Knowledge based design of complex synthetic microbial communities for plant protection

Projektinformationen

DeCoCt

ID Finanzhilfevereinbarung: 820124

DOI

10.3030/820124

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 4 Februar 2019

Startdatum 1 März 2019

Enddatum 28 Februar 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 925 500,00

EU-Beitrag

€ 1 925 500,00

Koordiniert durch

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Germany

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

All relevant sequencing data will be deposited at the ENA European Nucleotide Archive EMBLEBI and will be publicly available upon paper publication or after 60 months latest Assembled genomes and genome data including annotations will be deposited within the EuPathDBAll customized code for data analysis will be regularly deposited and updated at githubAll data analyses and interpretation will be made available through publication in open access journals as far as possible and permitted by the type of analyses

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (7)

Distinct Phyllosphere Microbiome of Wild Tomato Species in Central Peru Upon Dysbiosis

Autoren: Paul Runge, Freddy Ventura, Eric Kemen, Remco Stam
Veröffentlicht in: Microbial Ecology, 2021, ISSN 0095-3628
Herausgeber: Springer Verlag
DOI: 10.21203/rs.3.rs-648608/v1

Microbial communities living inside plant leaves or on the leaf surface are differently shaped by environmental cues

Autoren: Maryam Mahmoudi, Juliana Almario, Katrina Lutap, Kay Nieselt, Eric Kemen
Veröffentlicht in: ISME Communications, Ausgabe 4, 2024, ISSN 2730-6151
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycae103

Predicting Lifestyle from Positive Selection Data and Genome Properties in Oomycetes

Autoren: Daniel Gómez-Pérez, Eric Kemen
Veröffentlicht in: Pathogens, 2021, ISSN 2076-0817
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/pathogens10070807

Strong pairwise interactions do not drive interactions in a plant leaf associated microbial community

Autoren: Franziska Höhn, Vasvi Chaudhry, Caner Bagci, Maryam Mahmoudi, Elke Klenk3, Lara Berg, Paolo Stincone, Chambers C Hughes, Daniel Petras, Heike Brötz-Oesterhelt, Eric Kemen, Nadine Ziemert
Veröffentlicht in: ISME Communications, 2024, ISSN 2730-6151
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/ismeco/ycae117

The Leaf Microbiome of Arabidopsis Displays Reproducible Dynamics and Patterns throughout the Growing Season

Autoren: Juliana Almario, Maryam Mahmoudi, Samuel Kroll, Mathew Agler, Aleksandra Placzek, Alfredo Mari, Eric Kemen
Veröffentlicht in: mBio, 2022, ISSN 2161-2129
Herausgeber: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/mbio.02825-21

Proteins released into the plant apoplast by the obligate parasitic protist <i>Albugo</i> selectively repress phyllosphere‐associated bacteria

Autoren: Daniel Gómez‐Pérez; Monja Schmid; Vasvi Chaudhry; Yiheng Hu; Ana Velic; Boris Maček; Jonas Ruhe; Ariane Kemen; Eric Kemen
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe Volume 239, Ausgabe 6, 2023, Seite(n) 2320-2334, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/nph.18995

Topic: Shaping the leaf microbiota: plant-microbe-microbe interactions

Autoren: Vasvi Chaudhry, Paul Runge, Priyamedha Sengupta, Gunther Doehlemann, Jane E Parker, Eric Kemen
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, 2020, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/jxb/eraa417

Other (2)

Life on leaves : uncovering temporal dynamics in Arabidopsis’ leaf microbiota

Autoren: Juliana Almario, Maryam Mahmudi, Samuel Kroll, Mathew Agler, Aleksandra Placzek, Alfredo Mari, Eric Kemen
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2021
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2021.07.06.450897

Machine Learning Reveals Biocontrol Agents Shaping Disease Protection in Natural Arabidopsis Populations and Synthetic Communities

Autoren: Eric Kemen, Maryam Mahmoudi, Yiheng Hu, Juliana Almario, Paolo Stincone, Lynn-Marie Tenzer, Vasvi Chaudhry, Kay Nieselt
Veröffentlicht in: Research Square, Ausgabe Version 1 posted 13 Mar, 2025, 2025, Seite(n) 1-35, ISSN 2693-5015
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.21203/rs.3.rs-6130404/v1

Non-peer reviewed articles (1)

Machine Learning Reveals Biocontrol Agents Shaping Disease Protection in Natural Arabidopsis Populations and Synthetic Communities

Autoren: Eric Kemen, Maryam Mahmoudi, Yiheng Hu, Juliana Almario, Paolo Stincone, Lynn-Marie Tenzer, Vasvi Chaudhry, Kay Nieselt
Veröffentlicht in: Research Square, 2025, ISSN 2693-5015
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.21203/rs.3.rs-6130404/v1