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Deciphering the role of microbiome-fibroblast crosstalk in intestinal immune development, homeostasis and inflammation

Description du projet

Diaphonie microbiome-fibroblaste dans l’intestin

Les bactéries, les champignons et autres micro-organismes vivant dans notre intestin, connus sous le nom de microbiote, jouent un rôle clé dans l’immunité intestinale. Les mécanismes sous-jacents demeurent toutefois obscurs. Les fibroblastes intestinaux (iFB), initialement considérés comme des cellules structurales, apparaissent désormais comme des régulateurs immunitaires clés capables de détecter directement les signaux microbiens. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet FibroBiomeCrosstalk vise à étudier comment le dialogue entre le microbiome et les iFB façonne l’immunité au cours du développement, de l’homéostasie et de l’inflammation. Les chercheurs entreprendront une analyse transcriptomique unicellulaire et spatiale pour identifier les voies de détection microbiennes dans les iFB et déterminer leur rôle dans les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI). Les résultats du projet pourraient orienter les stratégies futures de prise en charge des MICI.

Objectif

The microbiome plays an essential role in intestinal immune development, homeostasis and inflammatory bowel diseases (IBD), however, our understanding of the underlying mechanisms by which it regulates these processes remains incomplete. Intestinal fibroblasts (iFB) are a heterogeneous population of tissue-resident cells increasingly recognized for their role in immune regulation. In preliminary studies, the host group and a collaborator found that human and mouse iFB express distinct arrays of microbial sensors and immune mediators and that iFB transcription is altered in germ-free mice. In my proposed project, I will combine state-of-the-art high dimensional flow cytometry, single cell (sc)RNA-seq, CITE-seq, spatial transcriptomics and bioinformatics analysis with animal models and analysis of human intestinal datasets to test the hypothesis that microbiome-iFB crosstalk plays a key role in intestinal immune system development, homeostasis and inflammation. Microbiome impact on iFB and intestinal immune system development will be assessed throughout the weaning period by treating mice with broad-spectrum antibiotics and/or antifungals. The importance of direct iFB-microbiome sensing for immune homeostasis and inflammation will be assessed as above as well as in dextran sulphate sodium (DSS)-induced colitis model in mice whose FB are deficient in either the Toll-like receptor signaling adaptor Myd88 or the C-type lectin receptor-Syk mediated antifungal response adaptor CARD9. Finally, translational aspects will be assessed through extensive bioinformatics analysis of iFB scRNA-seq datasets to map microbial sensor expression in human iFB subsets, evidence of downstream signaling through such sensors and their alterations in IBD. Collectively, this project uses a multi-systems approach to obtain novel insights into the importance of microbiome-iFB interactions in intestinal immune system homeostasis and disease with potential relevance for IBD management.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 247 553,28
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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