Molecular mechanisms, evolutionary impacts and applications of prokaryotic epigenetic-targeted immune systems

Informacje na temat projektu

EPICut

Identyfikator umowy o grant: 788405

DOI

10.3030/788405

Projekt został zamknięty

Data podpisania przez KE 8 Czerwca 2018

Data rozpoczęcia 1 Sierpnia 2018

Data zakończenia 31 Lipca 2024

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 2 196 413,75

Wkład UE

€ 2 196 413,75

Koordynowany przez

UNIVERSITY OF BRISTOL
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (8)

ENDO-Pore: high-throughput linked-end mapping of single DNA cleavage events using nanopore sequencing

Autorzy: Oscar E Torres Montaguth, Stephen J Cross, Kincaid W A Ingram, Laura Lee, Fiona M Diffin, Mark D Szczelkun
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, 2021, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkab727

Bacteriostatic antibiotics promote CRISPR-Cas adaptive immunity by enabling increased spacer acquisition

Autorzy: Tatiana Dimitriu, Elena Kurilovich, Urszula Łapińska, Konstantin Severinov, Stefano Pagliara, Mark D Szczelkun, Edze R Westra
Opublikowane w: Cell Host Microbe, 2021, ISSN 1931-3128
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2021.11.014

5′ modifications to CRISPR–Cas9 gRNA can change the dynamics and size of R-loops and inhibit DNA cleavage

Autorzy: Grace Mullally, Kara van Aelst, Mohsin M Naqvi, Fiona M Diffin, Tautvydas Karvelis, Giedrius Gasiunas, Virginijus Siksnys, Mark D Szczelkun
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 48/12, 2020, Strona(/y) 6811-6823, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaa477

CRISPR–Cas12a-mediated DNA clamping triggers target-strand cleavage

Autorzy: Mohsin M. Naqvi, Laura Lee, Oscar E. Torres Montaguth, Fiona M. Diffin, Mark D. Szczelkun
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 18, 2022, Strona(/y) 1014–1022, ISSN 1552-4469
Wydawca: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41589-022-01082-8

The Effect of DNA Topology on Observed Rates of R-Loop Formation and DNA Strand Cleavage by CRISPR Cas12a

Autorzy: Kara van Aelst, Carlos Martínez-Santiago, Stephen Cross, Mark Szczelkun
Opublikowane w: Genes, Numer 10/2, 2019, Strona(/y) 169, ISSN 2073-4425
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/genes10020169

Hexameric assembly of the AAA+ protein McrB is necessary for GTPase activity

Autorzy: Neha Nirwan, Pratima Singh, Gyana Gourab Mishra, Christopher M Johnson, Mark D Szczelkun, Katsuaki Inoue, Kutti R Vinothkumar, Kayarat Saikrishnan
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 47, 2022, Strona(/y) 868-882, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gky1170

The bacterial defense system MADS interacts with CRISPR-Cas to limit phage infection and escape

Autorzy: Alice Maestri, Benoit J. Pons, Elizabeth Pursey, Charlotte E. Chong, Sylvain Gandon, Rafael Custodio, Anna Olina, Aleksei Agapov, Matthew A.W. Chisnall, Anita Grasso, Steve Paterson, Mark D. Szczelkun, Kate S. Baker, Stineke van Houte, Anne Chevallereau, Edze R. Westra
Opublikowane w: Cell Host & Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.07.005

Short-range translocation by a restriction enzyme motor triggers diffusion along DNA

Autorzy: Martin Göse, Emma E. Magill, Alex Hughes-Games, Steven J. Shaw, Fiona M. Diffin, Tara Rawson, Zsofia Nagy, Ralf Seidel, Mark D. Szczelkun
Opublikowane w: Nature Chemical Biology, Numer 20, 2024, Strona(/y) 689-698, ISSN 1552-4450
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-023-01504-1

Non-peer reviewed articles (1)

Evolutionary Ecology and Interplay of Prokaryotic Innate and Adaptive Immune Systems

Autorzy: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Opublikowane w: Current Biology, Numer 30/19, 2020, Strona(/y) R1189-R1202, ISSN 0960-9822
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cub.2020.08.028

Other (1)

Various plasmid strategies limit the effect of bacterial Restriction-Modification systems against conjugation

Autorzy: Tatiana Dimitriu, Mark D. Szczelkun, Edze R. Westra
Opublikowane w: bioRXiv, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.17.599295