Advancing Lactobacillus’ beneficial potential

Informations projet

Lacto-Be

N° de convention de subvention: 852600

DOI

10.3030/852600

Projet clôturé

Date de signature de la CE 3 Février 2020

Date de début 1 Mars 2020

Date de fin 28 Février 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 499 581,00

Contribution de l’UE

€ 1 499 581,00

Coordonné par

UNIVERSITEIT ANTWERPEN
Belgium

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Publications

Peer reviewed articles (37)

The Greenhouse Phyllosphere Microbiome and Associations with Introduced Bumblebees and Predatory Mites

Auteurs: Marie Legein, Wenke Smets, Karen Wuyts, Lien Bosmans, Roeland Samson, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbiology Spectrum, Numéro 10, 2022, ISSN 2165-0497
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/spectrum.01755-22

Lactobacillus isalae sp. nov., isolated from the female reproductive tract

Auteurs: Tom Eilers, Jelle Dillen, Sarah Ahannach, Leonore Vander Donck, Nele Van de Vliet, Stijn Wittouck, Sarah Lebeer
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 73, 2023, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.006038

Distribution of C30 carotenoid biosynthesis genes suggests habitat adaptation function in insect-adapted and nomadic Lactobacillaceae

Auteurs: Tom Eilers, Marie Legein, Jari Temmermans, Jelle Dillen, Ine Vandendriessche, Koen Sandra, Peter A. Bron, Stijn Wittouck, Sarah Lebeer
Publié dans: Communications Biology, Numéro 7, 2024, Page(s) 1610, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-024-07291-2

The role of lactobacilli in inhibiting skin pathogens

Auteurs: Lize Delanghe, Irina Spacova, Joke Van Malderen, Eline Oerlemans, Ingmar Claes, Sarah Lebeer
Publié dans: Biochemical Society Transactions, Numéro 49/2, 2021, Page(s) 617-627, ISSN 0300-5127
Éditeur: Portland Press, Ltd.
DOI: 10.1042/bst20200329

Lactic acid bacteria as probiotics for the nose?

Auteurs: Ilke De Boeck, Irina Spacova, Olivier M. Vanderveken, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbial biotechnology, Numéro 17517915, 2021, Page(s) 859-869, ISSN 1751-7915
Éditeur: Society for Applied Microbiology
DOI: 10.1111/1751-7915.13759

Antimicrobial potential of known and novel probiotics on in vitro periodontitis biofilms

Auteurs: Wannes Van Holm, Rita Carvalho, Lize Delanghe, Tom Eilers, Naiera Zayed, Fabian Mermans, Kristel Bernaerts, Nico Boon, Ingmar Claes, Sarah Lebeer & Wim Teughels
Publié dans: npj Biofilms and Microbiomes, Numéro 9 :1 (2023) ,, 2023, Page(s) p. 1-12, ISSN 2055-5008
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41522-023-00370-y

The nasal mutualist Dolosigranulum pigrum AMBR11 supports homeostasis via multiple mechanisms

Auteurs: Ilke De Boeck, Stijn Wittouck, Katleen Martens, Irina Spacova, Eline Cauwenberghs, Camille Nina Allonsius, Jennifer Jörissen, Sander Wuyts, Wannes Van Beeck, Jelle Dillen, Peter A Bron, Brecht Steelant, Peter W Hellings, Olivier M Vanderveken, Sarah Lebeer
Publié dans: iScience, Numéro 25890042, 2021, ISSN 2589-0042
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.isci.2021.102978

The biocontrol agent <i>Lactiplantibacillus plantarum</i> AMBP214 is dispersible to plants via bumblebees

Auteurs: Jari Temmermans, Marie Legein, Yijie Zhao, Filip Kiekens, Guy Smagghe, Barbara de Coninck, Sarah Lebeer
Publié dans: Applied and Environmental Microbiology, Numéro 89, 2023, ISSN 0099-2240
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.00950-23

Relationship between classic indicators of health behaviour and contraceptive choices in women in Flanders

Auteurs: Nina Van Eekert, Naomi Biegel, Leen De Kort, Veronique Verhoeven, Thies Gehrmann, Caroline Masquillier, Sarah Ahannach, Sarah Lebeer
Publié dans: BMC Women's Health, Numéro 24, 2024, Page(s) 275, ISSN 1472-6874
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12905-024-03079-y

Impacts of Menstruation, Community Type, and an Oral Yeast Probiotic on the Vaginal Microbiome

Auteurs: Eline Oerlemans, Sarah Ahannach, Stijn Wittouck, Elodie Dehay, Ilke De Boeck, Natalhie Ballet, Bertrand Rodriguez, Ines Tuyaerts, Sarah Lebeer
Publié dans: mSphere, Numéro 7: 5 (2022), 2022, Page(s) p. 1-13, ISSN 2379-5042
Éditeur: Amer soc microbiology
DOI: 10.1128/msphere.00239-22

