Objectif
While the discovery of hybrid vigor was one of the most important breakthroughs in modern agriculture, failure of many wide crosses limits the beneficial traits that can be introduced into crops. My goal is to understand the molecular and biochemical basis of hybrid incompatibility within, and also between, species. My first focus will be to characterize a particularly interesting incompatibility (identified in the laboratory of Prof. Weigel), in which offspring develop ectopic outgrowths (tumoring) on leaf petioles. The model will be a cross between two Arabidopsis thaliana accessions (strains) from Spain and Tajikistan. Preliminary results suggest that this example of severe negative epistasis is caused by an interaction between two alleles of a disease resistance (R) protein. Once confirmed, I will characterize the interaction at the protein level by domain-swapping and mutagenesis to determine the biochemical mechanisms of the deleterious interaction. A second, more speculative focus will be to assess the effect of intra- and inter-specific hybrid formation on genomic regulation through RNA silencing. I will do this by deep sequencing of the sRNA and transcriptome complements of intra- and inter-specific hybrids in the Arabidopsis genus. The resultant data will be analysed for occurrence of novel sRNAs in hybrid progeny, correlating with down regulation of transcription from the cognate genes or vice versa. Further experiments will be decided on the basis of these initial results and are anticipated to include profiling of DNA methylation at genomic intervals of interest, and analysis of the effects of knock down of RNA silencing pathways on hybrid formation and gene regulation. The two aspects of the proposed work are linked in that they aim to further understanding of hybrid genetic interactions that have been proposed to affect diverse biological phenomena from disease to speciation.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
80539 Munchen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.