Predicting microbial interactions with approaches based on flux balance analysis: an evaluation
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Autoren:
Clémence Joseph, Haris Zafeiropoulos, Kristel Bernaerts, Karoline Faust
Veröffentlicht in:
BMC Bioinformatics, Ausgabe 25, 2024, ISSN 1471-2105
Herausgeber:
BioMed Central
DOI:
10.1186/s12859-024-05651-7
microbetag: simplifying microbial network interpretation through annotation, enrichment tests, and metabolic complementarity analysis
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Autoren:
Haris Zafeiropoulos, Ermis Ioannis Michail Delopoulos, Andi Erega, Aline Schneider, Annelies Geirnaert, John Morris, Karoline Faust
Veröffentlicht in:
Genome Biology, Ausgabe 26, 2025, Seite(n) 1-34, ISSN 1474-760X
Herausgeber:
Springer Science and Business Media LLC
DOI:
10.1186/s13059-025-03769-2
Integrating host and microbiome biology using holo-omics
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Autoren:
Carl M Kobel, Jenny Merkesvik, Idun Maria Tokvam Burgos, Wanxin Lai, Ove Øyås, Phillip B Pope, Torgeir R Hvidsten, Velma T E Aho
Veröffentlicht in:
Molecular Omics, Ausgabe 20, 2026, Seite(n) 438-452, ISSN 2515-4184
Herausgeber:
Oxford University Press (OUP)
DOI:
10.1039/d4mo00017j
Differential effects of synbiotic delivery route (feed, water, combined) in broilers challenged with Salmonella Infantis
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Autoren:
Victoria Drauch, Mahdi Ghanbari, Nicole Reisinger, Michaela Mohnl, Claudia Hess, Michael Hess
Veröffentlicht in:
Poultry Science, Ausgabe 104, 2025, Seite(n) 104890, ISSN 0032-5791
Herausgeber:
Poultry Science Association Inc.
DOI:
10.1016/j.psj.2025.104890