A Google Earth Approach to Understanding Collagen Mineralization

Información del proyecto

COLMIN

Identificador del acuerdo de subvención: 788982

DOI

10.3030/788982

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 24 Mayo 2018

Fecha de inicio 1 Enero 2019

Fecha de finalización 30 Abril 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 3 498 006,25

Aportación de la UE

€ 3 498 006,00

Coordinado por

STICHTING RADBOUD UNIVERSITAIR MEDISCH CENTRUM
Netherlands

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Publicaciones

Thesis and dissertations (1)

Unravelling the Role of Glycosylation on the Mineralization of Collagen Type I - Model Systems and Advanced Transmission Electron Microscopy

Autores: Rutten, L.J.
Publicado en: Edición 1, 2024, ISBN 978-94-6473-655-6
Editor: Luco Rutten

Peer reviewed articles (17)

A Cryo‐to‐Liquid Phase Correlative Light Electron Microscopy Workflow for the Visualization of Biological Processes in Graphene Liquid Cells

Autores: Luco Rutten, Ben Joosten, Judith Schaart, Marit de Beer, Rona Roverts, Steffen Gräber, Willi Jahnen‐Dechent, Anat Akiva, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk
Publicado en: Advanced Functional Materials, Edición 35, 2025, ISSN 1616-301X
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202416938

Involvement of ceramide biosynthesis in increased extracellular vesicle release in Pkd1 knock out cells

Autores: Valentina Carotti, Jenny van der Wijst, Eric H. J. Verschuren, Luco Rutten, Nico Sommerdijk, Charlotte Kaffa, Vera Sommers, Juan P. Rigalli, Joost G. J. Hoenderop
Publicado en: Frontiers in Endocrinology, Edición 13, 2022, ISSN 1664-2392
Editor: Frontiers Media SA
DOI: 10.3389/fendo.2022.1005639

Bioinspired Silk Fibroin Mineralization for Advanced In Vitro Bone Remodeling Models

Autores: Bregje W. M. de Wildt,Robin van der Meijden,Paul A. A. Bartels,Nico A. J. M. Sommerdijk,Anat Akiva,Keita Ito,Sandra Hofmann
Publicado en: ADVANCED FUNCTIONAL MATERIALS, Edición 1616301X, 2022, ISSN 1616-301X
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202206992

On the role of the glycosylation of type I collagen in bone

Autores: Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Nico Sommerdijk
Publicado en: Journal of Structural Biology, Edición 216, 2025, Página(s) 108145, ISSN 1047-8477
Editor: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108145

Precise targeting for 3D cryo-correlative light and electron microscopy volume imaging of tissues using a FinderTOP

Autores: Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Luco Rutten, Elena Macías-Sánchez, Juriaan R. Metz, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Publicado en: Communications Biology, Edición 6, 2023, ISSN 2399-3642
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-023-04887-y

Comparative 3D ultrastructure of Plasmodium falciparum gametocytes

Autores: Felix Evers, Rona Roverts, Cas Boshoven, Mariska Kea-te Lindert, Julie M. J. Verhoef, Nico Sommerdijk, Robert E. Sinden, Anat Akiva, Taco W. A. Kooij
Publicado en: Nature Communications, Edición 16, 2025, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-55413-5

Cell-induced collagen alignment in a 3D in vitro culture during extracellular matrix production

Autores: Judith M. Schaart, Mariska Kea-te Lindert, Rona Roverts, Wouter H. Nijhuis, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Publicado en: Journal of Structural Biology, Edición 216, 2024, Página(s) 108096, ISSN 1047-8477
Editor: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108096

Intermolecular channels direct crystal orientation in mineralized collagen

Autores: YiFei Xu, Fabio Nudelman, E. Deniz Eren, Maarten J. M. Wirix, Bram Cantaert, Wouter H. Nijhuis, Daniel Hermida-Merino, Giuseppe Portale, Paul H. H. Bomans, Christian Ottmann, Heiner Friedrich, Wim Bras, Anat Akiva, Joseph P. R. O. Orgel, Fiona C. Meldrum, Nico Sommerdijk
Publicado en: Nature Communications, Edición 11/1, 2020, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-020-18846-2

Correlative Raman spectroscopy and electron microscopy identifies glycogen rich deposits correlated with local structural defects in long bones of type IV osteogenesis imperfecta patients

Autores: R.H.M. Van der Meijden, M.H. Scholten, W.H. Nijhuis, R.J.B. Sakkers, N. Sommerdijk, A. Akiva
Publicado en: Journal of Structural Biology, Edición 216, 2025, Página(s) 108142, ISSN 1047-8477
Editor: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jsb.2024.108142

Visualizing Biological Tissues: A Multiscale Workflow from Live Imaging to 3D Cryo-CLEM

