EBRAINS 2.0: A Research Infrastructure to Advance Neuroscience and Brain Health

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

D3.6 Co-design strategy for WP3

Report on the strategy that WP3 will follow to perform co-design activities with other partners in the project and external stakeholders.

D6.5 Co-design strategy for WP6

Report on the strategy that WP6 will follow to perform co-design activities with other partners in the project and external stakeholders.

D1.6 Co-design strategy for WP1

Report on the strategy that WP1 will follow to perform co-design activities with other partners in the project and external stakeholders.

D8.9 Plans and processes for the governance of the Project

Summary document describing plans and processes for the governance of the Project ready

D2.4 Strategy for 5M connectome data acquisition

Report on the strategy to follow during the multi-site acquisition of the 5M connectome dataset

D4.4 Co-design strategy for WP4

Report on the strategy that WP4 will follow to perform co-design activities with other partners in the project and external stakeholders.

D5.5 Co-design strategy for WP5

Report on the strategy that WP5 will follow to perform co-design activities with other partners in the project and external stakeholders.

D2.5 Co-design strategy for WP2

Develop a co-design activity in which members of the EAN will be polled about their competence and interest on new connectomics methods to study clinical conditions.

Veröffentlichungen

Metadata practices for simulation workflows

Autoren: José Villamar, Matthias Kelbling, Heather L. More, Michael Denker, Tom Tetzlaff, Johanna Senk, Stephan Thober
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 12, 2025, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-025-05126-1

Evidence for an Evolutionary Continuity in Social Dominance: Insights from Nonhuman Primate Tractography

Autoren: Julie Royo, Thomas Orset, Marco Catani, Pierre Pouget, Michel Thiebaut de Schotten
Veröffentlicht in: The Journal of Neuroscience, Ausgabe 45, 2025, ISSN 0270-6474
Herausgeber: Society for Neuroscience
DOI: 10.1523/JNEUROSCI.1646-24.2025

Modeling nitric oxide diffusion and plasticity modulation in cerebellar learning

Autoren: Alessandra Maria Trapani, Carlo Andrea Sartori, Benedetta Gambosi, Alessandra Pedrocchi, Alberto Antonietti
Veröffentlicht in: APL Bioengineering, Ausgabe 9, 2025, ISSN 2473-2877
Herausgeber: AIP Publishing
DOI: 10.1063/5.0250953

An extended and improved CCFv3 annotation and Nissl atlas of the entire mouse brain

Autoren: Sébastien Piluso; Csaba Verasztó; Harry Carey; Émilie Delattre; Thibaud L’Yvonnet; Éloïse Colnot; Armando Romani; Jan G. Bjaalie; Henry Markram; Daniel Keller
Veröffentlicht in: Imaging Neuroscience, 2025, ISSN 2837-6056
Herausgeber: MIT Press Direct
DOI: 10.1101/2024.11.06.622212

Neurobiology of Disease

Autoren: Lorenzo Pini; Giuseppe Lombardi; Giulio Sansone; Matteo Gaiola; Marta Padovan; Francesco Volpin; Luca Denaro; Maurizio Corbetta; Alessandro Salvalaggio
Veröffentlicht in: Neurobiology of Disease, 2024, ISSN 0969-9961
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/J.NBD.2024.106521

Lu.i – A low-cost electronic neuron for education and outreach

Autoren: Yannik Stradmann, Julian Göltz, Mihai A. Petrovici, Johannes Schemmel, Sebastian Billaudelle
Veröffentlicht in: Trends in Neuroscience and Education, Ausgabe 38, 2025, ISSN 2211-9493
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.TINE.2025.100248

Frontiers in Neuroanatomy

Autoren: Ivan Velasco; Juan J. Garcia-Cantero; Juan J. Garcia-Cantero; Juan P. Brito; Juan P. Brito; Sofia Bayona; Sofia Bayona; Luis Pastor; Luis Pastor; Susana Mata; Susana Mata
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroanatomy, 2024, ISSN 1662-5129
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/FNANA.2024.1342762

Frontiers in Computational Neuroscience

Autoren: Astrid Correa; Adam Ponzi; Adam Ponzi; Vladimir M. Calderón; Rosanna Migliore
Veröffentlicht in: Frontiers in Computational Neuroscience, 2024, ISSN 1662-5188
Herausgeber: Frontiers Research Foundation
DOI: 10.3389/FNCOM.2024.1410335

Scientific Reports

Autoren: Rocha R. P.; Zorzi M.; Corbetta M.
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41598-024-80196-6

Nature Communications

Autoren: Pedro Nascimento Alves; Victor Nozais; Justine Y. Hansen; Maurizio Corbetta; Parashkev Nachev; Isabel Pavão Martins; Michel Thiebaut de Schotten
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.21203/RS.3.RS-3937453/V1

Mathematical Biosciences

Autoren: A. Marasco; C. Tribuzi; A. Iuorio; M. Migliore
Veröffentlicht in: Mathematical Biosciences, 2023, ISSN 0025-5564
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1101/2023.04.03.535350