Microbial enrichment and storage for metagenomics of vaginal, skin, and saliva samples

Auteurs: Sarah Ahannach, Lize Delanghe Irina Spacova, Stijn Wittouck, Wannes Van Beeck, Ilke De Boeck, Sarah Lebeer
Publié dans: iScience, Numéro 25890042, 2021, Page(s) 1-20, ISSN 2589-0042
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.isci.2021.103306

Questioning the fetal microbiome illustrates pitfalls of low-biomass microbial studies

Auteurs: Katherine M. Kennedy, Marcus C. de Goffau, Maria Elisa Perez-Muñoz, Marie-Claire Arrieta, Fredrik Bäckhed, Peer Bork, Thorsten Braun, Frederic D. Bushman, Joel Dore, Willem M. de Vos, Ashlee M. Earl, Jonathan A. Eisen, Michal A. Elovitz, Stephanie C. Ganal-Vonarburg, Michael G. Gänzle, Wendy S. Garrett, Lindsay J. Hall, Mathias W. Hornef, Curtis Huttenhower, Liza Konnikova, Sarah Lebeer, Andrew
Publié dans: Nature, Numéro 613, 2023, Page(s) 639–649, ISSN 1476-4687
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-022-05546-8

Latilactobacillus fragifolii sp. nov., isolated from leaves of a strawberry plant (Fragaria x ananassa)

Auteurs: Marie Legein, Stijn Wittouck, Sarah Lebeer
Publié dans: International journal of systematic and evolutionary microbiology, Numéro 14665026, 2022, Page(s) 1-9, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.005193

Topical Microbial Therapeutics against Respiratory Viral Infections

Auteurs: Irina Spacova, Ilke De Boeck, Peter A Bron, Peter Delputte, Sarah Lebeer
Publié dans: Trends in molecular medicine, Numéro 14714914, 2021, Page(s) 538-553, ISSN 1471-4914
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.molmed.2021.03.009

Tidytacos: An R package for analyses on taxonomic composition of microbial communities

Auteurs: Stijn Wittouck, Tim Van Rillaer, Wenke Smets, Sarah Lebeer
Publié dans: Journal of Open Source Software, Numéro 10, 2025, Page(s) 6313, ISSN 2475-9066
Éditeur: The Open Journal
DOI: 10.21105/joss.06313

At the Interface of Life and Death: Post-mortem and Other Applications of Vaginal, Skin, and Salivary Microbiome Analysis in Forensics

Auteurs: Sarah Ahannach, Irina Spacova, Ronny Decorte, Els Jehaes and Sarah Lebeer.
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 1664302X, 2021, Page(s) 1-10, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2021.694447

Randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled Trial of a Throat Spray with Selected Lactobacilli in COVID-19 Outpatients

Auteurs: Ilke De Boeck, Eline Cauwenberghs, Irina Spacova, Thies Gehrmann, Tom Eilers, Lize Delanghe, Stijn Wittouck , Peter A. Bron, Tim Henkens, Imane Gamgami, Alix Simons, Ingmar Claes, Joachim Mariën, Kevin K. Ariën, Diana Bakokimi, Katherine Loens, Kevin Jacobs, Margareta Ieven, Patricia Bruijning-Verhagen, Peter Delputte, Samuel Coenen, Veronique Verhoeven, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbiology Spectrum, Numéro 10 :5 (2022), 2022, Page(s) p. 1-14, ISSN 2165-0497
Éditeur: ASM Press
DOI: 10.1128/spectrum.01682-22

Selective targeting of skin pathobionts and inflammation with topically applied lactobacilli

Auteurs: Sarah Lebeer, Eline Oerlemans, Ingmar Claes, Tim Henkens, Lize Delanghe, Sander Wuyts, Irina Spacova, Marianne F.L. van den Broek, Ines Tuyaerts, Stijn Wittouck, Ilke De Boeck, Camille Allonsius, Filip Kiekens, Julien Lambert
Publié dans: Cell Reports Medicine, Numéro 26663791, 2022, Page(s) 1-14, ISSN 2666-3791
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xcrm.2022.100521

Recent Insights into the vaginal microbiota

Auteurs: Sandra Condori, Sarah Ahannach, Leonore Vander Donck, Eline Oerlemans, Jelle Dillen, Caroline Dricot, Thies Gehrmann, Irina Spacova, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbiome in health and disease, Numéro 27048845, 2022, Page(s) 1-12, ISSN 2704-8845
Éditeur: European Helicobacter & Microbiota Study Group
DOI: 10.26355/mhd_20229_771

Mild atopic dermatitis is characterized by increase in non-staphylococcus pathobionts and loss of specific species

