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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

Analysis of Arabidopsis hybrid incompatibilities

Objetivo

While the discovery of hybrid vigor was one of the most important breakthroughs in modern agriculture, failure of many wide crosses limits the beneficial traits that can be introduced into crops. My goal is to understand the molecular and biochemical basis of hybrid incompatibility within, and also between, species. My first focus will be to characterize a particularly interesting incompatibility (identified in the laboratory of Prof. Weigel), in which offspring develop ectopic outgrowths (tumoring) on leaf petioles. The model will be a cross between two Arabidopsis thaliana accessions (strains) from Spain and Tajikistan. Preliminary results suggest that this example of severe negative epistasis is caused by an interaction between two alleles of a disease resistance (R) protein. Once confirmed, I will characterize the interaction at the protein level by domain-swapping and mutagenesis to determine the biochemical mechanisms of the deleterious interaction. A second, more speculative focus will be to assess the effect of intra- and inter-specific hybrid formation on genomic regulation through RNA silencing. I will do this by deep sequencing of the sRNA and transcriptome complements of intra- and inter-specific hybrids in the Arabidopsis genus. The resultant data will be analysed for occurrence of novel sRNAs in hybrid progeny, correlating with down regulation of transcription from the cognate genes or vice versa. Further experiments will be decided on the basis of these initial results and are anticipated to include profiling of DNA methylation at genomic intervals of interest, and analysis of the effects of knock down of RNA silencing pathways on hybrid formation and gene regulation. The two aspects of the proposed work are linked in that they aim to further understanding of hybrid genetic interactions that have been proposed to affect diverse biological phenomena from disease to speciation.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Aportación de la UE
€ 163 230,93
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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