Navigating Conflicting Interests: The Role of Gender Competent Management for Effective Gender Equality Plans

Autoren: Angela Wroblewski, Karin Grasenick
Veröffentlicht in: Social Inclusion, Ausgabe 13, 2025, ISSN 2183-2803
Herausgeber: Cogitatio
DOI: 10.17645/SI.9992

Multimodal gradients unify local and global cortical organization

Autoren: Yezhou Wang, Nicole Eichert, Casey Paquola, Raul Rodriguez-Cruces, Jordan DeKraker, Jessica Royer, Donna Gift Cabalo, Hans Auer, Alexander Ngo, Ilana R. Leppert, Christine L. Tardif, David A. Rudko, Robert Leech, Katrin Amunts, Sofie L. Valk, Jonathan Smallwood, Alan C. Evans, Boris C. Bernhardt
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41467-025-59177-4

Modeling impairment of ionic regulation with extended Adaptive Exponential integrate-and-fire models

Autoren: Damien Depannemaecker, Federico Tesler, Mathieu Desroches, Viktor Jirsa, Alain Destexhe
Veröffentlicht in: Journal of Computational Neuroscience, Ausgabe 53, 2025, ISSN 0929-5313
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S10827-025-00893-7

New organizational principles and 3D cytoarchitectonic maps of the dorsolateral prefrontal cortex in the human brain

Autoren: Ariane Bruno, Kimberley Lothmann, Sebastian Bludau, Hartmut Mohlberg, Katrin Amunts
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroimaging, Ausgabe 3, 2024, ISSN 2813-1193
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FNIMG.2024.1339244

Synchronization in spiking neural networks with short and long connections and time delays

Autoren: Lionel Kusch, Martin Breyton, Damien Depannemaecker, Spase Petkoski, Viktor K. Jirsa
Veröffentlicht in: Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, Ausgabe 35, 2025, ISSN 1054-1500
Herausgeber: AIP Publishing
DOI: 10.1063/5.0158186

Principles and Operation of Virtual Brain Twins

Autoren: Meysam Hashemi, Damien Depannemaecker, Marisa Saggio, Paul Triebkorn, Giovanni Rabuffo, Jan Fousek, Abolfazl Ziaeemehr, Viktor Sip, Anastasios Athanasiadis, Martin Breyton, Marmaduke Woodman, Huifang Wang, Spase Petkoski, Pierpaolo Sorrentino, Viktor Jirsa
Veröffentlicht in: IEEE Reviews in Biomedical Engineering, 2025, ISSN 1937-3333
Herausgeber: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE)
DOI: 10.1109/RBME.2025.3562951

Linking cellular-level phenomena to brain architecture: the case of spiking cerebellar controllers

Autoren: Egidio D’Angelo, Alberto Antonietti, Alice Geminiani, Benedetta Gambosi, Cristiano Alessandro, Emiliano Buttarazzi, Alessandra Pedrocchi, Claudia Casellato
Veröffentlicht in: Neural Networks, Ausgabe 188, 2025, ISSN 0893-6080
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.NEUNET.2025.107538

The Locare workflow: representing neuroscience data locations as geometric objects in 3D brain atlases

Autoren: Camilla H. Blixhavn, Ingrid Reiten, Heidi Kleven, Martin Øvsthus, Sharon C. Yates, Ulrike Schlegel, Maja A. Puchades, Oliver Schmid, Jan G. Bjaalie, Ingvild E. Bjerke, Trygve B. Leergaard
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroinformatics, Ausgabe 18, 2024, ISSN 1662-5196
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FNINF.2024.1284107

Scientific Reports

Autoren: Rocha R. P.; Zorzi M.; Corbetta M.
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41598-024-80196-6

Identifying sources of bias when testing three available algorithms for quantifying white matter lesions: BIANCA, LPA and LGA

Autoren: Tatiana Miller, Nora Bittner, Susanne Moebus, Svenja Caspers
Veröffentlicht in: GeroScience, Ausgabe 47, 2024, ISSN 2509-2723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S11357-024-01306-W

Digital tools of analysis and data integration facilitate synergy between mouse and human brain research and enable translation

Autoren: Sabine M. Hölter, Lillian Garrett, Sebastian Bludau, Katrin Amunts
Veröffentlicht in: Mammalian Genome, Ausgabe 35, 2024, ISSN 0938-8990
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S00335-024-10072-1

Nature Communications

The developing mouse dopaminergic system: Cortical-subcortical shift in D1/D2 receptor balance and increasing regional differentiation

Autoren: Ingvild E. Bjerke, Harry Carey, Jan G. Bjaalie, Trygve B. Leergaard, Jee Hyun Kim
Veröffentlicht in: Neurochemistry International, Ausgabe 182, 2025, ISSN 0197-0186
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.NEUINT.2024.105899

