Long-range electrodynamic INteractions between proteinS

Informazioni relative al progetto

LINkS

ID dell’accordo di sovvenzione: 964203

DOI

10.3030/964203

Progetto chiuso

Data della firma CE 1 Febbraio 2021

Data di avvio 1 Settembre 2021

Data di completamento 28 Febbraio 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Costo totale

€ 3 090 575,00

Contributo UE

€ 3 090 575,00

Coordinato da

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Documents, reports (10)

First set of model proteins delivered

Leader: CNRSc

LINkS intranet

Leader: CNRSa - Public report describing the LINkS intranet (password-protected area for internal use).

Report on design and fabrication of model proteins

Leader: CNRSc

Technology roadmap

Leader: CNRSb

Report on polymer characterization

Leader: CNRSb

Public report on LEDIs investigations

Leader: CNRSa

Impact of dissemination, communication & exploitation activities

Leader: CNRSa

Report on physical parameters for LEDIs activation

Leader: UGOT

Plan for communication

Leader: CNRSa

Public report on THz spectroscopy of model protein

Leader: CNRSa

Other (1)

International Summer School

Leader: CNRSa

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Leader: CNRSa

Websites, patent fillings, videos etc. (1)

Website and logo

Leader: CNRSa

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (6)

Electrodynamic forces driving DNA-protein interactions at large biomolecular distances

Autori: Elham Faraji, Philip Kurian, Roberto Franzosi, Stefano Mancini, Irena Cosic, Drasko Cosic, Giulio Pettini, Marco Pettini
Pubblicato in: Frontier of Physics, Numero Dec 2025, Volume 20 Numero 6, 2025, ISSN 2095-0470
Editore: HEP journals
DOI: 10.5281/zenodo.10593121

Hamiltonian model for energy condensation in classical systems: Relevance to proteins

Autori: Jordane Preto, Vania Calandrini, Elena Floriani, Gergely Katona, Marco Pettini
Pubblicato in: Physical Review Research, Numero 8, 2026, ISSN 2643-1564
Editore: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/7y7r-hf97

Deciphering peptide-protein interactions via composition-based prediction: a case study with survivin/BIRC5

Autori: Atsarina Larasati Anindya, Torbjörn Nur Olsson, Maja Jensen, Maria-Jose Garcia-Bonete, Sally P Wheatley, Maria I Bokarewa, Stefano A Mezzasalma, Gergely Katona
Pubblicato in: Machine Learning: Science and Technology, Numero 5, 2024, Pagina/e 025081, ISSN 2632-2153
Editore: IOP Publishing
DOI: 10.1088/2632-2153/ad5784

Survivin prevents the polycomb repressor complex 2 from methylating histone 3 lysine 27

Autori: Jensen, M., Chandrasekaran, V., Garcia-Bonete, M.-J., Li, S., Anindya, A. L., Andersson, K. M. E., Erlandsson, M.C., Oparina, N. Y., Burmann, B. M., Brath, U., Panchenko, A. R., Bokarewa I., M. & Katona, G.
Pubblicato in: iScience, Numero Volume 26, ISSUE 7, 2023, Pagina/e 106976, ISSN 2589-0042
Editore: Cell Press Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.isci.2023.106976

Experimental evidence for long-distance electrodynamic intermolecular forces

Autori: Mathias Lechelon, Yoann Meriguet, Matteo Gori, Sandra Ruffenach, Ilaria Nardecchia, Elena Floriani, Dominique Coquillat, Frédéric Teppe, Sébastien Mailfert, Didier Marguet, Pierre Ferrier, Luca Varani, James Sturgis, Jeremie Torres, Marco Pettini
Pubblicato in: Science Advances, Numero vol.8, n°7, 2022, ISSN 2375-2548
Editore: AAAS
DOI: 10.1126/sciadv.abl5855

Unveiling long-range forces in light-harvesting proteins: Pivotal roles of temperature and light

Autori: Elsa Perez-Martin, Tristan Beranger, Laurent Bonnet, Frederic Teppe, Alvydas Lisauskas, Kestutis Ikamas, Elwin Vrouwe, Elena Floriani, Gergely Katona, Didier Marguet, Vania Calandrini, Marco Pettini, Sandra Ruffenach, Jeremie Torres
Pubblicato in: Science Advances, Numero 11, 2025, ISSN 2375-2548
Editore: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/sciadv.adv0346

Conference proceedings (1)

Temperature-dependent low-frequency vibrational spectra of sodium magnesium chlorophyllin

Autori: Coquillat, Dominique; Bray, Cédric; O'Connor, Emma; Brouillet, Etienne; Meriguet, Yoann; Consejo, Christophe; Ruffenach, Sandra; Nelson, David; Faulds, Karen; Teppe, Frederic; Torres, Jeremie; Dyakonova, Nina
Pubblicato in: 2022 47TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON INFRARED, MILLIMETER AND TERAHERTZ WAVES (IRMMW-THZ 2022), Numero 3, 2022, ISBN 978-1-7281-9428-8
Editore: IEEEXplore
DOI: 10.1109/irmmw-thz50927.2022.9895499

Non-peer reviewed articles (1)

Deciphering Peptide-Protein Interactions via Composition-Based Prediction: A Case Study with Survivin/BIRC5

Autori: Atsarina Larasati Anindya, Torbjörn Nur Olsson, Maja Jensen, Maria-Jose Garcia-Bonete, Sally P. Wheatley, VMaria Bokarewa, Stefano A. Mezzasalma, Gergely Katona
Pubblicato in: Machine Learning: Science and Technology, Volume 5, Number 2, 2024, ISSN 2632-2153
Editore: IOP Science
DOI: 10.1101/2024.02.12.579763

Diritti di proprietà intellettuale

Patent (1)

METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING PEPTIDE FITNESS

Numero candidatura/pubblicazione: 20 23050351
Data: 2023-04-18
Candidato/i: GOETEBORGS UNIVERSITET