Autores: Marit de Beer, Rona Roverts, Xavier Heiligenstein, Edwin Lamers, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Publicado en: Microscopy and Microanalysis, Edición 27, 2023, Página(s) 11-12, ISSN 1431-9276
Editor: Cambridge University Press
DOI: 10.1017/s1431927621013635

An Organoid for Woven Bone

Autores: Anat Akiva, Johanna Melke, Sana Ansari, Nalan Liv, Robin Meijden, Merijn Erp, Feihu Zhao, Merula Stout, Wouter H. Nijhuis, Cilia Heus, Claudia Muñiz Ortera, Job Fermie, Judith Klumperman, Keita Ito, Nico Sommerdijk, Sandra Hofmann
Publicado en: Advanced Functional Materials, 2021, Página(s) 2010524, ISSN 1616-301X
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202010524

Imatinib attenuates reperfusion injury in a rat model of acute myocardial infarction

Autores: Lara S. F. Konijnenberg, Tom T. J. Luiken, Andor Veltien, Laween Uthman, Carolien T. A. Kuster, Laura Rodwell, Guus A. de Waard, Mariska Kea-te Lindert, Anat Akiva, Dick H. J. Thijssen, Robin Nijveldt, Niels van Royen
Publicado en: Basic Research in Cardiology, Edición 118, 2023, ISSN 1435-1803
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1007/s00395-022-00974-z

Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling

Autores: Jitske Jansen, Bartholomeus T. van den Berge, Martijn van den Broek, Rutger J. Maas, Deniz Daviran, Brigith Willemsen, Rona Roverts, Marit van der Kruit, Christoph Kuppe, Katharina C. Reimer, Gianluca Di Giovanni, Fieke Mooren, Quincy Nlandu, Helmer Mudde, Roy Wetzels, Dirk den Braanker, Naomi Parr, James S. Nagai, Vedran Drenic, Ivan G. Costa, Eric Steenbergen, Tom Nijenhuis, Henry Dijkman, Nicol
Publicado en: Development, Edición 149, 2022, ISSN 0950-1991
Editor: The Company of Biologists Ltd.
DOI: 10.1242/dev.200198

Endocytosis-like DNA uptake by cell wall-deficient bacteria

Autores: Renée Kapteijn, Shraddha Shitut, Dennis Aschmann, Le Zhang, Marit de Beer, Deniz Daviran, Rona Roverts, Anat Akiva, Gilles P. van Wezel, Alexander Kros, Dennis Claessen
Publicado en: Nature Communications, Edición 13, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-33054-w

From bone regeneration to three-dimensional in vitro models: tissue engineering of organized bone extracellular matrix

Autores: Bregje W.M. de Wildt, Sana Ansari, Nico A.J.M. Sommerdijk, Keita Ito, Anat Akiva, Sandra Hofmann
Publicado en: Current Opinion in Biomedical Engineering, Edición 10, 2019, Página(s) 107-115, ISSN 2468-4511
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cobme.2019.05.005

A 3D Cell‐Free Bone Model Shows Collagen Mineralization is Driven and Controlled by the Matrix

Autores: Robin H.M. van der Meijden, Deniz Daviran, Luco Rutten, X. Frank Walboomers, Elena Macías‐Sánchez, Nico Sommerdijk, Anat Akiva
Publicado en: Advanced Functional Materials, Edición 33, 2023, ISSN 1616-301X
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/adfm.202212339

SARS-CoV-2 infects the human kidney and drives fibrosis in kidney organoids

Autores: Jitske Jansen; Katharina C. Reimer; James S. Nagai; Finny S. Varghese; Gijs J. Overheul; Marit de Beer; Rona Roverts; Deniz Daviran; Liline A.S. Fermin; Brigith Willemsen; Marcel Beukenboom; Sonja Djudjaj; Saskia von Stillfried; Larissa E. van Eijk; Mirjam Mastik; Marian Bulthuis; Wilfred den Dunnen; Harry van Goor; Jan-Luuk Hillebrands; Sergio H. Triana; Theodore Alexandrov; Marie-Cherelle Timm;
Publicado en: CELL STEM CELL, Edición 19345909, 2021, ISSN 1934-5909
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.stem.2021.12.010

Book chapters (1)

HPM live μ for a full CLEM workflow

Autores: Xavier Heiligenstein, Marit de Beer, Jérôme Heiligenstein, Frédérique Eyraud, Laurent Manet, Fabrice Schmitt, Edwin Lamers, Joerg Lindenau, Mariska Kea-te Lindert, Jean Salamero, Graça Raposo, Nico Sommerdijk, Martin Belle, Anat Akiva
Publicado en: Correlative Light and Electron Microscopy IV, Edición 162, 2021, Página(s) 115-149, ISBN 9780128220580
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/bs.mcb.2020.10.022