Considerations and recommendations from the <scp>ISMRM</scp> diffusion study group for preclinical diffusion <scp>MRI</scp>: Part 1: In vivo small‐animal imaging

Autoren: Ileana O. Jelescu, Francesco Grussu, Andrada Ianus, Brian Hansen, Rachel L. C. Barrett, Manisha Aggarwal, Stijn Michielse, Fatima Nasrallah, Warda Syeda, Nian Wang, Jelle Veraart, Alard Roebroeck, Andrew F. Bagdasarian, Cornelius Eichner, Farshid Sepehrband, Jan Zimmermann, Lucas Soustelle, Christien Bowman, Benjamin C. Tendler, Andreea Hertanu, Ben Jeurissen, Marleen Verhoye, Lucio Frydman, Yohan van de Looij, David Hike, Jeff F. Dunn, Karla Miller, Bennett A. Landman, Noam Shemesh, Adam Anderson, Emilie McKinnon, Shawna Farquharson, Flavio Dell'Acqua, Carlo Pierpaoli, Ivana Drobnjak, Alexander Leemans, Kevin D. Harkins, Maxime Descoteaux, Duan Xu, Hao Huang, Mathieu D. Santin, Samuel C. Grant, Andre Obenaus, Gene S. Kim, Dan Wu, Denis Le Bihan, Stephen J. Blackband, Luisa Ciobanu, Els Fieremans, Ruiliang Bai, Trygve B. Leergaard, Jiangyang Zhang, Tim B. Dyrby, G. Allan Johnson, Julien Cohen‐Adad, Matthew D. Budde, Kurt G. Schilling
Veröffentlicht in: Magnetic Resonance in Medicine, Ausgabe 93, 2025, ISSN 0740-3194
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/MRM.30429

The coming decade of digital brain research: A vision for neuroscience at the intersection of technology and computing

Autoren: Katrin Amunts, Markus Axer, Swati Banerjee, Lise Bitsch, Jan G. Bjaalie, Philipp Brauner, Andrea Brovelli, Navona Calarco, Marcel Carrere, Svenja Caspers, Christine J. Charvet, Sven Cichon, Roshan Cools, Irene Costantini, Egidio Ugo D’Angelo, Giulia De Bonis, Gustavo Deco, Javier DeFelipe, Alain Destexhe, Timo Dickscheid, Markus Diesmann, Emrah Düzel, Simon B. Eickhoff, Gaute Einevoll, Damian Eke, Andreas K. Engel, Alan C. Evans, Kathinka Evers, Nataliia Fedorchenko, Stephanie J. Forkel, Jan Fousek, Angela D. Friederici, Karl Friston, Stephen Furber, Liesbet Geris, Rainer Goebel, Onur Güntürkün, Aini Ismafairus Abd Hamid, Christina Herold, Claus C. Hilgetag, Sabine M. Hölter, Yannis Ioannidis, Viktor Jirsa, Sriranga Kashyap, Burkhard S. Kasper, Alban de Kerchove d’Exaerde, Roxana Kooijmans, István Koren, Jeanette Hellgren Kotaleski, Gregory Kiar, Wouter Klijn, Lars Klüver, Alois C. Knoll, Zeljka Krsnik, Julia Kämpfer, Matthew E Larkum, Marja-Leena Linne, Thomas Lippert, Jafri Malin Abdullah, Paola Di Maio, Neville Magielse, Pierre Maquet, Anna Letizia Allegra Mascaro, Daniele Marinazzo, Jorge Mejias, Andreas Meyer-Lindenberg, Michele Migliore, Judith Michael, Yannick Morel, Fabrice O. Morin, Lars Muckli, Guy Nagels, Lena Oden, Nicola Palomero-Gallagher, Fanis Panagiotaropoulos, Pier Stanislao Paolucci, Cyriel Pennartz, Liesbet M. Peeters, Spase Petkoski, Nicolai Petkov, Lucy S. Petro, Mihai A. Petrovici, Giovanni Pezzulo, Pieter Roelfsema, Laurence Ris, Petra Ritter, Kathleen Rockland, Stefan Rotter, Andreas Rowald, Sabine Ruland, Philippe Ryvlin, Arleen Salles, Maria V. Sanchez-Vives, Johannes Schemmel, Walter Senn, Alexandra A. de Sousa, Felix Ströckens, Bertrand Thirion, Kâmil Uludağ, Simo Vanni, Sacha Jennifer van Albada, Wim Vanduffel, Julien Vezoli, Lisa Vincenz-Donnelly, Florian Walter, Laszlo Zaborszky
Veröffentlicht in: Imaging Neuroscience, Ausgabe 2, 2024, ISSN 2837-6056
Herausgeber: MIT Press
DOI: 10.1162/IMAG_A_00137

Nature Communications

Autoren: Pacella, Valentina; Nozais, Victor; Talozzi, Lia; Abdallah, Majd; Wassermann, Demian; Forkel, Stephanie; Thiebaut de Schotten, Michel
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/S41467-024-52186-9

