Knowledge based design of complex synthetic microbial communities for plant protection

Informations projet

DeCoCt

N° de convention de subvention: 820124

DOI

10.3030/820124

Projet clôturé

Date de signature de la CE 4 Février 2019

Date de début 1 Mars 2019

Date de fin 28 Février 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 925 500,00

Contribution de l’UE

€ 1 925 500,00

Coordonné par

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Germany

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

All relevant sequencing data will be deposited at the ENA European Nucleotide Archive EMBLEBI and will be publicly available upon paper publication or after 60 months latest Assembled genomes and genome data including annotations will be deposited within the EuPathDBAll customized code for data analysis will be regularly deposited and updated at githubAll data analyses and interpretation will be made available through publication in open access journals as far as possible and permitted by the type of analyses

Publications

Peer reviewed articles (7)

Distinct Phyllosphere Microbiome of Wild Tomato Species in Central Peru Upon Dysbiosis

Auteurs: Paul Runge, Freddy Ventura, Eric Kemen, Remco Stam
Publié dans: Microbial Ecology, 2021, ISSN 0095-3628
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.21203/rs.3.rs-648608/v1

Microbial communities living inside plant leaves or on the leaf surface are differently shaped by environmental cues

Auteurs: Maryam Mahmoudi, Juliana Almario, Katrina Lutap, Kay Nieselt, Eric Kemen
Publié dans: ISME Communications, Numéro 4, 2024, ISSN 2730-6151
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycae103

Predicting Lifestyle from Positive Selection Data and Genome Properties in Oomycetes

Auteurs: Daniel Gómez-Pérez, Eric Kemen
Publié dans: Pathogens, 2021, ISSN 2076-0817
Éditeur: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pathogens10070807

Strong pairwise interactions do not drive interactions in a plant leaf associated microbial community

Auteurs: Franziska Höhn, Vasvi Chaudhry, Caner Bagci, Maryam Mahmoudi, Elke Klenk3, Lara Berg, Paolo Stincone, Chambers C Hughes, Daniel Petras, Heike Brötz-Oesterhelt, Eric Kemen, Nadine Ziemert
Publié dans: ISME Communications, 2024, ISSN 2730-6151
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycae117

The Leaf Microbiome of Arabidopsis Displays Reproducible Dynamics and Patterns throughout the Growing Season

Auteurs: Juliana Almario, Maryam Mahmoudi, Samuel Kroll, Mathew Agler, Aleksandra Placzek, Alfredo Mari, Eric Kemen
Publié dans: mBio, 2022, ISSN 2161-2129
Éditeur: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.02825-21

Proteins released into the plant apoplast by the obligate parasitic protist <i>Albugo</i> selectively repress phyllosphere‐associated bacteria

Auteurs: Daniel Gómez‐Pérez; Monja Schmid; Vasvi Chaudhry; Yiheng Hu; Ana Velic; Boris Maček; Jonas Ruhe; Ariane Kemen; Eric Kemen
Publié dans: New Phytologist, Numéro Volume 239, Numéro 6, 2023, Page(s) 2320-2334, ISSN 0028-646X
Éditeur: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18995

Topic: Shaping the leaf microbiota: plant-microbe-microbe interactions

Auteurs: Vasvi Chaudhry, Paul Runge, Priyamedha Sengupta, Gunther Doehlemann, Jane E Parker, Eric Kemen
Publié dans: Journal of Experimental Botany, 2020, ISSN 0022-0957
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/eraa417

Other (2)

Life on leaves : uncovering temporal dynamics in Arabidopsis’ leaf microbiota

Auteurs: Juliana Almario, Maryam Mahmudi, Samuel Kroll, Mathew Agler, Aleksandra Placzek, Alfredo Mari, Eric Kemen
Publié dans: bioRxiv, 2021
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.07.06.450897

Machine Learning Reveals Biocontrol Agents Shaping Disease Protection in Natural Arabidopsis Populations and Synthetic Communities

Auteurs: Eric Kemen, Maryam Mahmoudi, Yiheng Hu, Juliana Almario, Paolo Stincone, Lynn-Marie Tenzer, Vasvi Chaudhry, Kay Nieselt
Publié dans: Research Square, Numéro Version 1 posted 13 Mar, 2025, 2025, Page(s) 1-35, ISSN 2693-5015
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-6130404/v1

Non-peer reviewed articles (1)

Machine Learning Reveals Biocontrol Agents Shaping Disease Protection in Natural Arabidopsis Populations and Synthetic Communities

Auteurs: Eric Kemen, Maryam Mahmoudi, Yiheng Hu, Juliana Almario, Paolo Stincone, Lynn-Marie Tenzer, Vasvi Chaudhry, Kay Nieselt
Publié dans: Research Square, 2025, ISSN 2693-5015
Éditeur: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-6130404/v1