Dissecting the crosstalk between metabolism and transcriptional regulation in pluripotent stem cells.

Informazioni relative al progetto

MetEpiStem

ID dell’accordo di sovvenzione: 716910

DOI

10.3030/716910

Progetto chiuso

Data della firma CE 9 Marzo 2017

Data di avvio 1 Ottobre 2017

Data di completamento 31 Marzo 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 498 232,00

Contributo UE

€ 1 498 232,00

Coordinato da

UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA
Italy

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (17)

Identification of druggable host dependency factors shared by multiple SARS-CoV-2 variants of concern.

Autori: Frasson I, Diamante L, Zangrossi M, Carbognin E, Dalla Pietà A, Penna A, Rosato A, Verin R, Torrigiani F, Salata C, Dizanzo MP, Vaccaro L, Cacchiarelli D, Richter SN, Montagner M, Martello G.
Pubblicato in: Journal of Molecular Cell Biology, 2024, Pagina/e mjae004, ISSN 1759-4685
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jmcb/mjae004

Mitochondrial fission links ECM mechanotransduction to metabolic redox homeostasis and metastatic chemotherapy resistance.

Autori: Romani P, Nirchio N, Arboit M, Barbieri V, Tosi A, Michielin F, Shibuya S, Benoist T, Wu D, Hindmarch CCT, Giomo M, Urciuolo A, Giamogante F, Roveri A, Chakravarty P, Montagner M, Calì T, Elvassore N, Archer SL, De Coppi P, Rosato A, Martello G, Dupont S
Pubblicato in: Nature Cell Biology, Numero 24, 2022, Pagina/e 168-180, ISSN 1465-7392
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-022-00843-w

3D ECM-rich environment sustains the identity of naive human iPSCs.

Autori: Cesare E, Urciuolo A, Stuart HT, Torchio E, Gesualdo A, Laterza C, Gagliano O, Martewicz S, Cui M, Manfredi A, Di Filippo L, Sabatelli P, Squarzoni S, Zorzan I, Betto RM, Martello G, Cacchiarelli D, Luni C, Elvassore N
Pubblicato in: Cell Stem Cell, Numero 29, 2022, Pagina/e 1703-1717, ISSN 1934-5909
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2022.11.011

Metabolic control of DNA methylation in naive pluripotent cells

Autori: Betto RM, Diamante L, Perrera V, Audano M, Rapelli S, Lauria A, Incarnato D, Arboit M, Pedretti S, Rigoni G, Guerineau V, Touboul D, Stirparo GG, Lohoff T, Boroviak T, Grumati P, Soriano ME, Nichols J, Mitro N, Oliviero S, Martello G.
Pubblicato in: Nature Genetics, Numero 53, 2021, Pagina/e 215-229, ISSN 1061-4036
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41588-020-00770-2

PsiNorm: a scalable normalization for single-cell RNA-seq data.

Autori: Borella M, Martello G, Risso D, Romualdi C.
Pubblicato in: Bioinformatics, Numero 38, 2021, Pagina/e 164-172, ISSN 1367-4811
Editore: Oxford Academic
DOI: 10.1093/bioinformatics/btab641

BrewerIX enables allelic expression analysis of imprinted and X-linked genes from bulk and single-cell transcriptomes.

Autori: Martini P, Sales G, Diamante L, Perrera V, Colantuono C, Riccardo S, Cacchiarelli D, Romualdi C, Martello G.
Pubblicato in: Communications Biology, Numero 5, 2022, Pagina/e 146, ISSN 2399-3642
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42003-022-03087-4

STAT3 and HIF1α cooperatively mediate the transcriptional and physiological responses to hypoxia

Autori: Dinarello A, Betto RM, Diamante L, Tesoriere A, Ghirardo R, Cioccarelli C, Meneghetti G, Peron M, Laquatra C, Tiso N, Martello G, Argenton F.
Pubblicato in: Cell Death Discovery, Numero 9, 2023, Pagina/e 226, ISSN 2058-7716
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41420-023-01507-w

Y705 and S727 are required for the mitochondrial import and transcriptional activities of STAT3, and for regulation of stem cell proliferation.