Bifurcations and bursting in the Epileptor

Autoren: Maria Luisa Saggio, Viktor Jirsa
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 20, 2024, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PCBI.1011903

Time to bury the chisel: a continuous dorsal association tract system

Autoren: Hoven, Emiel van den; Reisert, Marco; Musso, Mariacristina; Glauche, Volkmar; Rijntjes, Michel; Weiller, Cornelius
Veröffentlicht in: Brain Structure and Function, 2024, ISSN 1863-2661
Herausgeber: Springer
DOI: 10.1007/S00429-024-02829-W

Frontiers in Computational Neuroscience

Modeling realistic synaptic inputs of CA1 hippocampal pyramidal neurons and interneurons via Adaptive Generalized Leaky Integrate-and-Fire models

Autoren: A. Marasco, C. Tribuzi, C.A. Lupascu, M. Migliore
Veröffentlicht in: Mathematical Biosciences, Ausgabe 372, 2024, ISSN 0025-5564
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MBS.2024.109192

Semaphorin-3A regulates liver sinusoidal endothelial cell porosity and promotes hepatic steatosis

Autoren: Daniel Eberhard, Sydney Balkenhol, Andrea Köster, Paula Follert, Eric Upschulte, Philipp Ostermann, Philip Kirschner, Celina Uhlemeyer, Iannis Charnay, Christina Preuss, Sandra Trenkamp, Bengt-Frederik Belgardt, Timo Dickscheid, Irene Esposito, Michael Roden, Eckhard Lammert
Veröffentlicht in: Nature Cardiovascular Research, Ausgabe 3, 2024, ISSN 2731-0590
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S44161-024-00487-Z

Comparison of basal ganglia regions across murine brain atlases using metadata models and the Waxholm Space

Autoren: H. Kleven, U. Schlegel, H. J. Groenewegen, T. B. Leergaard, I. E. Bjerke
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-024-03863-3

Inference on the Macroscopic Dynamics of Spiking Neurons

Autoren: Nina Baldy, Martin Breyton, Marmaduke M. Woodman, Viktor K. Jirsa, Meysam Hashemi
Veröffentlicht in: Neural Computation, 2024, ISSN 0899-7667
Herausgeber: MIT Press
DOI: 10.1162/NECO_A_01701

Nature Communications

Interdisciplinary and Collaborative Training in Neuroscience: Insights from the Human Brain Project Education Programme

Autoren: Alice Geminiani, Judith Kathrein, Alper Yegenoglu, Franziska Vogel, Marcelo Armendariz, Ziv Ben-Zion, Petrut Antoniu Bogdan, Joana Covelo, Marissa Diaz Pier, Karin Grasenick, Vitali Karasenko, Wouter Klijn, Tina Kokan, Carmen Alina Lupascu, Anna Lührs, Tara Mahfoud, Taylan Özden, Jens Egholm Pedersen, Luca Peres, Ingrid Reiten, Nikola Simidjievski, Inga Ulnicane, Michiel van der Vlag, Lyuba Zehl, Alois Saria, Sandra Diaz-Pier, Johannes Passecker
Veröffentlicht in: Neuroinformatics, Ausgabe 22, 2024, ISSN 1559-0089
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S12021-024-09682-6

White matter changes after Gamma Knife Capsulotomy in patients with intractable obsessive-compulsive disorder

Autoren: Giorgio Spatola, Paul Triebkorn, Raphaelle Richieri, Christelle Baunez, Jean Farisse, Axelle Cretol, Eric Guedj, Viktor Jirsa, Jean Regis
Veröffentlicht in: Heliyon, Ausgabe 10, 2024, ISSN 2405-8440
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.HELIYON.2024.E34699

Cerebellar control over inter-regional excitatory/inhibitory dynamics discriminates execution from observation of an action

Autoren: Roberta Maria Lorenzi; Gökçe Korkmaz; Adnan A.S. Alahmadi; Anita Monteverdi; Letizia Casiraghi; Egidio D’Angelo; Fulvia Palesi; Claudia A.M. Gandini Wheeler-Kingshott
Veröffentlicht in: The Cerebellum, 2025, ISSN 1473-4230
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1101/2024.05.21.595114

Self-supervised representation learning for nerve fiber distribution patterns in 3D-PLI

Autoren: Alexander Oberstrass, Sascha E.A. Muenzing, Meiqi Niu, Nicola Palomero-Gallagher, Christian Schiffer, Markus Axer, Katrin Amunts, Timo Dickscheid
Veröffentlicht in: Imaging Neuroscience, Ausgabe 2, 2024, ISSN 2837-6056
Herausgeber: MIT Press
DOI: 10.1162/IMAG_A_00351

A Model with Dopamine Depletion in Basal Ganglia and Cerebellum Predicts Changes in Thalamocortical Beta Oscillations

