Biocatalytic upgrading of natural biopolymers for reassembly as multipurpose materials

Projektinformationen

BioUPGRADE

ID Finanzhilfevereinbarung: 964764

DOI

10.3030/964764

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 19 Januar 2021

Startdatum 1 Mai 2021

Enddatum 31 Oktober 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Gesamtkosten

€ 2 992 140,00

EU-Beitrag

€ 2 992 140,00

Koordiniert durch

AALTO KORKEAKOULUSAATIO SR
Finland

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (17)

Unraveling the unique structural motifs of glucuronoxylan from hybrid aspen wood

Autoren: Pramod Sivan, Emilia Heinonen, Louis Escudero, Madhavi Latha Gandla, Amparo Jiménez-Quero, Leif J. Jönsson, Ewa J. Mellerowicz, Francisco Vilaplana
Veröffentlicht in: Carbohydrate Polymers, Ausgabe 343, 2024, Seite(n) 122434, ISSN 0144-8617
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.carbpol.2024.122434

Comparative assessment of chemical and biochemical approaches for the activation of lignocellulosic materials and emerging opportunities for expansin-related proteins

Autoren: Salla Hiltunen, Janak Sapkota, Eleni Ioannou, Majid Haddad Momeni, Emma Master, Matti Ristolainen
Veröffentlicht in: Cellulose, Ausgabe 31, 2024, Seite(n) 147-168, ISSN 0969-0239
Herausgeber: Blackie Academic & Professional
DOI: 10.1007/s10570-023-05637-3

Enzymatic Routes to Designer Hemicelluloses for Use in Biobased Materials

Autoren: Thu V. Vuong, Mohammad Aghajohari, Xuebin Feng, Amanda K. Woodstock, Deepti M. Nambiar, Zeina C. Sleiman, Breeanna R. Urbanowicz, Emma R. Master
Veröffentlicht in: JACS Au, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 4044-4065, ISSN 2691-3704
Herausgeber: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/jacsau.4c00469

Carbohydrate-binding domain CBM63 of microbial expansin-like BsEXLX1 facilitates the adsorption of expansin-related proteins to hemicelluloses in plant secondary cell walls

Autoren: Pramod Sivan, Deepika Dahiya, Ylenia Jabalera, Taru Koitto, Raul Perez-Jimenez, Ewa J. Mellerowicz, Emma Master, Francisco Vilaplana
Veröffentlicht in: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Ausgabe 18, 2025, ISSN 2731-3654
Herausgeber: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-025-02674-x

Insights into the action of phylogenetically diverse microbial expansins on the structure of cellulose microfibrils

Autoren: Majid Haddad Momeni, Aleksi Zitting, Vilma Jäämuru, Rosaliina Turunen, Paavo Penttilä, Garry W. Buchko, Salla Hiltunen, Natalia Maiorova, Anu Koivula, Janak Sapkota, Kaisa Marjamaa, Emma R. Master
Veröffentlicht in: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Ausgabe 17, 2024, ISSN 2731-3654
Herausgeber: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-024-02500-w

A resurrected ancestor of Cas12a expands target access and substrate recognition for nucleic acid editing and detection

Autoren: Ylenia Jabalera, Igor Tascón, Sara Samperio, Jorge P. López-Alonso, Monika Gonzalez-Lopez, Ana M. Aransay, Guillermo Abascal-Palacios, Chase L. Beisel, Iban Ubarretxena-Belandia, Raul Perez-Jimenez
Veröffentlicht in: Nature Biotechnology, Ausgabe 43, 2025, Seite(n) 1663-1672, ISSN 1087-0156
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02461-3

Enzymatic upgrading of nanochitin using an ancient lytic polysaccharide monooxygenase

Autoren: Leire Barandiaran, Borja Alonso-Lerma, Antonio Reifs, Izaskun Larraza, Raquel Olmos-Juste, Alba Fernandez-Calvo, Ylenia Jabalera, Arantxa Eceiza, Raul Perez-Jimenez
Veröffentlicht in: Communications Materials, Ausgabe 3, 2022, ISSN 2662-4443
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s43246-022-00277-9

Sustainable Cellulose‐Based Coatings and Their Impact on Mechanical and Barrier Properties of Paper

Autoren: Salla Hiltunen, Wilma Heinola, Janak Sapkota
Veröffentlicht in: Macromolecular Materials and Engineering, Ausgabe 310, 2025, ISSN 1438-7492
Herausgeber: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/mame.202500184

Fungal loosenin-like proteins boost the cellulolytic enzyme conversion of pretreated wood fiber and cellulosic pulps

Autoren: Deepika Dahiya, Taru Koitto, Kim Kutvonen, Yan Wang, Majid Haddad Momeni, Siiri de Ruijter, Emma R. Master
Veröffentlicht in: Bioresource Technology, Ausgabe 394, 2025, Seite(n) 130188, ISSN 0960-8524
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2023.130188

Sequential extraction of hemicelluloses by subcritical water improves saccharification of hybrid aspen wood grown in greenhouse and field conditions

Autoren: Pramod Sivan, Emilia Heinonen, Madhavi Latha Gandla, Amparo Jiménez-Quero, Hüsamettin Deniz Özeren, Leif J. Jönsson, Ewa J. Mellerowicz, Francisco Vilaplana
Veröffentlicht in: Green Chemistry, Ausgabe 14/25, 2023, Seite(n) 5634-5646, ISSN 1757-7039
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3gc01020a

