Predicting potent drug combinations by exploiting monotherapy resistance

Informacje na temat projektu

COMBAT-RES

Identyfikator umowy o grant: 950293

DOI

10.3030/950293

Realizacja projektu zakończyła się 1 Października 2025

Data podpisania przez KE 17 Listopada 2020

Data rozpoczęcia 1 Stycznia 2021

Data zakończenia 31 Grudnia 2025

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 499 991,00

Wkład UE

€ 1 499 991,00

Koordynowany przez

HELMHOLTZ ZENTRUM MUENCHEN DEUTSCHES FORSCHUNGSZENTRUM FUER GESUNDHEIT UND UMWELT GMBH
Germany

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Publikacje

Peer reviewed articles (16)

Generative artificial intelligence empowers digital twins in drug discovery and clinical trials

Autorzy: M Bordukova, N Makarov, R Rodriguez-Esteban, F Schmich, MP Menden
Opublikowane w: Expert Opinion on Drug Discovery, 2024, Strona(/y) 19 (1), 33-42, ISSN 1746-0441
Wydawca: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2023.2273839

Loss of NEDD8 in cancer cells causes vulnerability to immune checkpoint blockade in triple-negative breast cancer

Autorzy: Irineos Papakyriacou, Ginte Kutkaite, Marta Rúbies Bedós, Divya Nagarajan, Liam P. Alford, Michael P. Menden, Yumeng Mao
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-47987-x

Epigenetic regulation of cell state by H2AFY governs immunogenicity in high-risk neuroblastoma

Autorzy: Divya Nagarajan, Rebeca T. Parracho, David Corujo, Minglu Xie, Ginte Kutkaite, Thale K. Olsen, Marta Rubies Bedos, Maede Salehi, Ninib Baryawno, Michael P. Menden, Xingqi Chen, Marcus Buschbeck, Yumen
Opublikowane w: Journal of Clinical Investigation, Numer 134, 2024, ISSN 1558-8238
Wydawca: American Society for Clinical Investigation
DOI: 10.1172/jci175310

The impact of the cardiovascular component and somatic mutations on ageing

Autorzy: Daniel Garger, Martin Meinel, Tamina Dietl, Christina Hillig, Natalie Garzorz-Stark, Kilian Eyerich, Martin Hrabě de Angelis, Stefanie Eyerich, Michael P. Menden
Opublikowane w: Aging Cell, 2023, ISSN 1474-9718
Wydawca: Blackwell Publishing Inc.
DOI: 10.1111/acel.13957

Can artificial intelligence accelerate preclinical drug discovery and precision medicine?

Autorzy: Ali Farnoud, Alexander J Ohnmacht, Martin Meinel, Michael P Menden
Opublikowane w: Expert Opinion on Drug Discovery, 2022, ISSN 1746-0441
Wydawca: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2022.2090540

LUBAC modulates CBM complex functions downstream of TRAF6 in T cells

Autorzy: Carina Graß, Franziska Ober, Constanze Sixt, Bahareh Nemati Moud, Irina Antoshkina, Frederick Eberstadt, Alisa Puhach, Göksu Avar, Antonia Keßler, Thomas J. O’Neill, Thomas Seeholzer, Jan Kranich
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 16, 2025, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-65879-6

Oncogene-induced MALT1 protease activity drives post-transcriptional gene expression in malignant lymphomas

Autorzy: Nicole Wimberger, Franziska Ober, Göksu Avar, Michael Grau, Wendan Xu, Georg Lenz, Michael P. Menden, Daniel Krappmann
Opublikowane w: Blood, 2023, ISSN 0006-4971
Wydawca: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2023021299

The Oncology Biomarker Discovery framework reveals cetuximab and bevacizumab response patterns in metastatic colorectal cancer

Autorzy: Ohnmacht AJ, Stahler A, Stintzing S, Modest DP, Holch JW, Westphalen CB, Hölzel L, Schübel MK, Galhoz A, Farnoud A, Ud-Dean M, Vehling-Kaiser U, Decker T, Moehler M, Heinig M, Heinemann V, Menden MP
Opublikowane w: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-41011-4

Generative AI and digital twins: shaping a paradigm shift from precision to truly personalized medicine

Autorzy: Maria Bordukova, Alina J. Arneth, Nikita Makarov, Robyn M. Brown, Elena K. Schneider-Futschik, Shyamali C. Dharmage, Elif Ekinci, Peter J. Crack, Danny M. Hatters, Alastair G. Stewart, David Stroud, T
Opublikowane w: Expert Opinion on Drug Discovery, Numer 20, 2025, Strona(/y) 821-826, ISSN 1746-0441
Wydawca: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2025.2507376

The pharmacoepigenomic landscape of cancer cell lines reveals the epigenetic component of drug sensitivity

