Three-dimensional holo’omic landscapes to unveil host-microbiota interactions shaping animal production

Informations projet

3D-omics

N° de convention de subvention: 101000309

DOI

10.3030/101000309

Projet clôturé

Date de signature de la CE 10 Mai 2021

Date de début 1 Septembre 2021

Date de fin 31 Decembre 2025

Financé au titre de

• SOCIETAL CHALLENGES - Food security, sustainable agriculture and forestry, marine, maritime and inland water research, and the bioeconomy

Coût total

€ 10 073 540,01

Contribution de l’UE

€ 9 994 415,00

Coordonné par

KOBENHAVNS UNIVERSITET
Denmark

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Documents, reports (7)

Manuscript: modulate microbiota based on 3D'omics

Manuscript: modulate microbiota based on 3D’omics

Manuscript: comparison of 3D'omics and multi-omics

Manuscript: comparison of 3D’omics and multi-omics

International Collaboration Reinforcing report
Outreach and public engagement activity report
Economic and Life Cycle Assessment of 3D'omics

Economic and Life Cycle Assessment of 3D’omics

3D'omics technology blueprint

3D’omics technology blueprint

Manuscript: how to implement 3D'omics data in breeding and nutrition

Manuscript: how to implement 3D’omics data in breeding and nutrition

Other (5)

3D'omics outreach videos

3Domics outreach videos

www.3domics.eu website

www3domicseu website

3D'omics data and metadata standards

3D’omics data and metadata standards

3D'omics visualisation platform

3D’omics visualisation platform

3D'omics outreach video 2

Publications

Peer reviewed articles (4)

Predicting microbial interactions with approaches based on flux balance analysis: an evaluation

Auteurs: Clémence Joseph, Haris Zafeiropoulos, Kristel Bernaerts, Karoline Faust
Publié dans: BMC Bioinformatics, Numéro 25, 2024, ISSN 1471-2105
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12859-024-05651-7

microbetag: simplifying microbial network interpretation through annotation, enrichment tests, and metabolic complementarity analysis

Auteurs: Haris Zafeiropoulos, Ermis Ioannis Michail Delopoulos, Andi Erega, Aline Schneider, Annelies Geirnaert, John Morris, Karoline Faust
Publié dans: Genome Biology, Numéro 26, 2025, Page(s) 1-34, ISSN 1474-760X
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/s13059-025-03769-2

Integrating host and microbiome biology using holo-omics

Auteurs: Carl M Kobel, Jenny Merkesvik, Idun Maria Tokvam Burgos, Wanxin Lai, Ove Øyås, Phillip B Pope, Torgeir R Hvidsten, Velma T E Aho
Publié dans: Molecular Omics, Numéro 20, 2026, Page(s) 438-452, ISSN 2515-4184
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1039/d4mo00017j

Differential effects of synbiotic delivery route (feed, water, combined) in broilers challenged with Salmonella Infantis

Auteurs: Victoria Drauch, Mahdi Ghanbari, Nicole Reisinger, Michaela Mohnl, Claudia Hess, Michael Hess
Publié dans: Poultry Science, Numéro 104, 2025, Page(s) 104890, ISSN 0032-5791
Éditeur: Poultry Science Association Inc.
DOI: 10.1016/j.psj.2025.104890