Uncovering Sequence and Structural Characteristics of Fungal Expansin‐Related Proteins With Potential to Drive Substrate Targeting

Autoren: Anna Pohto, Taru Koitto, Deepika Dahiya, Alessandra Castro, Elizaveta Sidorova, Martina Huusela, Scott E. Baker, Adrian Tsang, Emma Master
Veröffentlicht in: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Herausgeber: Wiley-Liss Inc
DOI: 10.1002/prot.70029

SANS investigation of fungal loosenins reveals substrate-dependent impacts of protein action on the inter-microfibril arrangement of cellulosic substrates

Autoren: Deepika Dahiya, Zsuzsanna Péter-Szabó, Manjula Senanayake, Sai Venkatesh Pingali, Wellington C. Leite, James Byrnes, Garry W. Buchko, Pramod Sivan, Francisco Vilaplana, Emma R. Master, Hugh O’Neill
Veröffentlicht in: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Ausgabe 18, 2025, ISSN 2731-3654
Herausgeber: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-025-02618-5

Effects of sequential ball milling and loosenin-like protein treatment on pulp fibers

Autoren: Salla Hiltunen, Deepika Dahiya, Martina Huusela, Emma Master, Matti Ristolainen, Janak Sapkota
Veröffentlicht in: Industrial Crops and Products, Ausgabe 237, 2025, Seite(n) 122177, ISSN 0926-6690
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.indcrop.2025.122177

Compliant mechanical response of the ultrafast folding protein EnHD under force

Autoren: Antonio Reifs, Irene Ruiz Ortiz, Amaia Ochandorena Saa, Jörg Schönfelder, David De Sancho, Victor Muñoz, Raul Perez-Jimenez
Veröffentlicht in: Communications Physics, Ausgabe 6, 2023, ISSN 2399-3650
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42005-022-01125-5

Evolution of CRISPR-associated endonucleases as inferred from resurrected proteins

Autoren: Borja Alonso-Lerma, Ylenia Jabalera, Sara Samperio, Matias Morin, Almudena Fernandez, Logan T. Hille, Rachel A. Silverstein, Ane Quesada-Ganuza, Antonio Reifs, Sergio Fernández-Peñalver, Yolanda Benitez, Lucia Soletto, Jose A. Gavira, Adrian Diaz, Wim Vranken, Avencia Sanchez-Mejias, Marc Güell, Francisco J. M. Mojica, Benjamin P. Kleinstiver, Miguel A. Moreno-Pelayo, Lluis Montoliu, Raul Perez
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, Ausgabe 8/1, 2023, Seite(n) 77–90, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-022-01265-y

Loosenin-Like Proteins from Phanerochaete carnosa Impact Both Cellulose and Chitin Fiber Networks

Autoren: Mareike Monschein, Eleni Ioannou, Taru Koitto, Leamon A. K. M. Al Amin, Jutta J. Varis, Edward R. Wagner, Kirsi S. Mikkonen, Daniel J. Cosgrove, Emma R. Master
Veröffentlicht in: Applied and Environmental Microbiology, Ausgabe 89/1, 2023, ISSN 0099-2240
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.01863-22

Phylogenetically distinct fungal expansins show different binding preferences towards cellulosic materials and enhance cellulase activity

Autoren: Taru Koitto, Deepika Dahiya, Martina Huusela, Merja Penttilä, Emma Master
Veröffentlicht in: Current Research in Biotechnology, Ausgabe 9, 2025, Seite(n) 100296, ISSN 2590-2628
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.crbiot.2025.100296

Other (1)

BioUPGRADE: Advancing biocatalysts to enrich the global bioeconomy

Autoren: Emma R. Master, Raul Perez Jimenez, Francisco Vilaplana, Janak Sapkota, Salla Hiltunen
Veröffentlicht in: The Innovation Platform, Ausgabe Ausgabe 15, 2023, Seite(n) 274-275, ISSN 2634-0208
Herausgeber: Innovation News Network

Conference proceedings (1)

Microbial Expansin Related Proteins for Improved Enzymatic Action for Conversion of Lignocellulose to Platform Sugars

Autoren: Deepika Dahiya, Siiri de Ruijter, Kim Kutvonen, Emma Master, Amy Yan Wang
Veröffentlicht in: NWBC 2022: The 10th Nordic Wood Biorefinery Conference, 2022, Seite(n) 220-221, ISBN 978-951-38-8772-8
Herausgeber: VTT Technical Research Centre of Finland
DOI: 10.32040/2242-122x.2022.t409

Rechte des geistigen Eigentums

Patent (4)

METHOD FOR THE PRODUCTION OF A CONDUCTIVE GRAPHENE-BASED INK AND PRODUCT THEREOF

Antrags-/Publikationsnummer: 22 382482
Datum: 2022-05-19
Antragsteller: ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE

METHOD FOR PRODUCING CRYSTALLINE NANOCELLULOSE

Antrags-/Publikationsnummer: 21 707689
Datum: 2021-02-26
Antragsteller: ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE

SYNTHETIC CAS PROTEINS

Antrags-/Publikationsnummer: 20 24076114
Datum: 2024-09-18
Antragsteller: ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN BIOCIENCIAS

USE OF LYTIC POLYSACCHARIDE MONOOXYGENASES, ENZYMATIC COMPOSITION CONTAINING SAME, AND DEGRADATION METHOD FOR PLASTIC POLYMERS

Antrags-/Publikationsnummer: 21 807602
Datum: 2021-05-17
Antragsteller: ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE