Predicting potent drug combinations by exploiting monotherapy resistance

Projektinformationen

COMBAT-RES

ID Finanzhilfevereinbarung: 950293

DOI

10.3030/950293

Das Projekt endete am 1 Oktober 2025

EK-Unterschriftsdatum 17 November 2020

Startdatum 1 Januar 2021

Enddatum 31 Dezember 2025

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 499 991,00

EU-Beitrag

€ 1 499 991,00

Koordiniert durch

HELMHOLTZ ZENTRUM MUENCHEN DEUTSCHES FORSCHUNGSZENTRUM FUER GESUNDHEIT UND UMWELT GMBH
Germany

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (16)

Generative artificial intelligence empowers digital twins in drug discovery and clinical trials

Autoren: M Bordukova, N Makarov, R Rodriguez-Esteban, F Schmich, MP Menden
Veröffentlicht in: Expert Opinion on Drug Discovery, 2024, Seite(n) 19 (1), 33-42, ISSN 1746-0441
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2023.2273839

Loss of NEDD8 in cancer cells causes vulnerability to immune checkpoint blockade in triple-negative breast cancer

Autoren: Irineos Papakyriacou, Ginte Kutkaite, Marta Rúbies Bedós, Divya Nagarajan, Liam P. Alford, Michael P. Menden, Yumeng Mao
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-47987-x

Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma

Autoren: Divya Nagarajan, Rebeca T. Parracho, David Corujo, Minglu Xie, Ginte Kutkaite, Thale K. Olsen, Marta Rubies Bedos, Maede Salehi, Ninib Baryawno, Michael P. Menden, Xingqi Chen, Marcus Buschbeck, Yumen
Veröffentlicht in: Journal of Clinical Investigation, Ausgabe 134, 2024, ISSN 1558-8238
Herausgeber: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci175310

The impact of the cardiovascular component and somatic mutations on ageing

Autoren: Daniel Garger, Martin Meinel, Tamina Dietl, Christina Hillig, Natalie Garzorz-Stark, Kilian Eyerich, Martin Hrabě de Angelis, Stefanie Eyerich, Michael P. Menden
Veröffentlicht in: Aging Cell, 2023, ISSN 1474-9718
Herausgeber: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/acel.13957

Can artificial intelligence accelerate preclinical drug discovery and precision medicine?

Autoren: Ali Farnoud, Alexander J Ohnmacht, Martin Meinel, Michael P Menden
Veröffentlicht in: Expert Opinion on Drug Discovery, 2022, ISSN 1746-0441
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2022.2090540

LUBAC modulates CBM complex functions downstream of TRAF6 in T cells

Autoren: Carina Graß, Franziska Ober, Constanze Sixt, Bahareh Nemati Moud, Irina Antoshkina, Frederick Eberstadt, Alisa Puhach, Göksu Avar, Antonia Keßler, Thomas J. O’Neill, Thomas Seeholzer, Jan Kranich
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-65879-6

Oncogene-induced MALT1 protease activity drives post-transcriptional gene expression in malignant lymphomas

Autoren: Nicole Wimberger, Franziska Ober, Göksu Avar, Michael Grau, Wendan Xu, Georg Lenz, Michael P. Menden, Daniel Krappmann
Veröffentlicht in: Blood, 2023, ISSN 0006-4971
Herausgeber: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2023021299

The Oncology Biomarker Discovery framework reveals cetuximab and bevacizumab response patterns in metastatic colorectal cancer

Autoren: Ohnmacht AJ, Stahler A, Stintzing S, Modest DP, Holch JW, Westphalen CB, Hölzel L, Schübel MK, Galhoz A, Farnoud A, Ud-Dean M, Vehling-Kaiser U, Decker T, Moehler M, Heinig M, Heinemann V, Menden MP
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41011-4

Generative AI and digital twins: shaping a paradigm shift from precision to truly personalized medicine

Autoren: Maria Bordukova, Alina J. Arneth, Nikita Makarov, Robyn M. Brown, Elena K. Schneider-Futschik, Shyamali C. Dharmage, Elif Ekinci, Peter J. Crack, Danny M. Hatters, Alastair G. Stewart, David Stroud, T
Veröffentlicht in: Expert Opinion on Drug Discovery, Ausgabe 20, 2025, Seite(n) 821-826, ISSN 1746-0441
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2025.2507376

The pharmacoepigenomic landscape of cancer cell lines reveals the epigenetic component of drug sensitivity

Autoren: Alexander Joschua Ohnmacht, Anantharamanan Rajamani, Göksu Avar, Ginte Kutkaite, Emanuel Gonçalves, Dieter Saur, Michael Patrick Menden
Veröffentlicht in: Communications Biology, 2023, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Nature
DOI: 10.1038/s42003-023-05198-y

