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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Bottom up biophysics approach to resolve the looping structure of chromosomes

Description du projet

Interconnexion de la structure et de la fonction spatiales des chromosomes

La structure spatiale du génome est essentielle à sa fonction biologique. Le projet LoopingDNA, financé par l’UE, a pour objectif de comprendre l’interconnexion fondamentale de la structure et de la fonction spatiales des chromosomes en utilisant une approche biophysique. La recherche sera axée sur les complexes de protéines de maintenance structurelle des chromosomes (SMC), des protéines en forme d’anneau qui produisent de grandes boucles d’ADN supposées constituer la base de la structure des chromosomes. Les expérimentations permettront d’apporter des réponses aux questions ouvertes sur la manière dont les SMC gèrent les fibres chromosomiques naturelles chargées en protéines de liaison à l’ADN et régulent l’expression génétique. Les chercheurs viseront même à fabriquer un chromosome selon une démarche ascendante, au moyen d’une approche de «génome dans une boîte», où l’ADN nu de longueur génomique est ajouté aux complexes de protéines SMC ainsi qu’à d’autres protéines de traitement de l’ADN. Cette approche ascendante unique pourrait permettre de générer une toute nouvelle compréhension sur les forces physiques et les systèmes protéiques qui façonnent les chromosomes.

Objectif

How is DNA spatially organized in our cells? What are the mechanisms that shape chromosomes and how does their 3D architecture direct their function? Recent years have shown that the spatial structure of the genome is of pivotal importance for its biological function. Yet, the basic physics of the formation and regulation of its 3D structure has remained unclear. This proposal aims to understand the fundamental structure of chromosomes using a bottom up biophysics approach, from looping at the single-molecule level to higher levels of complexity. We focus on so-called SMC protein complexes (SMC = Structural Maintenance of Chromosomes). These ring-shaped proteins are a unique new type of molecular motors that can extrude large loops of DNA that are thought to be the basis of chromosome structure. Our groups recent breakthrough discovery of the looping motor function of condensin SMC paved the way to now answer major open questions, such as the motor mechanism of SMCs; how SMCs handle realistic chromosomal fibers loaded with DNA-binding proteins; how looping relates to gene expression; and whether it is evolutionary conserved from bacteria to man. By answering these questions using single-molecule assays, we will resolve the basic mechanics of the SMC-induced looping of DNA. We will extend this to even build a chromosome from the bottom up, in a genome-in-a-box approach where we will take genome-length bare DNA and add SMC protein complexes and other DNA-processing proteins. Such a well-controlled bottom-up approach which to our knowledge is unique can be expected to generate a radically new understanding of the physical forces and protein systems that shape chromosomes. We are confident that our powerful single-molecule biophysics tools, in collaboration with working with the worlds best biochemists, will enable to disentangle the fundamental looping architecture of chromosomes that is so essential to all of life.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

ERC-ADG - Advanced Grant

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2019-ADG

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Institution d’accueil

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 2 500 000,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 2 500 000,00

Bénéficiaires (1)

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