Cel
The objective of the present proposal is to evaluate a novel method for the genetic fine-mapping of Quantitative Trait Loci (QTL) underlying economically important traits, in livestock, based on within-and across-breed identity-by-descent (IBD).
Major efforts are presently being devoted to the genetic mapping of QTL underlying production traits in the different livestock species. Results of the first whole genome scans in pigs (Andersson et al., Science, 263:1771-1774, 1994) and cattle (Georges et al., Genet;cs 139:907-920, 1995) convincingly demonstrate that tbis endeavours will very likely be succesful and yield a large number of mapped loci in the near future. This opens the way towards the exploitation of these results in more efficient Marker Assisted Selection schemes, another intense area of animal science research. The increasing palticipation of the concerned industries in these projects testifies of their growing interest in what is likely to become a indispensable tool in future breeding programs aimed at increasing the efficiency of animal production.
Efficient utilisation of the mapped QTL in breeding programs, however, as well as the ultimate positional cloning of the corresponding genes, requires a higher mapping resolution than what is presently being achieved. Within the constraints of the present experimental designs, Quantitative Trait Loci (QTL) are often mapped to support intervals that are several tens of centimorgan large, corresponding to several tens of millions of base pairs and several hundreds if not thousands of possible candidate genes.
To overcome the resolution limits of the present QTL mapping methods, we therefore propose to evaluate a novel strategy to fine-map QTL segregating in outbred populations. The proposed strategy exploits the identity-by-descent of QTL alleles with large substitution effects, both within- and across-breeds. The within-breed component of ther project assumes that QTL alleles with large effects are often genetically homogeneous or IBD within breeds. These IBD QTL alleles are expected to be flanked by an IBD chromosome segment, of a size that will reflect the number of generations to a common ancestor or coalescence . The across-breed component assumes that different breeds share IBD QTL alleles that have migrated between these breeds where they have been maintained by artificial selection. Likewise, across-breed IBD QTL alleles are expected to be flanked by IBD chromosome segments, of a size that will reflect the number of generations to a common ancestor or coalescence . The number of generations to coalescence is expected to be higher in the across-breed approach, therefore allowing for a superior mapping resolution. Identifying such IBD segment in chromosomal areas where conventional QTL mapping strategies have shown evidence for QTL, would unambiguously map the QTL at a reslution that would be extremely difficult and costly to achieve using conventional strategies.
This strategy therefore proposes to take advantage of the breed diversity characterizing the European (and potentially other) continents and is a concrete justification of the programs aimed at the conservation of livestock biodiversity.
The specific objective of the EURIBMS project is the evaluation of the efficacy of the proposed QTL fine-mapping method in a pilot experiment focusing on a QTL with major effect on milk yield and composition mapping to bovine chromosome 6 (Georges et al., Genetics 139:907-920, 1995). The choice of this QTL was dictated because (i) the genuine nature of this QTL has been confirmed in several independent studies (ref.), (ii) the QTL has a major effect on the studied traits which facilitates the identification of segregating sire-families, and (iii) it is the only QTL to date that has been shown to segregate in different breeds (ref.). The partnership reatizes that the traits that are affected by this QTL are economically not the most relevant ones for application of MAS. This project is meant as an evaluation of the proposed method, that if succesful will be applicable to QTL affecting other traits. All partners are actively involved in mapping QTL affecting production efficiency, product quality and disease resistance in cattle.
This project will yield a high resolution genetic and physical map of the corresponding region on bovine chromosome 6.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne ekologia ekosystemy
- nauki społeczne ekonomia i biznes ekonomia ekonomia produkcji
- nauki rolnicze nauki o zwierzętach i mleczarstwo zwierzęta domowe hodowla zwierząt
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka chromosomy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
4000 LIEGE
Belgia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.