Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski polski
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

An e-infrastructure for software, training and consultancy in simulation and modelling

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

E-CAM Public Wiki-like pages and newsletters III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on (a) the generation and updating of Wiki-like pages describing E-CAM’s activities in a language appropriate to the general public; and, (b) E-CAM newsletters; published in previous 4 quarters.

E-CAM software Porting porting and Benchmarking benchmarking Data data IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software porting and benchmarking data III.

ESDW guidelines and programme IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated guidelines for format, content and coding styles in the ESWD, and programme for year 4. Drafted jointly by CH, JUELICH, ICHEC and NUID UCD. Includes updated advanced on-line training modules on use of a structured Wiki-like page, basic parallel programming, scripting tools, use of version control tools.

E-CAM Public Wiki-like pages and newsletters V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on (a) the generation and updating of Wiki-like pages describing E-CAM’s activities in a language appropriate to the general public; and, (b) E-CAM newsletters; published in previous 3 quarters.

ESDW guidelines and programme III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated guidelines for format, content and coding styles in the ESWD, and programme for year 3. Drafted jointly by CH, JUELICH, ICHEC and NUID UCD. Includes updated on-line training modules on use of a structured Wiki-like page, basic parallel programming, scripting tools, use of version control tools..

Identification/selection of E-CAM MD codes for development (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

It will contain a review of software and algorithms in the area of classical MD and a list of new software to be developed at E-CAM.

E-CAM software porting and benchmarking data I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Joint technical report on results of (a) porting and optimisation of at least 8 new modules related to those developed in the ESDWs to massively parallel machine (STFC); and (b) benchmarking and scaling of at least 8 new modules related to those developed in the ESDWs on a variety of architectures (Juelich).

Identification/selection of E-CAM meso and multi-scale modelling codes for development (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Special report on the state of the art methods and algorithms, including: use of neural networks for force calculation and structure recognition; kinetic Monte Carlo calculations and the interface with computational fluid dynamics and electronic structure calculations; charge and polarization in dissipative dynamics calculations; statistical mechanics of Hamiltonian adaptive resolution simulations; hybrid kinetic schemes for modeling complex fluidsIt will also contain a review of software in this area and a list of new modules to be developed by E-CAM.

E-CAM software porting and benchmarking data II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

E-CAM software porting and benchmarking data I.

ESDW guidelines and programme V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated guidelines for format, content and coding styles in the ESWD, and programme for year 5. Drafted jointly by CH, JUELICH, ICHEC and NUID UCD. Updated advanced on-line training modules on use of a structured Wiki-like page, basic parallel programming, scripting tools, use of version control tools.

Hardware developments V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on hardware developments IV.

Hardware developments III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on hardware developments II.

E-CAM software porting and benchmarking data III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
E-CAM software platform I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

On-line publication of the E-CAM web-platform. The platform will include: (a) the E-CAM library of software modules and interfaces; (b) end users portal (to access E-CAM’s resources, make requests for software developments, register for events); (c) web infrastructure for teaching tools.

ESDW guidelines and programme I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Guidelines for format, content and coding styles in the ESWD, and programme for year 1. Drafted jointly by CH, JUELICH, ICHEC and NUID UCD. Includes 4-8 advanced on-line training modules on use of a structured Wiki-like page, basic parallel programming, scripting tools, use of version control tools.

E-CAM software porting and benchmarking data V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software porting and benchmarking data IV.

E-CAM Public Wiki-like pages and newsletters II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

E- CAM Public Wiki-like pages and newsletters II

E-CAM Public Wiki-like pages and newsletters I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on (a) the generation and updating of Wiki-like pages describing E-CAM’s activities in a language appropriate to the general public; and, (b) E-CAM newsletters; published in previous 4 quarters.

ESDW guidelines and programme II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Updated guidelines for format, content and coding styles in the ESWD, and programme for year 2. Drafted jointly by CH, JUELICH, ICHEC and NUID UCD. Includes updated on-line training modules on use of a structured Wiki-like page, basic parallel programming, scripting tools, use of version control tools.

Hardware developments IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on hardware developments III.

Identification/selection of E-CAM electronic structure codes for development (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Special report on the state of the art codes and methods in Quantum Monte Carlo and Density Functional Theory (DFT) and beyond DFT methods. It will contain a review of the basic features that the majority of these codes have in common with a view to modularisation. It will also contain a review of software in this area and a list of new modules to be developed by E-CAM.