Autoren: Benedetta Gambosi, Francesco Jamal Sheiban, Marco Biasizzo, Alberto Antonietti, Egidio D’angelo, Alberto Mazzoni, Alessandra Pedrocchi
Veröffentlicht in: International Journal of Neural Systems, Ausgabe 34, 2024, ISSN 0129-0657
Herausgeber: World Scientific Pub Co Pte Ltd
DOI: 10.1142/S012906572450045X

Simulation-based inference on virtual brain models of disorders

Autoren: Meysam Hashemi, Abolfazl Ziaeemehr, Marmaduke M Woodman, Jan Fousek, Spase Petkoski, Viktor K Jirsa
Veröffentlicht in: Machine Learning: Science and Technology, Ausgabe 5, 2024, ISSN 2632-2153
Herausgeber: IOP Publishing
DOI: 10.1088/2632-2153/AD6230

Scalable network emulation on analog neuromorphic hardware

Autoren: Elias Arnold, Philipp Spilger, Jan V. Straub, Eric Müller, Dominik Dold, Gabriele Meoni, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 18, 2025, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FNINS.2024.1523331

Mesoscale simulations predict the role of synergistic cerebellar plasticity during classical eyeblink conditioning

Autoren: Alice Geminiani, Claudia Casellato, Henk-Jan Boele, Alessandra Pedrocchi, Chris I. De Zeeuw, Egidio D’Angelo
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 20, 2024, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PCBI.1011277

Cytoarchitectonic Analysis and 3D Maps of the Mesial Piriform Region in the Human Brain

Autoren: Olga Kedo, Sebastian Bludau, Christian Schiffer, Hartmut Mohlberg, Timo Dickscheid, Katrin Amunts
Veröffentlicht in: Anatomia, Ausgabe 3, 2024, ISSN 2813-0545
Herausgeber: MDPI AG
DOI: 10.3390/ANATOMIA3020007

Spatially integrated cortico-subcortical tracing data for analyses of rodent brain topographical organization

Autoren: Martin Øvsthus, Maaike M. H. van Swieten, Maja A. Puchades, Chiara Tocco, Michèle Studer, Jan G. Bjaalie, Trygve B. Leergaard
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41597-024-04060-Y

Association between night shift work and markers of metabolism, cardiovascular and immune system in a population-based German cohort

Autoren: Nora Bittner, Horst-Werner Korf, Susanne Moebus, Börge Schmidt, Svenja Caspers
Veröffentlicht in: GeroScience, Ausgabe 47, 2025, ISSN 2509-2723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S11357-025-01596-8

The impact of Parkinson’s disease on striatal network connectivity and cortico-striatal drive: an in-silico study

Autoren: Ilaria Carannante; Martina Scolamiero; J. J. Johannes Hjorth; Alexander Kozlov; Bo Bekkouche; Lihao Guo; Arvind Kumar; Wojciech Chachólski; Jeanette Hellgren Kotaleski
Veröffentlicht in: Network Neuroscience, 2024, ISSN 2472-1751
Herausgeber: MIT Press
DOI: 10.1162/NETN_A_00394

Reconciliation of weak pairwise spike–train correlations and highly coherent local field potentials across space

Autoren: Johanna Senk, Espen Hagen, Sacha J van Albada, Markus Diesmann
Veröffentlicht in: Cerebral Cortex, Ausgabe 34, 2024, ISSN 1047-3211
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/CERCOR/BHAE405

Prediction of Verbal Abilities From Brain Connectivity Data Across the Lifespan Using a Machine Learning Approach

Autoren: Deborah Früh, Camilla Mendl‐Heinisch, Nora Bittner, Susanne Weis, Svenja Caspers
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, Ausgabe 46, 2025, ISSN 1065-9471
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1002/HBM.70191

Region-specific mean field models enhance simulations of local and global brain dynamics

Autoren: Roberta Maria Lorenzi, Fulvia Palesi, Claudia Casellato, Claudia A. M. Gandini Wheeler-Kingshott, Egidio D’Angelo
Veröffentlicht in: npj Systems Biology and Applications, Ausgabe 11, 2025, ISSN 2056-7189
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41540-025-00543-9

Mathematical generation of data-driven hippocampal CA1 pyramidal neurons and interneurons copies via A-GLIF models for large-scale networks covering the experimental variability range

Autoren: A. Marasco, C. Tribuzi, A. Iuorio, M. Migliore
Veröffentlicht in: Mathematical Biosciences, Ausgabe 371, 2024, ISSN 0025-5564
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.MBS.2024.109179

Kinetics and functional consequences of BK channels activation by N-type Ca2+ channels in the dendrite of mouse neocortical layer-5 pyramidal neurons

Autoren: Laila Ananda Blömer, Elisabetta Giacalone, Fatima Abbas, Luiza Filipis, Domenico Tegolo, Michele Migliore, Marco Canepari
Veröffentlicht in: Frontiers in Cellular Neuroscience, Ausgabe 18, 2024, ISSN 1662-5102
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FNCEL.2024.1353895

