Objectif
Directed evolution of functional proteins has arguably emerged as an approach to protein engineering that can complement or better design-led approaches to protein function. However, as a random process, enormous numbers of variants have to be screened and selected to have a chance to identify successful catalysts. This process is costly and cumbersome: Industrial screening facilities require investment of tens to hundred millions of dollars. My group has implemented key steps towards conducting quantitative biological experiments in a much cheaper format. Screening of individual library members in monodisperse oil-in-water compartments ('microdroplets’) that are generated at kHz frequencies in microfluidic devices has been shown to be possible. The droplet compartment constitutes a link between a given phenotype and its encoding genotype, by capturing reaction product, and thus providing a unique system to screen for catalysis.In this way quantitative fitness landscapes for interconversion of members of enzyme superfamilies along the lines of catalytic promiscuity, understanding the factors governing specificity and the mechanistic interpretation of the observed evolutionary pathways can be made. We now apply this screening system of unprecedented capacity for directed evolution and metagenomic screening of enzymes in in vivo and in vitro formats. We plan to apply this system to do experiments that would not be possible with conventional, lower throughput approaches: (i) screening of metagenomic libraries for rare and promiscuous activities that characterise environmental gene collections for their reactivity and potential for applied biocatalysis; (ii) developing a fundamental understanding of and strategic guidelines for enzyme evolution based on fitness landscapes that record data on multiple, promiscuous activities in response to Indel mutations; and (iii) evolution of gene networks to build up signalling networks in vitro.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse biocatalyse
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-ADG - Advanced Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2015-AdG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
CB2 1TN Cambridge
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.