Lepsze owoce dzięki genomice
Na przestrzeni ostatniej dekady naukowcy wygenerowali ogromną ilość informacji genomicznych o drzewach owocowych, opracowując przy tym szereg cennych narzędzi hodowlanych. Konieczne jest jednak zebranie i uporządkowanie tej wiedzy, aby umożliwić hodowcom komercyjnym optymalne korzystanie z niej. Projekt FRUIT BREEDOMICS(odnośnik otworzy się w nowym oknie) (Integrated approach for increasing breeding efficiency in fruit tree crops), finansowany ze środków UE, powstał w celu poprawy wydajności produkcji jabłek i brzoskwiń. Partnerzy projektu opracowali narzędzia molekularne i bioinformatyczne umożliwiające badanie różnorodności występującej w kolekcjach zarodków i populacjach hodowlanych europejskich drzew owocowych. Stworzono nowe odmiany jabłek, odporne na parch jabłoni, mączniak i zarazę ogniową, a także odmiany brzoskwini, oporne na mszyce i grzyb Monilinia fructicola. Dzięki zastosowaniu narzędzi genomicznych udało się tego dokonać w ciągu niecałych siedmiu lat, czyli znacznie szybciej niż w przypadku konwencjonalnych programów hodowlanych. Uczestnicy projektu opracowali też standardową procedurę stosowania genomiki w hodowli jabłek i brzoskwiń. Innym aspektem projektu FRUIT BREEDOMICS było opracowanie komercyjnego wysokoprzepustowego testu umożliwiającego identyfikację polimorfizmów pojedynczego nukleotydu, kojarzonych z ekonomicznie pożądanymi cechami jabłek. Chodzi tu o odporność na choroby, jakość owoców i odporność na stres biotyczny. Stworzono relacyjną bazę danych dla zbiorów fenotypów oraz interfejs użytkownika do zarządzania i przeszukiwania zawartości bazy. Badacze dokonali też przeglądu i zebrali liczne narzędzia do wiązania cech genetycznych z fizycznymi i przetestowali te narzędzia na różnych odmianach. Rozwiązania te tworzą wspólnie nową platformę, FruitBreedomics Marker Assisted Breeding Services, która pomoże w dotarciu z nowymi technologiami do firm zajmujących się hodowlą roślin. W ramach projektu FRUIT BREEDOMICS powstały nowe narzędzia do sprawniejszej hodowli owoców, a ponadto przetestowano je pod kątem tworzenia nowych, ulepszonych odmian. Prace te będą miały istotne znaczenie dla aktualnie stosowanych metod hodowli owoców.