MRI R2* captures inflammation in disconnected brain structures after stroke: a translational study

Autoren: Ismail Koubiyr, Takayuki Yamamoto, Laurent Petit, Nadège Dubourdieu, Elena Avignone, Elise Cozensa, Chloé Galmiche, Hikaru Fukutomi, Igor Sibon, Vincent Dousset, Michel Thiebaut de Schotten, Aude Panatier, Marion Tible, Thomas Tourdias
Veröffentlicht in: Brain, 2025, ISSN 0006-8950
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1101/2024.11.18.624105

Principles and Operation of Virtual Brain Twins

Bilingualism and “brain reserve” in subregions of the hippocampal formation

Autoren: Katharina Peitz, Nora Bittner, Stefan Heim, Svenja Caspers
Veröffentlicht in: GeroScience, Ausgabe 47, 2025, ISSN 2509-2723
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S11357-025-01639-0

The predictive nature of spontaneous brain activity across scales and species

Autoren: Anastasia Dimakou, Giovanni Pezzulo, Andrea Zangrossi, Maurizio Corbetta
Veröffentlicht in: Neuron, Ausgabe 113, 2025, ISSN 0896-6273
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.NEURON.2025.02.009

Multi-scale spiking network model of human cerebral cortex

Autoren: Jari Pronold, Alexander van Meegen, Renan O Shimoura, Hannah Vollenbröker, Mario Senden, Claus C Hilgetag, Rembrandt Bakker, Sacha J van Albada
Veröffentlicht in: Cerebral Cortex, Ausgabe 34, 2024, ISSN 1047-3211
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/CERCOR/BHAE409

Dynamic causal modelling in probabilistic programming languages

Autoren: Nina Baldy, Marmaduke Woodman, Viktor K. Jirsa, Meysam Hashemi
Veröffentlicht in: Journal of The Royal Society Interface, Ausgabe 22, 2025, ISSN 1742-5662
Herausgeber: The Royal Society
DOI: 10.1098/RSIF.2024.0880

Neurobiology of Disease

Effects of the spatial resolution of the Virtual Epileptic Patient on the identification of epileptogenic networks

Autoren: Jean-Didier Lemaréchal, Paul Triebkorn, Anirudh Nihalani Vattikonda, Meysam Hashemi, Marmaduke Woodman, Maxime Guye, Fabrice Bartolomei, Huifang E. Wang, Viktor Jirsa
Veröffentlicht in: Imaging Neuroscience, Ausgabe 2, 2024, ISSN 2837-6056
Herausgeber: MIT Press
DOI: 10.1162/IMAG_A_00153

Scientific Reports

Autoren: auf der Heiden, Franca; Axer, Markus; Amunts, Katrin; Menzel, Miriam
Veröffentlicht in: Scientific Reports, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.08499

The virtual multiple sclerosis patient

Autoren: P. Sorrentino, A. Pathak, A. Ziaeemehr, E. Troisi Lopez, L. Cipriano, A. Romano, M. Sparaco, M. Quarantelli, A. Banerjee, G. Sorrentino, V. Jirsa, M. Hashemi
Veröffentlicht in: iScience, Ausgabe 27, 2024, ISSN 2589-0042
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.ISCI.2024.110101

A map of mitochondrial biology reveals the energy landscape of the human brain

Veröffentlicht in: Nature, 2025, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/D41586-025-00872-Z

A layered microcircuit model of somatosensory cortex with three interneuron types and cell-type-specific short-term plasticity

Autoren: Han-Jia Jiang, Guanxiao Qi, Renato Duarte, Dirk Feldmeyer, Sacha J van Albada
Veröffentlicht in: Cerebral Cortex, Ausgabe 34, 2024, ISSN 1047-3211
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/CERCOR/BHAE378

Frontiers in Neuroanatomy

Parameter estimation in a whole-brain network model of epilepsy: Comparison of parallel global optimization solvers

Autoren: David R. Penas, Meysam Hashemi, Viktor K. Jirsa, Julio R. Banga
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 20, 2024, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PCBI.1011642

Symmetry breaking organizes the brain’s resting state manifold

Autoren: Jan Fousek, Giovanni Rabuffo, Kashyap Gudibanda, Hiba Sheheitli, Spase Petkoski, Viktor Jirsa
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 14, 2024, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-024-83542-W

eLife

Autoren: Zahra Khodadadi; Daniel Trpevski; Robert Lindroos; Jeanette Hellgren Kotaleski
Veröffentlicht in: eLife, 2024, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/ELIFE.97274.1

Closing the loop: High-speed robotics with accelerated neuromorphic hardware

Autoren: Yannik Stradmann, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: Frontiers in Neuroscience, Ausgabe 18, 2024, ISSN 1662-453X
Herausgeber: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/FNINS.2024.1360122

Simulating the impact of white matter connectivity on processing time scales using brain network models

