Molecular mechanisms, evolutionary impacts and applications of prokaryotic epigenetic-targeted immune systems

Informazioni relative al progetto

EPICut

ID dell’accordo di sovvenzione: 788405

DOI

10.3030/788405

Progetto chiuso

Data della firma CE 8 Giugno 2018

Data di avvio 1 Agosto 2018

Data di completamento 31 Luglio 2024

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 196 413,75

Contributo UE

€ 2 196 413,75

Coordinato da

UNIVERSITY OF BRISTOL
United Kingdom

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (8)

ENDO-Pore: high-throughput linked-end mapping of single DNA cleavage events using nanopore sequencing

Autori: Oscar E Torres Montaguth, Stephen J Cross, Kincaid W A Ingram, Laura Lee, Fiona M Diffin, Mark D Szczelkun
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab727

Bacteriostatic antibiotics promote CRISPR-Cas adaptive immunity by enabling increased spacer acquisition

Autori: Tatiana Dimitriu, Elena Kurilovich, Urszula Łapińska, Konstantin Severinov, Stefano Pagliara, Mark D Szczelkun, Edze R Westra
Pubblicato in: Cell Host Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2021.11.014

5′ modifications to CRISPR–Cas9 gRNA can change the dynamics and size of R-loops and inhibit DNA cleavage

Autori: Grace Mullally, Kara van Aelst, Mohsin M Naqvi, Fiona M Diffin, Tautvydas Karvelis, Giedrius Gasiunas, Virginijus Siksnys, Mark D Szczelkun
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 48/12, 2020, Pagina/e 6811-6823, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa477

CRISPR–Cas12a-mediated DNA clamping triggers target-strand cleavage

Autori: Mohsin M. Naqvi, Laura Lee, Oscar E. Torres Montaguth, Fiona M. Diffin, Mark D. Szczelkun
Pubblicato in: Nature Chemical Biology, Numero 18, 2022, Pagina/e 1014–1022, ISSN 1552-4469
Editore: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-01082-8

The Effect of DNA Topology on Observed Rates of R-Loop Formation and DNA Strand Cleavage by CRISPR Cas12a

Autori: Kara van Aelst, Carlos Martínez-Santiago, Stephen Cross, Mark Szczelkun
Pubblicato in: Genes, Numero 10/2, 2019, Pagina/e 169, ISSN 2073-4425
Editore: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes10020169

Hexameric assembly of the AAA+ protein McrB is necessary for GTPase activity

Autori: Neha Nirwan, Pratima Singh, Gyana Gourab Mishra, Christopher M Johnson, Mark D Szczelkun, Katsuaki Inoue, Kutti R Vinothkumar, Kayarat Saikrishnan
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, Numero 47, 2022, Pagina/e 868-882, ISSN 0305-1048
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky1170

The bacterial defense system MADS interacts with CRISPR-Cas to limit phage infection and escape

Autori: Alice Maestri, Benoit J. Pons, Elizabeth Pursey, Charlotte E. Chong, Sylvain Gandon, Rafael Custodio, Anna Olina, Aleksei Agapov, Matthew A.W. Chisnall, Anita Grasso, Steve Paterson, Mark D. Szczelkun, Kate S. Baker, Stineke van Houte, Anne Chevallereau, Edze R. Westra
Pubblicato in: Cell Host & Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.07.005

Short-range translocation by a restriction enzyme motor triggers diffusion along DNA

Autori: Martin Göse, Emma E. Magill, Alex Hughes-Games, Steven J. Shaw, Fiona M. Diffin, Tara Rawson, Zsofia Nagy, Ralf Seidel, Mark D. Szczelkun
Pubblicato in: Nature Chemical Biology, Numero 20, 2024, Pagina/e 689-698, ISSN 1552-4450
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01504-1

Non-peer reviewed articles (1)

Evolutionary Ecology and Interplay of Prokaryotic Innate and Adaptive Immune Systems

Autori: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Pubblicato in: Current Biology, Numero 30/19, 2020, Pagina/e R1189-R1202, ISSN 0960-9822
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.08.028

Other (1)

Various plasmid strategies limit the effect of bacterial Restriction-Modification systems against conjugation

Autori: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Pubblicato in: bioRXiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.17.599295