Cel
The immune system consists of a complex continuum of cell types that communicate with each other and non-immune tissues in homeostasis, and during infections, autoimmunity and cancer. Conventional transcriptional and functional profiling enabled by cell surface marker sorting has revealed a great deal about how specific cell types operate en masse, yet important transcriptional heterogeneity that exists within cell populations remains unexplored. High-throughput single cell RNA-seq can overcome this limitation by profiling entire transcriptomes of thousands of individual cells, revealing cell-to-cell variation by decoding patterns within populations masked in bulk transcriptomes. We will exploit this to dissect the mouse CD4+ T cell compartment, a heterogeneous white blood cell population that initiates adaptive immune responses.
In AIM 1, we will chart the dynamics of in vivo CD4+ cell states in mouse before, during and after immune response challenges. By sequencing thousands of single cell transcriptomes, we will map the landscape of CD4+ T cell states in an unbiased, quantitative and comprehensive way.
In AIM 2, we will predict key transcription factors, cell surface markers, and signalling molecules, including cytokines/chemokines in each cell state through novel computational approaches. Furthermore, our analyses will establish regulatory modules and networks of gene-gene interactions active in immune responses.
In AIM 3, we will (a) confirm the in vivo impact of new cell states by performing adoptive cell transfer assays; and
(b) validate our predictions of regulatory molecules and interactions using a massively parallel CRISPR/Cas knockout screen in vitro.
This powerful integrated approach combines single cell RNA-sequencing, bioinformatics and genetic engineering to dissect CD4+ T cell states, a central compartment of mammalian adaptive immunity, and reveal basic principles of gene regulation.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: https://op.europa.eu/pl/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna farmakologia i farmacja opracowywanie leków
- medycyna i nauki o zdrowiu nauki o zdrowiu choroby zakaźne malaria
- medycyna i nauki o zdrowiu biotechnologia medyczna inżynieria genetyczna
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna immunologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna fizjologia homeostaza
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
ERC-COG - Consolidator Grant
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2014-CoG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
CB10 1SA SAFFRON WALDEN
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.