Autoren: Paul Triebkorn, Viktor Jirsa, Peter Ford Dominey
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 8, 2025, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42003-025-07587-X

The Domains of Monotonicity Processing

Autoren: I-An Tan, Nir Segal, Yosef Grodzinsky
Veröffentlicht in: Journal of Semantics, Ausgabe 41, 2024, ISSN 0167-5133
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/JOS/FFAE003

On the validity of electric brain signal predictions based on population firing rates

Autoren: Torbjørn V. Ness, Tom Tetzlaff, Gaute T. Einevoll, David Dahmen
Veröffentlicht in: PLOS Computational Biology, Ausgabe 21, 2025, ISSN 1553-7358
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/JOURNAL.PCBI.1012303

Virtual brain twins: from basic neuroscience to clinical use

Autoren: Huifang E Wang, Paul Triebkorn, Martin Breyton, Borana Dollomaja, Jean-Didier Lemarechal, Spase Petkoski, Pierpaolo Sorrentino, Damien Depannemaecker, Meysam Hashemi, Viktor K Jirsa
Veröffentlicht in: National Science Review, Ausgabe 11, 2024, ISSN 2095-5138
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/NSR/NWAE079

Improving data sharing and knowledge transfer via the Neuroelectrophysiology Analysis Ontology (NEAO)

Autoren: Cristiano A. Köhler; Sonja Grün; Michael Denker
Veröffentlicht in: Scientific Data, 2025, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Cornell University
DOI: 10.48550/ARXIV.2412.05021

Assessing the Similarity of Real Matrices with Arbitrary Shape

Autoren: Jasper Albers, Anno C. Kurth, Robin Gutzen, Aitor Morales-Gregorio, Michael Denker, Sonja Grün, Sacha J. van Albada, Markus Diesmann
Veröffentlicht in: PRX Life, Ausgabe 3, 2025, ISSN 2835-8279
Herausgeber: American Physical Society (APS)
DOI: 10.1103/PRXLIFE.3.023005

The Virtual Parkinsonian patient

Autoren: Marianna Angiolelli, Damien Depannemaecker, Hasnae Agouram, Jean Régis, Romain Carron, Marmaduke Woodman, Letizia Chiodo, Paul Triebkorn, Abolfazl Ziaeemehr, Meysam Hashemi, Alexandre Eusebio, Viktor Jirsa, Pierpaolo Sorrentino
Veröffentlicht in: npj Systems Biology and Applications, Ausgabe 11, 2025, ISSN 2056-7189
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41540-025-00516-Y

Generative Modelling of Cortical Receptor Distributions from Cytoarchitectonic Images in the Macaque Brain

Autoren: Ahmed Nebli, Christian Schiffer, Meiqi Niu, Nicola Palomero-Gallagher, Katrin Amunts, Timo Dickscheid
Veröffentlicht in: Neuroinformatics, Ausgabe 22, 2024, ISSN 1559-0089
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/S12021-024-09673-7

Mapping brain lesions to conduction delays: the next step for personalized brain models in Multiple Sclerosis

Autoren: C. Mazzara; A. Ziaeemehr; E. Lopez Troisi; L. Cipriano; M. Angiolelli; M. Sparaco; M. Quarantelli; C. Granata; G. Sorrentino; M. Hashemi; V. Jirsa; P. Sorrentino
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, 2024, ISSN 1097-0193
Herausgeber: Wiley Periodicals LLC
DOI: 10.1002/HBM.70219

Scientific Reports

Demonstrating the Advantages of Analog Wafer-Scale Neuromorphic Hardware

Autoren: Hartmut Schmidt, Andreas Grübl, José Montes, Eric Müller, Sebastian Schmitt, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: 2025 Neuro Inspired Computational Elements (NICE), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/NICE65350.2025.11065060

jaxsnn: Event-driven Gradient Estimation for Analog Neuromorphic Hardware

Autoren: Eric Müller, Moritz Althaus, Elias Arnold, Philipp Spilger, Christian Pehle, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: 2024 Neuro Inspired Computational Elements Conference (NICE), 2024
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/NICE61972.2024.10548709

Short-reach Optical Communications: A Real-world Task for Neuromorphic Hardware

Autoren: Elias Arnold, Eike-Manuel Edelmann, Alexander von Bank, Eric Müller, Laurent Schmalen, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: 2025 Neuro Inspired Computational Elements (NICE), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/NICE65350.2025.11065780

Contrastive Learning of Cytoarchitecture using Spatial Information

Autoren: Boztoprak, Zeynep; Dickscheid, Timo; Amunts, Katrin; Schiffer, Christian
Veröffentlicht in: doi:10.34734/FZJ-2024-05541, 2024
DOI: 10.34734/FZJ-2024-05541

Analyzing Regional Organization of The Human Hippocampus in 3D-PLI Using Contrastive Learning and Geometric Unfolding

