Objectif
Epigenetics research has revealed that in the cell’s nucleus all kinds of biomolecules–DNA, RNAs, proteins, protein posttranslational modifications–are highly compartmentalized to occupy distinct chromatin territories and genomic loci, thereby contributing to gene regulation and cell identity. In contrast, small molecules and cellular metabolites are generally considered to passively enter the nucleus from the cytoplasm and to lack distinct subnuclear localization. The CHROMABOLISM proposal challenges this assumption based on preliminary data generated in my laboratory. I hypothesize that chromatin-bound enzymes of central metabolism and subnuclear metabolite gradients contribute to gene regulation and cellular identity.
To address this hypothesis, we will first systematically profile chromatin-bound metabolic enzymes, chart nuclear metabolomes across representative leukemia cell lines, and develop tools to measure local metabolite concentrations at distinct genomic loci. In a second step, we will then develop and apply technology to perturb these nuclear metabolite patterns by forcing the export of metabolic enzymes for the nucleus, aberrantly recruiting these enzymes to selected genomic loci, and perturbing metabolite patterns by addition and depletion of metabolites. In all these conditions we will measure the impact of nuclear metabolism on chromatin structure and gene expression. Based on the data obtained, we will model for the effects of cellular metabolites on cancer cell identity and proliferation. In line with the recent discovery of oncometabolites and the clinical use of antimetabolites, we expect to predict chromatin-bound metabolic enzymes that can be exploited as druggable targets in oncology. In a final aim we will validate these targets in leukemia and develop chemical probes against them.
Successful completion of this project has the potential to transform our understanding of nuclear metabolism in control of gene expression and cellular identity.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie leucémie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2017-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
1090 Wien
Autriche
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.