E-CAM Public Wiki-like pages and newsletters IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Report on (a) the generation and updating of Wiki-like pages describing E-CAM’s activities in a language appropriate to the general public; and, (b) E-CAM newsletters; published in previous 4 quarters.

Hardware developments I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Joint report by STFC FR-IDF, and ICHEC on: (a) Report on hardware developments that will affect the scientific areas of interest to E-CAM and detailed feedback to the project software developers (STFC); (b) discussion of project software needs with hardware and software vendors, completion of survey of what is already available for particular hardware platforms (FR-IDF); and, detailed output from direct face-to-face session between the project end-users, developers and hardware vendors (ICHEC).

Identification/selection of E-CAM quantum dynamics codes for development (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Special report on the state of the art algorithms and efficient methods and interfaces for coupling electronic structure and quantum dynamical calculations. A list of new modules to be developed by E-CAM will also be provided.

Hardware developments II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on Hardware developments I.

ESDW technical software guidelines I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Guidelines for technical development of the software modules and the general E-CAM software architecture.

Electronic structure E-CAM modules III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Electronic Structure responding to requests of users, and their documentation.

Quantum dynamics E-CAM modules III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

6 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Quantum Dynamics based on users requests and their documentation.

Classical MD E-CAM modules V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Final Software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Classical Molecular Dynamics responding to requests of users, and their documentation.

Meso and multi-scale modelling E-CAM modules IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 Software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Meso and Multi-Scale Modelling responding to requests of users, and their documentation.

E-CAM software platform II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software tools and platforms jointly by CH and Juelich.

E-CAM software platform III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software tools and platforms jointly by CH and Juelich.

Classical MD E-CAM modules II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of statistical and machine learning tools for the analysis of rare events, and their documentation.

Electronic structure E-CAM modules V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Final software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Electronic Structure responding to requests of users, and their documentation.

Meso and Multimulti-scale modelling E-CAM modules II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of meso and multi-scale modelling, based on user requests and their documentation.

Quantum Dynamics dynamics E-CAM modules V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Final software modules delivered to the E-CAM library in the area of Quantum Dynamics based on users requests and their documentation.

Electronic structure E-CAM modules II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Wannier90 and electron phonon Wannier calculations.

Classical MD E-CAM modules III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of classical molecular dynamics responding to requests of users, and their documentation.

Meso and multi-scale modelling E-CAM modules V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Final Software modules delivered to the E-CAM repository in the area of meso and mulit-scale modelling responding to requests of users, and their documentation.

Classical MD E-CAM modules IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Classical Molecular Dynamics responding to requests of users, and their documentation.

E-CAM software platform IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software tools and platforms jointly by CH and Juelich.

E-CAM software platform V (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Update on E-CAM software tools and platforms jointly by CH and Juelich.

Meso and multi-scale modelling E-CAM modules I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of meso and multi-scale modelling, and their documentation.

Classical MD E-CAM modules I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules in classical Molecular Dynamics delivered to the E-CAM repository in the area of trajectory sampling, thermodynamics and kinetics of rare events, and their documentation.

Meso and multi-scale modelling E-CAM modules III (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of meso and multi-scale modelling, based on user requests and their documentation.

Quantum dynamics E-CAM modules IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

6 software modules delivered to the ECAM repository in the area of Quantum Dynamics based on users requests and their documentation

Electronic structure E-CAM modules I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 Software modules delivered to the E-CAM library in electronic structure including solvers for localised orbitals, for computing on a grid and solvers, and for transport, and their documentation.

Quantum dynamics E-CAM modules II (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

6 software modules delivered to the E-CAM repository in the area of quantum dynamics based on user requests and their documentation.

Electronic structure E-CAM modules IV (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

9 Software modules delivered to the E-CAM repository in the area of Electronic Structure responding to requests of users, and their documentation.

Quantum dynamics ECAM modules I (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

6 software modules delivered to the E-CAM repository in the areas of: (1) approximate methods for computing quantum time correlation functions; (2) exact integrators for the Schroedinger equation; (3) model potentials of increasing complexity for benchmarking

E-CAM software development tools (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

On-line deployment of centralized tools for software development, documentation and maintenance. These will include tools for automatic extraction of software documentation, bug tracking, version control, low-level software (e.g. memory handling).