Auteurs: Lize Delanghe, Ilke De Boeck, Joke Van Malderen, Camille Nina Allonsius, Tim Van Rillaer, Peter A. Bron, Ingmar Claes, Margo Hagendorens, Sarah Lebeer, Julie Leysen
Publié dans: Scientific Reports, Numéro 14, 2024, ISSN 2045-2322
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-024-74513-2

Spontaneous Riboflavin-Overproducing Limosilactobacillus reuteri for Biofortification of Fermented Foods

Auteurs: Irina Spacova, Sarah Ahannach, Annelies Breynaert, Isabel Erreygers, Stijn Wittouck, Peter A. Bron, Wannes Van Beeck, Tom Eilers, Abbas Alloul, Naïm Blansaer, Siegfried E. Vlaeminck, Nina Hermans, Sarah Lebeer
Publié dans: Frontiers in Nutrition, Numéro 9:916607, 2022, ISSN 2296-861X
Éditeur: Frontiers Media S.A
DOI: 10.3389/fnut.2022.916607

Cotton and Surgical Face Masks in Community Settings: Bacterial Contamination and Face Mask Hygiene

Auteurs: Lize Delanghe, Eline Cauwenberghs, Irina Spacova, Ilke De Boeck, Wannes Van Beeck, Koen Pepermans, Ingmar Claes, Dieter Vandenheuvel, Veronique Verhoeven, Sarah Lebeer
Publié dans: Frontiers in medicine, Numéro 2296858X, 2021, Page(s) 1-12, ISSN 2296-858X
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fmed.2021.732047

Postbiotics in the medical field under the perspective of the ISAPP definition: scientific, regulatory, and marketing considerations

Auteurs: Gabriel Vinderola, Céline Druart, Luis Gosálbez, Seppo Salminen, Nina Vinot, Sarah Lebeer
Publié dans: Frontiers in Pharmacology, Numéro 14, 2023, ISSN 1663-9812
Éditeur: Frontiers Media S.A.
DOI: 10.3389/fphar.2023.1239745

A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerinck 1901, and union of Lactobacillaceae and Leuconostocaceae

Auteurs: Jinshui Zheng, Stijn Wittouck, Elisa Salvetti, Charles M.A.P. Franz​, Hugh M.B. Harris, Paola Mattarelli, Paul W. O’Toole, Bruno Pot​, Peter Vandamme, Jens Walter​, Koichi Watanabe​, Sander Wuyts, Giovanna E. Felis, Michael G. Gänzle, Sarah Lebeer
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology., Numéro 14665026, 2020, Page(s) 2782-2858, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.004107

The inner elbow skin microbiome contains <i>Lactobacillus</i> among its core taxa and varies with age, season and lifestyle

Auteurs: Lize Delanghe, Ilke De Boeck, Joke Van Malderen, Thies Gehrmann, Camille Nina Allonsius, Peter A. Bron, Ingmar Claes, Margo Hagendorens, Julie Leysen, Stijn Wittouck, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbiome Research Reports, Numéro 3, 2024, Page(s) 43, ISSN 2771-5965
Éditeur: OAE Publishing Inc
DOI: 10.20517/mrr.2024.23

A citizen-science-enabled catalogue of the vaginal microbiome and associated factors

Auteurs: Sarah Lebeer, Sarah Ahannach, Thies Gehrmann, Stijn Wittouck, Tom Eilers, Eline Oerlemans, Sandra Condori, Jelle Dillen, Irina Spacova, Leonore Vander Donck, Caroline Masquillier, Camille Nina Allonsius, Peter A. Bron, Wannes Van Beeck, Charlotte De Backer, Gilbert Donders, Veronique Verhoeven
Publié dans: Nature Microbiology, Numéro 8, 2023, Page(s) 2183-2195, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature publishing group
DOI: 10.1038/s41564-023-01500-0

Bacterial Succession and Community Dynamics of the Emerging Leaf Phyllosphere in Spring

Auteurs: Wenke Smets, Lucia Maria Spada, Isabella Gandolfi, Karen Wuyts, Marie Legein, Babette Muyshondt, Roeland Samson, Andrea Franzetti, Sarah Lebeer
Publié dans: Microbiology Spectrum, Numéro 10, 2024, Page(s) Volume 10 • Number 2, ISSN 2165-0497
Éditeur: ASM Journals
DOI: 10.1128/spectrum.02420-21

Modes of Action of Microbial Biocontrol in the Phyllosphere

Auteurs: Marie Legein, Wenke Smets, Dieter Vandenheuvel, Tom Eilers, Babette Muyshondt, Els Prinsen, Roeland Samson and Sarah Lebeer
Publié dans: Frontiers in Microbiology, Numéro 1664302X, 2020, Page(s) 1619, ISSN 1664-302X
Éditeur: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fmicb.2020.01619

