Objectif
The cell interprets the information conferred by ubiquitin (Ub) through Ub-receptors, proteins that harbor ubiquitin-binding domains (UBDs). Ub-receptors can be found in three mutually exclusive forms. Apo is the unbound form, whereas trans is the intermolecular form bound to ubiquitylated cargo. Intriguingly, the third form, cis, is of Ub-receptors that are themselves ubiquitylated. Monoubiquitylation of the Ub-receptors imposes an auto-inhibitory conformation, rendering them unable to bind ubiquitylated cargos, and thus providing an intrinsic regulatory mechanism. While several structures of apo and trans are available, a cis structure form of an ubiquitylated Ub-receptor has yet to be determined. Determining a cis structure is crucial for understanding the molecular mechanism of auto-inhibition. Due to the action of deubiquitylating enzymes, the ubiquitylated form of the Ub-receptors is labile and therefore it is difficult to purify them from eukaryotes. To fill this gap in knowledge, we developed a novel bacterial system for protein ubiquitylation. The system produces a high yield of ubiquitylated protein that can be easily purified and subjected to crystallization trials. Using this bacterial ubiquitylation system, we will determine cis as well as apo and trans structures of Ub-receptors. Guided by comparison of the structures, point mutations will be introduced into key residues. In vitro functional studies including the determination of oligomeric stages, and affinity measurements using isothermal titration calorimetry and analytical ultracentrifugation will be performed on all three forms. Finally, the phenotype of the wild type and mutant proteins will be studied in vivo by monitoring trafficking of GFP-cargo under confocal microscopy. The outcome of this study is predicted to provide the molecular principles of ub-receptor regulation, and serve to design drugs for diseases that involve the monoubiquitin pathways such as AIDS and cancer.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse virus à ARN VIH
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique calorimétrie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie confocale
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IRG-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
69978 Tel Aviv
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.