Data Management Plan (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

The Project Administrator will develop a Data Management Plan (DMP) with all the participants. It will describe in detail how reports and data are handled. The plan will be approved and owned by the Executive Management Team. The plan, that outlines the practices for collecting, organizing, backing-up, and storing the data, will be updated regularly throughout the project. Within this task the data management plan for the Pilot on Open Research Data will be defined and delivered. It will outline how the data, including associated metadata, needed to validate the results presented in scientific publications will be made available openly.

Publikacje

Atomistic insight into the kinetic pathways for Watson–Crick to Hoogsteen transitions in DNA (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jocelyne Vreede, Alberto Pérez de Alba Ortíz, Peter G Bolhuis, David W H Swenson
Opublikowane w: Nucleic Acids Research, Numer 47/21, 2019, Strona(/y) 11069-11076, ISSN 0305-1048
Wydawca: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkz837

Electronic structure and optical properties of quantum crystals from first principles calculations in the Born–Oppenheimer approximation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Vitaly Gorelov, David M. Ceperley, Markus Holzmann, Carlo Pierleoni
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 153/23, 2020, Strona(/y) 234117, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0031843

Unfolding the prospects of computational (bio)materials modeling (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: G. J. Agur Sevink, Jozef Adam Liwo, Pietro Asinari, Donal MacKernan, Giuseppe Milano, Ignacio Pagonabarraga
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 153/10, 2020, Strona(/y) 100901, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0019773

Microswimmers learning chemotaxis with genetic algorithms (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Hartl, Benedikt; Hübl, Maximilian; Kahl, Gerhard; Zöttl, Andreas
Opublikowane w: PNAS, Numer 55, 2021, Strona(/y) in press, ISSN 1091-6490
Wydawca: National academy of sciences
DOI: 10.1073/pnas.2019683118

PANNA: Properties from Artificial Neural Network Architectures (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Ruggero Lot, Franco Pellegrini, Yusuf Shaidu, Emine Küçükbenli
Opublikowane w: Computer Physics Communications, Numer 256, 2020, Strona(/y) 107402, ISSN 0010-4655
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cpc.2020.107402

Towards blood flow in the virtual human: efficient self-coupling of HemeLB (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: J. W. S. McCullough, R. A. Richardson, A. Patronis, R. Halver, R. Marshall, M. Ruefenacht, B. J. N. Wylie, T. Odaker, M. Wiedemann, B. Lloyd, E. Neufeld, G. Sutmann, A. Skjellum, D. Kranzlmüller, P. V. Coveney
Opublikowane w: Interface Focus, Numer 11/1, 2021, Strona(/y) 20190119, ISSN 2042-8898
Wydawca: Royal Society Publishing
DOI: 10.1098/rsfs.2019.0119

Reliable Computational Prediction of the Supramolecular Ordering of Complex Molecules under Electrochemical Conditions (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Benedikt Hartl, Shubham Sharma, Oliver Brügner, Stijn F. L. Mertens, Michael Walter, Gerhard Kahl
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 16/8, 2020, Strona(/y) 5227-5243, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.9b01251

Equilibrium structures of anisometric, quadrupolar particles confined to a monolayer (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Thomas Heinemann, Moritz Antlanger, Martial Mazars, Sabine H. L. Klapp, Gerhard Kahl
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 144/7, 2016, Strona(/y) 074504, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.4941585

Gap variability upon packing in organic photovoltaics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: D. López-Durán, Etienne Plésiat, Michal Krompiec, Emilio Artacho
Opublikowane w: PLOS ONE, Numer 15/6, 2020, Strona(/y) e0234115, ISSN 1932-6203
Wydawca: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pone.0234115

Sampling the thermal Wigner density via a generalized Langevin dynamics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Thomas Plé, Simon Huppert, Fabio Finocchi, Philippe Depondt, Sara Bonella
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 151/11, 2019, Strona(/y) 114114, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5099246

Improved Description of Atomic Environments using Low-cost Polynomial Functions with Compact Support (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Martin Peter Bircher, Andreas Singraber, Christoph Dellago
Opublikowane w: Machine Learning: Science and Technology, 2021, ISSN 2632-2153
Wydawca: IOP Publishing Ltd
DOI: 10.1088/2632-2153/abf817

