Descrizione del progetto
Proteine regolatrici principali cellulari nell’infezione virale a RNA
I virus a RNA hanno l’RNA come materiale genetico che svolge un ruolo di rilievo durante l’infezione. I virus utilizzano proteinecellulari leganti l’RNA (RBP, RNA-Binding Proteins) per supportare l’infezione. Anche le cellule ospiti impiegano RBP per combattere i virus. Il progetto vRNP-capture, finanziato dall’UE, si propone di scoprire il repertorio di RBP cellulari con ruoli regolatori principali nelle infezioni virali a RNA. Una cattura dell’interattoma dell’RNA virale, un nuovo metodo sviluppato nel laboratorio che ha ospitato il progetto, consentirà di chiarire la composizione della ribonucleoproteina virale con profondità e specificità senza precedenti. La tecnologia impiega l’etichettatura a impulsi dell’RNA virale con un analogo nucleotidico fotoattivabile, la reticolazione UV, la purificazione dell’RNA virale e la proteomica quantitativa. Essa consentirà la scoperta di RBP cellulari con ruoli regolatori principali nell’infezione come potenziali bersagli per terapie antivirali ad ampio spettro.
Obiettivo
RNA is a central molecule for RNA virRNA is a central molecule for RNA virus infection. However, viral genomes encode very few proteins that are able to interact with viral RNA. Hence, viruses co-opt cellular RNA-binding proteins (RBPs) to support infection. The host cell also employs RBPs to combat viruses through the recognition of unusual signatures present viral RNAs. Despite these critical roles, the complement of cellular RBPs involved in infection remains largely unknown. This research programme aims to discover comprehensively and unbiasedly the repertoire of cellular RBPs endowed with master regulatory roles in virus infection. To achieve this, we will exploit a novel method developed in my laboratory, named viral RNA interactome capture (vRIC), that allows the elucidation of viral ribonucleoprotein (RNP) composition with unprecedented depth and specificity. It employs pulse-labelling of viral RNA with a photoactivatable nucleotide analogue, UV crosslinking, viral RNA purification with antisense probes and quantitative proteomics. (Aim 1) I hypothesise that cellular RBPs that interact with a broad-range of viral RNAs are likely endowed with master regulatory roles in infection. To test this, I will apply vRIC to cells infected with different RNA viruses to discover RBPs that are shared across viral RNPs. Moreover, we will employ interferon α to investigate if the engagement of these RBPs with viral RNA is regulated by the antiviral state. (Aim 2) To test if these broad-spectrum RBPs display master regulatory roles in infection, I will apply a novel functional screen using genetically modified cells and a broad library of fluorescent viruses. (Aim 3) We will then decipher the molecular mechanisms underpinning the ability of these RBPs to support or restrict infection. In summary, this innovative research programme will discover cellular RBPs with master regulatory roles in infection with great potential as targets for broad-spectrum antiviral therapies.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
G12 8QQ Glasgow
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.