA replication is a fundamental biological process enabling the transmission of genetic information to progeny. In bacteria, its initiation involves a set of genes whose regulation is critical to ensure genome stability, both under optimal conditions and in response to environmental cues, including changes in nutrient availability. The highly conserved bacterial initiator protein DnaA has been proposed as a primary target for the nutritional control of DNA replication. Nevertheless, surprisingly little is known about the molecular mechanisms modulating its activity in response to nutrient limitation. Previous work showed that the synthesis and degradation of DnaA are both subject to control mechanisms that respond to environmental changes in the model organism Caulobacter crescentus. The 5’-UTR of dnaA mRNA was discovered to be required for the downregulation of the protein and the block of DNA replication initiation in response to nutrient depletions by a so far unknown post-transcriptional mechanism. Based on my preliminary in silico analysis I hypothesize that the 5’-UTR of dnaA can assume distinct conformations with different ribosome binding site accessibilities. Switching between these conformations is likely triggered by a trans-acting factor, either a small RNA, an RNA-binding protein or a metabolite, that is produced in response to nutrient availability. The present project proposal aims to elucidate the precise molecular mechanism underlying the post-transcriptional control of dnaA and to determine its consequences on DNA replication and cellular survival by combining classical biochemistry and genetics with cutting-edge molecular biology techniques. I expect that this work will contribute to the development of new strategies for bacterial growth control in industry and medicine. Importantly, the results of this study will provide key insights for the understanding of one of the most important biological processes: the regulation of DNA replication.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF-EF-ST - Standard EF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2017

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

STOCKHOLMS UNIVERSITET
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 173 857,20
Indirizzo
UNIVERSITETSVAGEN 10
10691 Stockholm
Svezia

Mostra sulla mappa

Regione
Östra Sverige Stockholm Stockholms län
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 173 857,20
Il mio fascicolo 0 0