Towards extreme scale dissipative particle dynamics simulations using multiple GPGPUs (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Jony Castagna, Xiaohu Guo, Michael Seaton, Alan O’Cais
Opublikowane w: Computer Physics Communications, Numer 251, 2020, Strona(/y) 107159, ISSN 0010-4655
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cpc.2020.107159

The Fluctuation–Dissipation Theorem as a Diagnosis and Cure for Zero-Point Energy Leakage in Quantum Thermal Bath Simulations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Etienne Mangaud, Simon Huppert, Thomas Plé, Philippe Depondt, Sara Bonella, Fabio Finocchi
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 15/5, 2019, Strona(/y) 2863-2880, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.8b01164

Adiabatic motion and statistical mechanics via mass-zero constrained dynamics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Sara Bonella, Alessandro Coretti, Rodolphe Vuilleumier, Giovanni Ciccotti
Opublikowane w: Physical Chemistry Chemical Physics, Numer 22/19, 2020, Strona(/y) 10775-10785, ISSN 1463-9076
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cp00163e

A molecular perspective on Tully models for nonadiabatic dynamics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Lea M. Ibele, Basile F. E. Curchod
Opublikowane w: Physical Chemistry Chemical Physics, Numer 22/27, 2020, Strona(/y) 15183-15196, ISSN 1463-9076
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d0cp01353f

A systematic approach to generating accurate neural network potentials: the case of carbon (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yusuf Shaidu, Emine Küçükbenli, Ruggero Lot, Franco Pellegrini, Efthimios Kaxiras, Stefano de Gironcoli
Opublikowane w: npj Computational Materials, Numer 7/1, 2021, ISSN 2057-3960
Wydawca: Nature publishing group
DOI: 10.1038/s41524-021-00508-6

Rich Polymorphic Behavior of Wigner Bilayers (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Moritz Antlanger, Gerhard Kahl, Martial Mazars, Ladislav Šamaj, Emmanuel Trizac
Opublikowane w: Physical Review Letters, Numer 117/11, 2016, ISSN 0031-9007
Wydawca: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevlett.117.118002

Probing spatial locality in ionic liquids with the grand canonical adaptive resolution molecular dynamics technique (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: B. Shadrack Jabes, C. Krekeler, R. Klein, L. Delle Site
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 148/19, 2018, Strona(/y) 193804, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5009066

The opposing effects of isotropic and anisotropic attraction on association kinetics of proteins and colloids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Arthur C. Newton, Ramses Kools, David W. H. Swenson, Peter G. Bolhuis
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 147/15, 2017, Strona(/y) 155101, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5006485

Force Field Parametrization of Metal Ions from Statistical Learning Techniques (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Francesco Fracchia, Gianluca Del Frate, Giordano Mancini, Walter Rocchia, Vincenzo Barone
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 14/1, 2017, Strona(/y) 255-273, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.7b00779

ζ-Glycine: insight into the mechanism of a polymorphic phase transition (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Craig L. Bull, Giles Flowitt-Hill, Stefano de Gironcoli, Emine Küçükbenli, Simon Parsons, Cong Huy Pham, Helen Y. Playford, Matthew G. Tucker
Opublikowane w: IUCrJ, Numer 4/5, 2017, Strona(/y) 569-574, ISSN 2052-2525
Wydawca: International Union of Crystallography (IUCr)
DOI: 10.1107/S205225251701096X

Benchmarking a Fast Proton Titration Scheme in Implicit Solvent for Biomolecular Simulations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fernando Luís Barroso da Silva, Donal MacKernan
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 13/6, 2017, Strona(/y) 2915-2929, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.6b01114

Ionic Liquids Treated within the Grand Canonical Adaptive Resolution Molecular Dynamics Technique (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: B. Shadrack Jabes and Christian Krekeler
Opublikowane w: Computation, Numer 6/1, 2018, Strona(/y) 23, ISSN 2079-3197
Wydawca: MDPI
DOI: 10.3390/computation6010023

A parallel orbital-updating based plane-wave basis method for electronic structure calculations (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yan Pan, Xiaoying Dai, Stefano de Gironcoli, Xin-Gao Gong, Gian-Marco Rignanese, Aihui Zhou
Opublikowane w: Journal of Computational Physics, Numer 348, 2017, Strona(/y) 482-492, ISSN 0021-9991
Wydawca: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jcp.2017.07.033