Autori: Peron M, Dinarello A, Meneghetti G, Martorano L, Betto RM, Facchinello N, Tesoriere A, Tiso N, Martello G, Argenton F.
Pubblicato in: Development, Numero 148, 2021, Pagina/e dev199477, ISSN 1477-9129
Editore: The Company of Biologists
DOI: 10.1242/dev.199477

Metabolic regulation in pluripotent stem cells

Autori: Diamante L, Martello G.
Pubblicato in: Current Opinion in Genetics & Development, Numero 75, 2022, Pagina/e 101923, ISSN 0959-437X
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.gde.2022.101923

Direct generation of human naive induced pluripotent stem cells from somatic cells in microfluidics

Autori: Stefano Giulitti, Marco Pellegrini, Irene Zorzan, Paolo Martini, Onelia Gagliano, Margherita Mutarelli, Michael Johannes Ziller, Davide Cacchiarelli, Chiara Romualdi, Nicola Elvassore, Graziano Martello
Pubblicato in: Nature Cell Biology, Numero 21/2, 2019, Pagina/e 275-286, ISSN 1465-7392
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41556-018-0254-5

A common molecular logic determines embryonic stem cell self‐renewal and reprogramming

Autori: Sara‐Jane Dunn, Meng Amy Li, Elena Carbognin, Austin Smith, Graziano Martello
Pubblicato in: The EMBO Journal, Numero 38/1, 2019, Pagina/e e100003, ISSN 0261-4189
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/embj.2018100003

How Does Reprogramming to Pluripotency Affect Genomic Imprinting?

Autori: Valentina Perrera, Graziano Martello
Pubblicato in: Frontiers in Cell and Developmental Biology, Numero 7, 2019, ISSN 2296-634X
Editore: Frontiers Media
DOI: 10.3389/fcell.2019.00076

The transcriptional regulator ZNF398 mediates pluripotency and epithelial character downstream of TGF-beta in human PSCs

Autori: Irene Zorzan, Marco Pellegrini, Mattia Arboit, Danny Incarnato, Mara Maldotti, Mattia Forcato, Guidantonio Malagoli Tagliazucchi, Elena Carbognin, Marco Montagner, Salvatore Oliviero, Graziano Martello
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-16205-9

Chemical conversion of human conventional PSCs to TSCs following transient naive gene activation

Autori: Zorzan I, Betto RM, Rossignoli G, Arboit M, Drusin A, Corridori C, Martini P, Martello G.
Pubblicato in: EMBO reports, Numero 24, 2023, Pagina/e e55235, ISSN 1469-3178
Editore: EMBO Press
DOI: 10.15252/embr.202255235

Esrrb guides naive pluripotent cells through the formative transcriptional programme.

Autori: Carbognin E, Carlini V, Panariello F, Chieregato M, Guerzoni E, Benvegnù D, Perrera V, Malucelli C, Cesana M, Grimaldi A, Mutarelli M, Carissimo A, Tannenbaum E, Kugler H, Hackett JA, Cacchiarelli D, Martello G
Pubblicato in: Nature Cell Biology, Numero 25, 2023, Pagina/e 643-657, ISSN 1476-4679
Editore: springer Nature
DOI: 10.1038/s41556-023-01131-x

STAT3-dependent long non-coding RNA Lncenc1 contributes to mouse ES cells pluripotency via stabilizing K mRNA.

Autori: Monteleone E, Corrieri P, Provero P, Viavattene D, Pulvirenti L, Raggi L, Carbognin E, Bianchi ME, Martello G, Oliviero S, Pandolfi PP, Poli V.
Pubblicato in: Briefings in Functional Genomics, 2023, Pagina/e elad045, ISSN 2041-2657
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bfgp/elad045

Genome-wide screening in pluripotent cells identifies Mtf1 as a suppressor of mutant huntingtin toxicity.

Autori: Ferlazzo GM, Gambetta AM, Amato S, Cannizzaro N, Angiolillo S, Arboit M, Diamante L, Carbognin E, Romani P, La Torre F, Galimberti E, Pflug F, Luoni M, Giannelli S, Pepe G, Capocci L, Di Pardo A, Vanzani P, Zennaro L, Broccoli V, Leeb M, Moro E, Maglione V, Martello G.
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 14, 2023, Pagina/e 3962, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-39552-9

Book chapters (1)

Using Microfluidics to Generate Human Naïve and Primed Pluripotent Stem Cells

Autori: Zorzan I, Gagliano O, Elvassore N, Martello G
Pubblicato in: Methods in Molecular Biology, Numero 2416, 2021, Pagina/e 53-71, ISBN 978-1-0716-1907-0
Editore: Humana
DOI: 10.1007/978-1-0716-1908-7_5

Other (1)

Mitochondrial STAT3 regulates proliferation of tissue stem cells

Autori: Margherita Peron, Giacomo Meneghetti, Alberto Dinarello, Laura Martorano, Riccardo M. Betto, Nicola Facchinello, Natascia Tiso, Graziano Martello, Francesco Argenton
Pubblicato in: www.biorXiv.org, 2020
Editore: Cold Spring Harbor Press
DOI: 10.1101/2020.07.17.208264

Diritti di proprietà intellettuale

Patent (1)

niPSCs DERIVED FROM SOMATIC CELLS

Numero candidatura/pubblicazione: 20 19054718
Data: 2019-06-06
Candidato/i: UNIVERSITA DEGLI STUDI DI PADOVA