Objetivo
Chromatin is the ensemble of genomic DNA and hundreds of structural and regulatory proteins. Together these proteins govern the gene expression program of a cell. While biochemical and genetic approaches have tought us much about interactions between individual chromatin proteins, we still lack a “big picture” of chromatin: how is the entire interaction network of chromatin proteins organized?
My lab discovered that chromatin in Drosophila consists of a limited number of principal types that partition the genome into domains with distinct regulatory properties. Among these is BLACK chromatin, a novel repressive type of chromatin that covers nearly half of the fly genome. It is still largely unclear how these different chromatin types are formed, how they are targeted to specific genomic regions, and how they interact with each other.
Here, I propose a combination of systematic approaches aimed to gain insight into the basic mechanisms that drive the partioning of the genome into distinct chromatin types. New genomics techniques, developed in my laboratory, will be used to construct an integrated view of the interplay of more than one hundred representative chromatin proteins with each other and with sequence elements in the genome. Specifically, we will: (1) Study the genome-wide dynamic repositioning of chromatin domains during development in relation to gene regulation; (2) Use a novel and versatile parallel genome-wide reporter assay to dissect the interplay among DNA sequences and chromatin types; (3) Combine computational modeling with a high-throughput genome-wide assay to uncover the network of interactions responsible for the formation of the principal chromatin types; (4) Dissect the molecular architecture of BLACK chromatin and its role in gene repression.
The results will provide understanding of the basic principles that govern the structure and composition of chromatin, and reveal how the principal chromatin types together direct gene expression.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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ERC-2011-ADG_20110310
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Institución de acogida
1066 CX Amsterdam
Países Bajos
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.