Towards open boundary molecular dynamics simulation of ionic liquids (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christian Krekeler, Luigi Delle Site
Opublikowane w: Phys. Chem. Chem. Phys., Numer 19/6, 2017, Strona(/y) 4701-4709, ISSN 1463-9076
Wydawca: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/C6CP07489H

Computational efficiency and Amdahl’s law for the adaptive resolution simulation technique (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christoph Junghans; Animesh Agarwal; Luigi Delle Site
Opublikowane w: Computer Physics Communications, Numer 1, 2017, ISSN 0010-4655
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cpc.2017.01.030

ESPResSo++ 2.0: Advanced methods for multiscale molecular simulation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Horacio V. Guzman, Nikita Tretyakov, Hideki Kobayashi, Aoife C. Fogarty, Karsten Kreis, Jakub Krajniak, Christoph Junghans, Kurt Kremer, Torsten Stuehn
Opublikowane w: Computer Physics Communications, Numer 238, 2019, Strona(/y) 66-76, ISSN 0010-4655
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.cpc.2018.12.017

Molecular Dynamics of Open Systems: Construction of a Mean‐Field Particle Reservoir (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luigi Delle Site, Christian Krekeler, John Whittaker, Animesh Agarwal, Rupert Klein, Felix Höfling
Opublikowane w: Advanced Theory and Simulations, Numer 2/5, 2019, Strona(/y) 1900014, ISSN 2513-0390
Wydawca: WILEY-VCH Verlag GmbH & Co.
DOI: 10.1002/adts.201900014

Unimolecular FRET sensors: Simple linker designs and properties (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Shourjya Sanyal, David F. Coker, Donal MacKernan
Opublikowane w: Nano Communication Networks, Numer 18, 2018, Strona(/y) 44-50, ISSN 1878-7789
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.nancom.2018.10.003

Adaptive resolution molecular dynamics technique: Down to the essential (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Christian Krekeler, Animesh Agarwal, Christoph Junghans, Matej Praprotnik, Luigi Delle Site
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 149/2, 2018, Strona(/y) 024104, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5031206

Local control theory for superconducting qubits (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: M. Mališ, P. Kl. Barkoutsos, M. Ganzhorn, S. Filipp, D. J. Egger, S. Bonella, I. Tavernelli
Opublikowane w: Physical Review A, Numer 99/5, 2019, ISSN 2469-9926
Wydawca: American Physical Society
DOI: 10.1103/PhysRevA.99.052316

The asymmetric Wigner bilayer (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Moritz Antlanger, Gerhard Kahl, Martial Mazars, Ladislav Šamaj, Emmanuel Trizac
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 149/24, 2018, Strona(/y) 244904, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/1.5053651

OpenPathSampling: A Python Framework for Path Sampling Simulations. 2. Building and Customizing Path Ensembles and Sample Schemes (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David W. H. Swenson, Jan-Hendrik Prinz, Frank Noe, John D. Chodera, Peter G. Bolhuis
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 15/2, 2018, Strona(/y) 837-856, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.8b00627

Lithium Adsorption on Graphene at Finite Temperature (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Yusuf Shaidu, Emine Küçükbenli, Stefano de Gironcoli
Opublikowane w: The Journal of Physical Chemistry C, Numer 122/36, 2018, Strona(/y) 20800-20808, ISSN 1932-7447
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcc.8b05689

Advanced capabilities for materials modelling with Quantum ESPRESSO (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: P Giannozzi, O Andreussi, T Brumme, O Bunau, M Buongiorno Nardelli, M Calandra, R Car, C Cavazzoni, D Ceresoli, M Cococcioni, N Colonna, I Carnimeo, A Dal Corso, S de Gironcoli, P Delugas, R A DiStasio, A Ferretti, A Floris, G Fratesi, G Fugallo, R Gebauer, U Gerstmann, F Giustino, T Gorni, J Jia, M Kawamura, H-Y Ko, A Kokalj, E Küçükbenli, M Lazzeri, M Marsili, N Marzari, F Mauri, N L Nguyen,
Opublikowane w: Journal of Physics: Condensed Matter, Numer 29/46, 2017, Strona(/y) 465901, ISSN 0953-8984
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-648X/aa8f79

