Objetivo
Mushrooms are the sexual reproductive structures of basidiomycetes. Much remains to be learned about the molecular regulation of mushroom development. Only a few genes have been implicated in this process, but their exact function remains unknown. Schizophyllum commune is a model system for mushroom-forming fungi. It was recently shown that this species shows the highest intraspecies DNA variability in eukaryotes with 150 SNPs per 1000 base pairs, yet they can still reproduce sexually. This hypervariabity is also illustrated by variability in the response to environmental factors that initiate mushroom development and by the differences in morphology within this species. I propose a functional genomics approach to elucidate the molecular genetics of mushroom development.
We have a collection of 100 S. commune strains sampled world-wide. I propose to leverage the extraordinary diversity among these strains. I will identify genes that explain differences in mushroom morphology and in responses to environmental stimuli such as light and CO2. The genes/alleles responsible for these phenotypes will by mapped by genome sequencing followed by bulk segregant analysis.
Transcription factors (TFs) are expected to play an important role in regulation of mushroom development. Therefore I propose to systematically study TF function by generating a knock-down collection of all predicted 313 TFs. The phenotypes of the resulting strains will be analyzed and target genes of TFs will be identified by RNA-Seq and ChIP-Seq.
The genes identified by these strategies will subsequently be analyzed to determine their function. My initial results demonstrate the feasibility of this approach. The availability of the strain collection, the available molecular toolbox, and my strong expertise both in genomics and molecular biology of mushroom development will enable me to take a huge step forward in our understanding of mushroom development.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular genética molecular
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología micología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-STG - Starting Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2016-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
3584 CS Utrecht
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.