Enabling Precision Immuno-oncology in Colorectal cancer

Información del proyecto

EPIC

Identificador del acuerdo de subvención: 786295

DOI

10.3030/786295

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 20 Agosto 2018

Fecha de inicio 1 Octubre 2018

Fecha de finalización 30 Septiembre 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 460 500,00

Aportación de la UE

€ 2 460 500,00

Coordinado por

MEDIZINISCHE UNIVERSITAT INNSBRUCK
Austria

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Publicaciones

Peer reviewed articles (9)

Molecular and pharmacological modulators of the tumor immune contexture revealed by deconvolution of RNA-seq data

Autores: Francesca Finotello, Clemens Mayer, Christina Plattner, Gerhard Laschober, Dietmar Rieder, Hubert Hackl, Anne Krogsdam, Zuzana Loncova, Wilfried Posch, Doris Wilflingseder, Sieghart Sopper, Marieke Ijsselsteijn, Thomas P. Brouwer, Douglas Johnson, Yaomin Xu, Yu Wang, Melinda E. Sanders, Monica V. Estrada, Paula Ericsson-Gonzalez, Pornpimol Charoentong, Justin Balko, Noel Filipe da Cunha Carvalho d
Publicado en: Genome Medicine, Edición 11/1, 2019, ISSN 1756-994X
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-019-0638-6

CD39 Identifies the CD4 + Tumor-Specific T-cell Population in Human Cancer

Autores: Kim E. Kortekaas, Saskia J. Santegoets, Gregor Sturm, Ilina Ehsan, Sylvia L. van Egmond, Francesca Finotello, Zlatko Trajanoski, Marij J.P. Welters, Mariette I.E. van Poelgeest, Sjoerd H. van der Burg
Publicado en: Cancer Immunology Research, Edición 8/10, 2020, Página(s) 1311-1321, ISSN 2326-6066
Editor: American Association for Cancer Research Inc.
DOI: 10.1158/2326-6066.cir-20-0270

Functional and spatial proteomics profiling reveals intra- and intercellular signaling crosstalk in colorectal cancer

Autores: Christina Plattner, Giorgia Lamberti, Peter Blattmann, Alexander Kirchmair, Dietmar Rieder, Zuzana Loncova, Gregor Sturm, Stefan Scheidl, Marieke Ijsselsteijn, Georgios Fotakis, Asma Noureen, Rebecca Lisandrelli, Nina Böck, Niloofar Nemati, Anne Krogsdam, Sophia Daum, Francesca Finotello, Antonios Somarakis, Alexander Schäfer, Doris Wilflingseder, Miguel Gonzalez Acera, Dietmar Öfner, Lukas A.
Publicado en: iScience, Edición 26, 2025, Página(s) 108399, ISSN 2589-0042
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.isci.2023.108399

Scirpy: a Scanpy extension for analyzing single-cell T-cell receptor-sequencing data

Autores: Gregor Sturm, Tamas Szabo, Georgios Fotakis, Marlene Haider, Dietmar Rieder, Zlatko Trajanoski, Francesca Finotello
Publicado en: Bioinformatics, Edición 36/18, 2020, Página(s) 4817-4818, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btaa611

NeoFuse: predicting fusion neoantigens from RNA sequencing data

Autores: Georgios Fotakis, Dietmar Rieder, Marlene Haider, Zlatko Trajanoski, Francesca Finotello
Publicado en: Bioinformatics, Edición 36/7, 2019, Página(s) 2260-2261, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btz879

Next-generation computational tools for interrogating cancer immunity

Autores: Francesca Finotello, Dietmar Rieder, Hubert Hackl, Zlatko Trajanoski
Publicado en: Nature Reviews Genetics, Edición 20/12, 2019, Página(s) 724-746, ISSN 1471-0056
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41576-019-0166-7

Guadecitabine plus ipilimumab in unresectable melanoma: the NIBIT-M4 clinical trial

Autores: Anna Maria Di Giacomo, Alessia Covre, Francesca Finotello, Dietmar Rieder, Riccardo Danielli, Luca Sigalotti, Diana Giannarelli, Florent Petiprez, Laetitia Lacroix, Monica Valente, Ornella Cutaia, Carolina Fazio, Giovanni Amato, Andrea Lazzeri, Santa Monterisi, Clelia Miracco, Sandra Coral, Andrea Anichini, Christoph Bock, Amelie Nemc, Aram Oganesian, James N Lowder, Mohammad Azab, Wolf H. Fridman
Publicado en: Clinical Cancer Research, 2019, Página(s) clincanres.1335.2019, ISSN 1078-0432
Editor: American Association for Cancer Research
DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-19-1335

13C tracer analysis reveals the landscape of metabolic checkpoints in human CD8+ T cell differentiation and exhaustion

Autores: Alexander Kirchmair, Niloofar Nemati, Giorgia Lamberti, Marcel Trefny, Anne Krogsdam, Anita Siller, Paul Hörtnagl, Petra Schumacher, Sieghart Sopper, Adolf Sandbichler, Alfred Zippelius, Bart Ghesquière, Zlatko Trajanoski
Publicado en: Frontiers in Immunology, Edición 14, 2023, ISSN 1664-3224
Editor: Frontiers
DOI: 10.3389/fimmu.2023.1267816

High-resolution single-cell atlas reveals diversity and plasticity of tissue-resident neutrophils in non-small cell lung cancer

Autores: Stefan Salcher, Gregor Sturm, Lena Horvath, Gerold Untergasser, Christiane Kuempers, Georgios Fotakis, Elisa Panizzolo, Agnieszka Martowicz, Manuel Trebo, Georg Pall, Gabriele Gamerith, Martina Sykora, Florian Augustin, Katja Schmitz, Francesca Finotello, Dietmar Rieder, Sven Perner, Sieghart Sopper, Dominik Wolf, Andreas Pircher, Zlatko Trajanoski
Publicado en: Cancer Cell, Edición 40, 2024, Página(s) 1503-1520.e8, ISSN 1535-6108
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.ccell.2022.10.008

Non-peer reviewed articles (1)

Advancing cancer immunotherapy: a vision for the field

Autores: Noel F. C. C. de Miranda, Zlatko Trajanoski
Publicado en: Genome Medicine, Edición 11/1, 2019, ISSN 1756-994X
Editor: BioMed Central
DOI: 10.1186/s13073-019-0662-6