Repurposing small RNA from ciliates for genome editing: single-molecule study

Información del proyecto

MIGHTY_RNA

Identificador del acuerdo de subvención: 819299

DOI

10.3030/819299

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 18 Diciembre 2018

Fecha de inicio 1 Mayo 2019

Fecha de finalización 30 Abril 2024

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 792 850,00

Aportación de la UE

€ 1 792 850,00

Coordinado por

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Netherlands

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Publicaciones

Peer reviewed articles (8)

the road to next-generation single-molecule biophysics

Autores: Severins, I.W.H.; Joo, C.; Noort, S.J.T. van
Publicado en: Molecular Cell, Edición 4, 2022, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2022.04.024

RNA-guided RNA silencing by an Asgard archaeal Argonaute

Autores: Carolien Bastiaanssen, Pilar Bobadilla Ugarte, Kijun Kim, Giada Finocchio, Yanlei Feng, Todd A. Anzelon, Stephan Köstlbacher, Daniel Tamarit, Thijs J. G. Ettema, Martin Jinek, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Daan C. Swarts & Fabai Wu
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, Página(s) 5499, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-49452-1

mRNA structural dynamics shape Argonaute-target interactions

Autores: Suzan Ruijtenberg, Stijn Sonneveld, Tao Ju Cui, Ive Logister, Dion de Steenwinkel, Yao Xiao, Ian J. MacRae, Chirlmin Joo, Marvin E. Tanenbaum
Publicado en: Nature Structural & Molecular Biology, Edición 27/9, 2020, Página(s) 790-801, ISSN 1545-9993
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41594-020-0461-1

High-Speed Super-Resolution Imaging Using Protein-Assisted DNA-PAINT

Autores: Mike Filius, Tao Ju Cui, Adithya N. Ananth, Margreet W. Docter, Jorrit W. Hegge, John van der Oost, Chirlmin Joo
Publicado en: Nano Letters, Edición 20/4, 2020, Página(s) 2264-2270, ISSN 1530-6984
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.nanolett.9b04277

FRET-based dynamic structural biology: Challenges, perspectives and an appeal for open-science practices

Autores: Lerner, Eitan; Barth, Anders; Hendrix, Jelle; Ambrose, Benjamin; Birkedal, Victoria; Blanchard, Scott C.; Börner, Richard; Chung, Hoi Sung; Cordes, Thorben; Craggs, Timothy D.; Deniz, Ashok A.; Diao, Jiajia; Fei, Jingyi; Gonzalez, Ruben L.; Gopich, Irina V.; Ha, Taekjip; Hanke, Christian A.; Haran, Gilad; Hatzakis, Nikos S.; Hohng, Sungchul; Hong, Seok Cheol; Hugel, Thorsten; Ingargiola, Antonino
Publicado en: eLife, Edición 2, 2021, ISSN 2050-084X
Editor: eLife Sciences Publications
DOI: 10.7554/elife.60416

Argonaute bypasses cellular obstacles without hindrance during target search

Autores: Tao Ju Cui, Misha Klein, Jorrit W. Hegge, Stanley D. Chandradoss, John van der Oost, Martin Depken, Chirlmin Joo
Publicado en: Nature Communications, Edición 10/1, 2019, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-019-12415-y

Targeting G-quadruplex Forming Sequences with Cas9

Autores: Hamza Balci; Hamza Balci; Viktorija Globyte; Chirlmin Joo
Publicado en: ACS Chemical Biology, Edición 2, 2021, ISSN 1554-8929
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1101/2020.09.19.304816

Small RNA-directed DNA elimination: the molecular mechanism and its potential for genome editing.

Autores: C.K.J.M.L. Bastiaanssen; Chirlmin Joo
Publicado en: RNA Biology, Edición 2, 2021, ISSN 1547-6286
Editor: Landes Bioscience
DOI: 10.1080/15476286.2021.1885208