WT1 and DNMT3A play essential roles in the growth of certain patient AML cells in mice

Autoren: Maryam Ghalandary, Yuqiao Gao, Diana Amend, Ginte Kutkaite, Binje Vick, Karsten Spiekermann, Maja Rothenberg-Thurley, Klaus H. Metzeler, Anetta Marcinek, Marion Subklewe, Michael P. Menden, Vindi Jurinovic, Ehsan Bahrami, Irmela Jeremias
Veröffentlicht in: Blood, 2023, Seite(n) 141 (8): 955–960., ISSN 0006-4971
Herausgeber: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2022016411

FOLFIRI with cetuximab or bevacizumab in RAS wild-type metastatic colorectal cancer: Refining first-line treatment selection by combining clinical parameters

Autoren: Julian Walter Holch, Alexander J. Ohnmacht, Sebastian Stintzing, Kathrin Heinrich, Lena Weiss, Victoria Probst, Arndt Stahler, Ludwig Fischer von Weikersthal, Thomas Decker, Alexander Kiani, Florian K
Veröffentlicht in: European Journal of Cancer, Ausgabe 220, 2025, Seite(n) 115388, ISSN 0959-8049
Herausgeber: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.ejca.2025.115388

Artificial intelligence in early drug discovery enabling precision medicine

Autoren: Fabio Boniolo, Emilio Dorigatti, Alexander J Ohnmacht, Dieter Saur, Benjamin Schubert, Michael P Menden
Veröffentlicht in: Expert Opinion on Drug Discovery, 2021, ISSN 1746-0441
Herausgeber: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2021.1918096

A statistical framework for assessing pharmacological response and biomarkers using uncertainty estimates

Autoren: Dennis Wang; James Hensman; Ginte Kutkaite; Tzen S Toh; Ana Galhoz; GDSC Screening Team; Jonathan R Dry; Julio Saez-Rodriguez; Mathew J Garnett; Michael P Menden; Frank Dondelinger
Veröffentlicht in: eLife, 2020, ISSN 2050-084X
Herausgeber: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2020.05.01.072983

Large language models forecast patient health trajectories enabling digital twins

Autoren: Nikita Makarov, Maria Bordukova, Papichaya Quengdaeng, Daniel Garger, Raul Rodriguez-Esteban, Fabian Schmich, Michael P. Menden
Veröffentlicht in: npj Digital Medicine, Ausgabe 8, 2025, ISSN 2398-6352
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41746-025-02004-3

Inferred Ancestral Origin of Cancer Cell Lines Associates with Differential Drug Response

Autoren: Phong Nguyen; Alexander J Ohnmacht; Samir Sharifli; Mathew J. Garnett; Michael P. Menden
Veröffentlicht in: International Journal of Molecular Sciences, 2021, ISSN 1422-0067
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms221810135

Conference proceedings (2)

Refining first-line treatment decision in RAS wildtype (RAS-WT) metastatic colorectal cancer (mCRC) by combining clinical biomarkers: Results of the randomized phase 3 trial FIRE-3 (AIO KRK0306).

Autoren: Julian Walter Holch, Alexander Ohnmacht, Sebastian Stintzing, Kathrin Heinrich, Benedikt Westphalen, Lena Weiss, Ludwig von Weikersthal, Thomas Decker, Alexander Kiani, Florian Kaiser, Tobias Heintges, Christoph Kahl, Frank Kullmann, Werner Scheithauer, Hartmut Link, Heinz-Gert Hoeffkes, Markus H Moehler, Dominik Paul Modest, Michael Menden, Volker Heinemann
Veröffentlicht in: Journal of Clinical Oncology, 2024, Seite(n) 13-13
Herausgeber: American Society of Clinical Oncology
DOI: 10.1200/jco.2024.42.3_suppl.13

DNA METHYLATION PROFILING REFINES THE PROGNOSTIC CLASSIFICATION OF ACUTE MYELOID LEUKEMIA PATIENTS TREATED WITH INTENSIVE CHEMOTHERAPY

Autoren: Vosberg, S.; Ohnmacht, A.; Moser, C.; Arneth, A.; Jurinovic, V.; Metzeler, K. H.; Sauerland, M. C.; Görlich, D.; Berdel, W. E.; Braess, J.; Amler, S.; Krug, U.; Hiddemann, W.; Spiekermann, K.; Oakes, C. C.; Menden, M. P.; Herold, T.; Greif, P. A.
Veröffentlicht in: HemaSphere, 2022, ISSN 2572-9241
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1097/01.hs9.0000844804.00811.c6