OpenPathSampling: A Python Framework for Path Sampling Simulations. 1. Basics (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: David W. H. Swenson, Jan-Hendrik Prinz, Frank Noe, John D. Chodera, Peter G. Bolhuis
Opublikowane w: Journal of Chemical Theory and Computation, Numer 15/2, 2018, Strona(/y) 813-836, ISSN 1549-9618
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jctc.8b00626

Discovering the Elusive Global Minimum in a Ternary Chiral Cluster: Rotational Spectra of Propylene Oxide Trimer (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Fan Xie, Marco Fusè, Arsh S. Hazrah, Wolfgang Jäger, Vincenzo Barone, Yunjie Xu
Opublikowane w: Angewandte Chemie International Edition, Numer 59/50, 2020, Strona(/y) 22427-22430, ISSN 1433-7851
Wydawca: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/anie.202010055

Quantum Monte Carlo determination of the principal Hugoniot of deuterium (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Michele Ruggeri, Markus Holzmann, David M. Ceperley, Carlo Pierleoni
Opublikowane w: Physical Review B, Numer 102/14, 2020, ISSN 1098-0121
Wydawca: American Physical Society
DOI: 10.1103/physrevb.102.144108

Wannier90 as a community code: new features and applications (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Giovanni Pizzi, Valerio Vitale, Ryotaro Arita, Stefan Blügel, Frank Freimuth, Guillaume Géranton, Marco Gibertini, Dominik Gresch, Charles Johnson, Takashi Koretsune, Julen Ibañez-Azpiroz, Hyungjun Lee, Jae-Mo Lihm, Daniel Marchand, Antimo Marrazzo, Yuriy Mokrousov, Jamal I Mustafa, Yoshiro Nohara, Yusuke Nomura, Lorenzo Paulatto, Samuel Poncé, Thomas Ponweiser, Junfeng Qiao, Florian Thöle, S
Opublikowane w: Journal of Physics: Condensed Matter, Numer 32/16, 2020, Strona(/y) 165902, ISSN 0953-8984
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-648x/ab51ff

The CECAM electronic structure library and the modular software development paradigm (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Micael J. T. Oliveira, Nick Papior, Yann Pouillon, Volker Blum, Emilio Artacho, Damien Caliste, Fabiano Corsetti, Stefano de Gironcoli, Alin M. Elena, Alberto García, Víctor M. García-Suárez, Luigi Genovese, William P. Huhn, Georg Huhs, Sebastian Kokott, Emine Küçükbenli, Ask H. Larsen, Alfio Lazzaro, Irina V. Lebedeva, Yingzhou Li, David López-Durán, Pablo López-Tarifa, Martin Lüders,
Opublikowane w: The Journal of Chemical Physics, Numer 153/2, 2020, Strona(/y) 024117, ISSN 0021-9606
Wydawca: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0012901

Comparing equilibration schemes of high-molecular-weight polymer melts with topological indicators (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Luca Tubiana, Hideki Kobayashi, Raffaello Potestio, Burkhard Dünweg, Kurt Kremer, Peter Virnau, Kostas Daoulas
Opublikowane w: Journal of Physics: Condensed Matter, Numer 33/20, 2021, Strona(/y) 204003, ISSN 0953-8984
Wydawca: Institute of Physics Publishing
DOI: 10.1088/1361-648x/abf20c

Automated high-throughput Wannierisation (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: Valerio Vitale, Giovanni Pizzi, Antimo Marrazzo, Jonathan R. Yates, Nicola Marzari, Arash A. Mostofi
Opublikowane w: npj Computational Materials, Numer 6/1, 2020, ISSN 2057-3960
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41524-020-0312-y

Intelligent HTC for Committor Analysis (odnośnik otworzy się w nowym oknie)

Autorzy: O'Cais, Alan; Bialczak, Milosz; Swenson, David; Uchronsk, Mariusz; Wlodarczyk, Adam
Opublikowane w: PRACE White Paper, Numer 53, 2021
Wydawca: Zenodo
DOI: 10.5281/zenodo.4572788

Prawa własności intelektualnej

MOLECULAR SENSORS

Numer wniosku/publikacji: PCT IB2017/055432
Data: 2017-09-08
Wnioskodawca/wnioskodawcy: UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN

Wyszukiwanie danych OpenAIRE...

Podczas wyszukiwania danych OpenAIRE wystąpił błąd

Brak wyników

Moja broszura 0 0