Positioning the preventive potential of microbiome treatments for cystic fibrosis in the context of current therapies

Auteurs: Eline Cauwenberghs, Ilke De Boeck, Irina Spacova, Ilke Van Tente, Joke Bastiaenssen, Elise Lammertyn, Stijn Verhulst, Kim Van Hoorenbeeck, Sarah Lebeer
Publié dans: Cell Reports Medicine, Numéro 5, 2024, Page(s) 101371, ISSN 2666-3791
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.xcrm.2023.101371

MIBiG 4.0: advancing biosynthetic gene cluster curation through global collaboration

Auteurs: Mitja M Zdouc, Kai Blin, Nico L L Louwen, Jorge Navarro, Catarina Loureiro, Chantal D Bader, Constance B Bailey, Lena Barra, Thomas J Booth, Kenan A J Bozhüyük, José D D Cediel-Becerra, Zachary Charlop-Powers, Marc G Chevrette, Yit Heng Chooi, Paul M D’Agostino, Tristan de Rond, Elena Del Pup, Katherine R Duncan, Wenjia Gu, Novriyandi Hanif, Eric J N Helfrich, Matthew Jenner, Yoh
Publié dans: Nucleic Acids Research, Numéro 53, 2025, Page(s) D678-D690, ISSN 0305-1048
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1115

Citizen science as an instrument for women’s health research

Auteurs: Sarah Ahannach, Ine Van Hoyweghen, Veronique Verhoeven, Sarah Lebeer
Publié dans: Nature Medicine, Numéro 30, 2024, Page(s) 3445-3454, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-024-03371-2

Antibacterial and Immunostimulatory Activity of Potential Probiotic Lactic Acid Bacteria Isolated from Ethiopian Fermented Dairy Products

Auteurs: Seyoum Gizachew, Wannes Van Beeck, Irina Spacova, Max Dekeukeleire, Ashenafi Alemu, Wude Mihret Woldemedhin, Solomon H. Mariam, Sarah Lebeer, Ephrem Engidawork
Publié dans: Fermentation, Numéro 9, 2023, Page(s) 258, ISSN 2311-5637
Éditeur: MDPI
DOI: 10.3390/fermentation9030258

Editorial 14th international symposium on lactic acid bacteria (LAB14)

Auteurs: Eddy J Smid, Sarah Lebeer, Egon B Hansen
Publié dans: FEMS Microbiology Reviews, Numéro 47, 2023, ISSN 1574-6976
Éditeur: Oxford University Publishing
DOI: 10.1093/femsre/fuad043

Lactiplantibacillus carotarum AMBF275T sp. nov. isolated from carrot juice fermentation

Auteurs: Tom Eilers, Jelle Dillen, Nele Van de Vliet, Stijn Wittouck, Sarah Lebeer
Publié dans: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Numéro 73, 2023, ISSN 1466-5026
Éditeur: Society for General Microbiology
DOI: 10.1099/ijsem.0.005976

SCARAP: scalable cross-species comparative genomics of prokaryotes

Auteurs: Stijn Wittouck, Tom Eilers, Vera van Noort, Sarah Lebeer
Publié dans: Bioinformatics, Numéro 41, 2024, ISSN 1367-4811
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/bioinformatics/btae735

After the storm—Perspectives on the taxonomy of Lactobacillaceae

Auteurs: Nanzhen Qiao, Stijn Wittouck, Paola Matterelli, Jinshui Zheng, Sarah Lebeer, Giovanna E. Felis, Michael G. Gänzle
Publié dans: JDS Communications, Numéro 26669102, 2022, Page(s) 222-227, ISSN 2666-9102
Éditeur: JDS Communications
DOI: 10.3168/jdsc.2021-0183

Diversity in women and their vaginal microbiota

Auteurs: Sandra Condori-Catachura, Sarah Ahannach, Monica Ticlla, Josiane Kenfack, Esemu Livo, Kingsley C. Anukam, Viviana Pinedo-Cancino, Maria Carmen Collado, Maria Gloria Dominguez-Bello, Corrie Miller, Gabriel Vinderola, Sonja Merten, Gilbert G.G. Donders, Thies Gehrmann, Sarah Lebeer
Publié dans: Trends in Microbiology, 2025, ISSN 0966-842X
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tim.2024.12.012

Droits de propriété intellectuelle

Trademark (2)

Isala trademark registration of device mark

Numéro de demande/publication: 14 56355
Date: 2021-12-22
Demandeur(s): UNIVERSITEIT ANTWERPEN

Isala trademark registration of device mark

Numéro de demande/publication: 14 56355
Date: 2021-12-22
Demandeur(s): UNIVERSITEIT ANTWERPEN