Autoren: Alexander Oberstrass, Jordan DeKraker, Nicola Palomero-Gallagher, Sascha E. A. Muenzing, Alan C. Evans, Markus Axer, Katrin Amunts, Timo Dickscheid
Veröffentlicht in: 2024 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), 2024
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/ISBI56570.2024.10635467

CytoNet: A Deep Neural Network for Whole-brain Characterization of Human Cytoarchitecture

Autoren: Schiffer, Christian; Boztoprak, Zeynep; Amunts, Katrin; Dickscheid, Timo
Veröffentlicht in: doi:10.34734/FZJ-2024-05546, 2024
DOI: 10.34734/FZJ-2024-05546

Integrating programmable plasticity in experiment descriptions for analog neuromorphic hardware

Autoren: Philipp Spilger, Eric Müller, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: 2025 Neuro Inspired Computational Elements (NICE), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/NICE65350.2025.11065886

3D reconstruction of BigBrain2: Progress report on semi-automated repairs of histological sections

Autoren: Lepage, Claude; Mohlberg, Hartmut; Lewis, Lindsay B.; Toussaint, Paule-J.; Wenzel, Susanne; Evans, Alan C.; Amunts, Katrin
Veröffentlicht in: doi:10.34734/FZJ-2024-05655, 2024
DOI: 10.34734/FZJ-2024-05655

Multi-timescale synaptic plasticity on analog neuromorphic hardware

Autoren: Amani Atoui, Jakob Kaiser, Sebastian Billaudelle, Philipp Spilger, Eric Müller, Jannik Luboeinski, Christian Tetzlaff, Johannes Schemmel
Veröffentlicht in: 2025 Neuro Inspired Computational Elements (NICE), 2025
Herausgeber: IEEE
DOI: 10.1109/NICE65350.2025.11065914

Automatic Characterization of Fiber Architecture in 3D-PLI Using Contrastive Learning

Autoren: Oberstraß, Alexander; Schiffer, Christian; Axer, Markus; Amunts, Katrin; Dickscheid, Timo
Veröffentlicht in: Helmholtz AI Conference 2024, HAICON24, Düsseldorf, Germany, 2024-06-12 - 2024-06-14, 2024
DOI: 10.34734/FZJ-2024-05545

MIP: Advanced Data Processing and Analytics for Science and Medicine

Autoren: Kostas Filippopolitis, Yannis Foufoulas, Minos Garofalakis, Apostolos Glenis, Yannis Ioannidis, Thanasis-Michail Karampatsis, Maria-Olympia Katsouli, Evdokia Mailli, Asimakis Papageorgiou-Mariglis, Giorgos Papanikos, George Pikramenos, Jason Sakellariou,
Veröffentlicht in: Advances in Database Technology - Volume 27 Proceedings 27th International Conference on Extending Database Technology ( EDBT 2024 ) Paestum, Italy, March 25 - March 28, 2024
Herausgeber: Open proceedings
DOI: 10.48786/EDBT.2024.74

Virtual Brain Twins in EBRAINS

Autoren: Jirsa, viktor; Meysam, Hashemi; Wang, Huifang; Woodman, Marmaduke; Triebkorn, Paul; Dollomaja, Borana; Runfola, Claudio; Depannemaecker, Damien; Breyton, Martin; Sorrentino, Pierpaolo; Klijn, Wouter; Petkoski, Spase
Veröffentlicht in: doi:10.34734/FZJ-2024-05114, 2024
DOI: 10.34734/FZJ-2024-05114

Lecture Notes in Computer Science

Autoren: Robin Dietrich, Philipp Spilger, Eric Müller, Johannes Schemmel, Alois C. Knoll
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Machine Learning, Optimization, and Data Science, 2025, ISSN 0302-9743
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.1007/978-3-031-82487-6_15

Human brain anatomy and atlases

Autoren: Katrin Amunts, Daniel Zachlod
Veröffentlicht in: Encyclopedia of the Human Brain, 2025
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/B978-0-12-820480-1.00187-X

Compressed representation of brain genetic transcription

Autoren: James K. Ruffle; Henry Watkins; Robert J. Gray; Harpreet Hyare; Michel Thiebaut de Schotten; Parashkev Nachev
Veröffentlicht in: Human Brain Mapping, 2024
DOI: 10.48550/ARXIV.2310.16113

The Virtual Parkinsonian Patient

Autoren: Marianna Angiolelli; Damien Depannemaecker; Hasnae Agouram; Jean Ŕegis; Romain Carron; Marmaduke Woodman; Letizia Chiodo; Paul Triebkorn; Abolfazl Ziaeemehr; Meysam Hashemi; Alexandre Eusebio; Viktor Jirsa; Pierpaolo Sorrentino
Veröffentlicht in: npj Systems Biology and Applications, 2024
DOI: 10.1038/S41540-025-00516-Y

Bachelor thesis: Runtime-dynamic reconfiguration for a time-continuous neuromorphic system

Autoren: Tim Auberer
Veröffentlicht in: 2024

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