Autorzy: Alexander Joschua Ohnmacht, Anantharamanan Rajamani, Göksu Avar, Ginte Kutkaite, Emanuel Gonçalves, Dieter Saur, Michael Patrick Menden
Opublikowane w: Communications Biology, 2023, ISSN 2399-3642
Wydawca: Nature
DOI: 10.1038/s42003-023-05198-y

WT1 and DNMT3A play essential roles in the growth of certain patient AML cells in mice

Autorzy: Maryam Ghalandary, Yuqiao Gao, Diana Amend, Ginte Kutkaite, Binje Vick, Karsten Spiekermann, Maja Rothenberg-Thurley, Klaus H. Metzeler, Anetta Marcinek, Marion Subklewe, Michael P. Menden, Vindi Jurinovic, Ehsan Bahrami, Irmela Jeremias
Opublikowane w: Blood, 2023, Strona(/y) 141 (8): 955–960., ISSN 0006-4971
Wydawca: American Society of Hematology
DOI: 10.1182/blood.2022016411

FOLFIRI with cetuximab or bevacizumab in RAS wild-type metastatic colorectal cancer: Refining first-line treatment selection by combining clinical parameters

Autorzy: Julian Walter Holch, Alexander J. Ohnmacht, Sebastian Stintzing, Kathrin Heinrich, Lena Weiss, Victoria Probst, Arndt Stahler, Ludwig Fischer von Weikersthal, Thomas Decker, Alexander Kiani, Florian K
Opublikowane w: European Journal of Cancer, Numer 220, 2025, Strona(/y) 115388, ISSN 0959-8049
Wydawca: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.ejca.2025.115388

Artificial intelligence in early drug discovery enabling precision medicine

Autorzy: Fabio Boniolo, Emilio Dorigatti, Alexander J Ohnmacht, Dieter Saur, Benjamin Schubert, Michael P Menden
Opublikowane w: Expert Opinion on Drug Discovery, 2021, ISSN 1746-0441
Wydawca: Informa Healthcare
DOI: 10.1080/17460441.2021.1918096

A statistical framework for assessing pharmacological response and biomarkers using uncertainty estimates

Autorzy: Dennis Wang; James Hensman; Ginte Kutkaite; Tzen S Toh; Ana Galhoz; GDSC Screening Team; Jonathan R Dry; Julio Saez-Rodriguez; Mathew J Garnett; Michael P Menden; Frank Dondelinger
Opublikowane w: eLife, 2020, ISSN 2050-084X
Wydawca: eLife Sciences Publications
DOI: 10.1101/2020.05.01.072983

Large language models forecast patient health trajectories enabling digital twins

Autorzy: Nikita Makarov, Maria Bordukova, Papichaya Quengdaeng, Daniel Garger, Raul Rodriguez-Esteban, Fabian Schmich, Michael P. Menden
Opublikowane w: npj Digital Medicine, Numer 8, 2025, ISSN 2398-6352
Wydawca: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s41746-025-02004-3

Inferred Ancestral Origin of Cancer Cell Lines Associates with Differential Drug Response

Autorzy: Phong Nguyen; Alexander J Ohnmacht; Samir Sharifli; Mathew J. Garnett; Michael P. Menden
Opublikowane w: International Journal of Molecular Sciences, 2021, ISSN 1422-0067
Wydawca: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/ijms221810135

Conference proceedings (2)

Refining first-line treatment decision in RAS wildtype (RAS-WT) metastatic colorectal cancer (mCRC) by combining clinical biomarkers: Results of the randomized phase 3 trial FIRE-3 (AIO KRK0306).

Autorzy: Julian Walter Holch, Alexander Ohnmacht, Sebastian Stintzing, Kathrin Heinrich, Benedikt Westphalen, Lena Weiss, Ludwig von Weikersthal, Thomas Decker, Alexander Kiani, Florian Kaiser, Tobias Heintges, Christoph Kahl, Frank Kullmann, Werner Scheithauer, Hartmut Link, Heinz-Gert Hoeffkes, Markus H Moehler, Dominik Paul Modest, Michael Menden, Volker Heinemann
Opublikowane w: Journal of Clinical Oncology, 2024, Strona(/y) 13-13
Wydawca: American Society of Clinical Oncology
DOI: 10.1200/jco.2024.42.3_suppl.13

DNA METHYLATION PROFILING REFINES THE PROGNOSTIC CLASSIFICATION OF ACUTE MYELOID LEUKEMIA PATIENTS TREATED WITH INTENSIVE CHEMOTHERAPY

Autorzy: Vosberg, S.; Ohnmacht, A.; Moser, C.; Arneth, A.; Jurinovic, V.; Metzeler, K. H.; Sauerland, M. C.; Görlich, D.; Berdel, W. E.; Braess, J.; Amler, S.; Krug, U.; Hiddemann, W.; Spiekermann, K.; Oakes, C. C.; Menden, M. P.; Herold, T.; Greif, P. A.
Opublikowane w: HemaSphere, 2022, ISSN 2572-9241
Wydawca: Wiley
DOI: 10.1097/01.hs9.0000844804.00811.c6