Towards the discovery of cellular RNA-binding proteins with master regulatory roles in virus infection

Informacje na temat projektu

vRNP-capture

Identyfikator umowy o grant: 101001634

DOI

10.3030/101001634

Data podpisania przez KE 11 Marca 2021

Data rozpoczęcia 1 Grudnia 2021

Data zakończenia 30 Listopada 2027

Finansowanie w ramach

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Koszt całkowity

€ 1 999 916,00

Wkład UE

€ 1 999 916,00

Koordynowany przez

UNIVERSITY OF GLASGOW
United Kingdom

CORDIS oferuje możliwość skorzystania z odnośników do publicznie dostępnych publikacji i rezultatów projektów realizowanych w ramach programów ramowych HORYZONT.

Odnośniki do rezultatów i publikacji związanych z poszczególnymi projektami 7PR, a także odnośniki do niektórych konkretnych kategorii wyników, takich jak zbiory danych i oprogramowanie, są dynamicznie pobierane z systemu OpenAIRE .

Rezultaty

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan

Publikacje

Peer reviewed articles (7)

The molecular dissection of TRIM25’s RNA-binding mechanism provides key insights into its antiviral activity

Autorzy: Lucía Álvarez, Kevin Haubrich, Louisa Iselin, Laurent Gillioz, Vincenzo Ruscica, Karine Lapouge, Sandra Augsten, Ina Huppertz, Nila Roy Choudhury, Bernd Simon, Pawel Masiewicz, Mathilde Lethier, Stephen Cusack, Katrin Rittinger, Frank Gabel, Alexander Leitner, Gracjan Michlewski, Matthias W. Hentze, Frédéric H. T. Allain, Alfredo Castello, Janosch Hennig
Opublikowane w: Nature Communications, Numer 15, 2024, ISSN 2041-1723
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-52918-x

Alphavirus infection triggers selective cytoplasmic translocation of nuclear RBPs with moonlighting antiviral roles

Autorzy: Wael Kamel, Vincenzo Ruscica, Azman Embarc-Buh, Zaydah R. de Laurent, Manuel Garcia-Moreno, Yana Demyanenko, Richard J. Orton, Marko Noerenberg, Meghana Madhusudhan, Louisa Iselin, Aino I. Järvelin, Maximilian Hannan, Eduardo Kitano, Samantha Moore, Andres Merits, Ilan Davis, Shabaz Mohammed, Alfredo Castello
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 84, 2024, Strona(/y) 4896-4911.e7, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.11.015

Melanoma RBPome identification reveals PDIA6 as an unconventional RNA-binding protein involved in metastasis

Autorzy: Neus Mestre-Farràs; Santiago Guerrero; Nadine Bley; Ezequiel Rivero; Olga Coll; Eva Borràs; Eduard Sabidó; Alberto Indacochea; Carlos Casillas-Serra; Aino I Järvelin; Baldomero Oliva; Alfredo Castello; Stefan Hüttelmaier; Fátima Gebauer
Opublikowane w: Nuc Acid Res, Numer Journal, 2022, ISSN 1362-4962
Wydawca: Nucleic Acids Res
DOI: 10.1093/nar/gkac605

Exploring the expanding universe of host-virus interactions mediated by viral RNA

Autorzy: Alfredo Castello, Lucía Álvarez, Wael Kamel, Louisa Iselin, Janosch Hennig
Opublikowane w: Molecular Cell, Numer 84, 2024, Strona(/y) 3706-3721, ISSN 1097-2765
Wydawca: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2024.08.027

Uncovering viral RNA-host cell interactions on a proteome-wide scale

Autorzy: Louisa Iselin, Natasha Palmalux, Wael Kamel, Peter Simmonds, Shabaz Mohammed, Alfredo Castello
Opublikowane w: Trends Biochem Sci, Numer Journal, 2022, ISSN 0968-0004
Wydawca: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibs.2021.08.002

Repurposed 3D Printer Allows Economical and Programmable Fraction Collection for Proteomics of Nanogram Scale Samples

Autorzy: Eduardo S. Kitano, Gareth Nisbet, Yana Demyanenko, Katarzyna M Kowalczyk, Louisa Iselin, Stephen Cross, Alfredo Castello, and Shabaz Mohammed
Opublikowane w: Anal Chem, Numer Journal, 2024, ISSN 0003-2700
Wydawca: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.analchem.4c01731

Absolute quantitative and base-resolution sequencing reveals comprehensive landscape of pseudouridine across the human transcriptome

Autorzy: Haiqi Xu, Linzhen Kong, Jingfei Cheng, Khatoun Al Moussawi, Xiufei Chen, Aleema Iqbal, Peter A. C. Wing, James M. Harris, Senko Tsukuda, Azman Embarc-Buh, Guifeng Wei, Alfredo Castello, Skirmantas Kriaucionis, Jane A. McKeating, Xin Lu, Chun-Xiao Song
Opublikowane w: Nature Methods, Numer 21, 2024, Strona(/y) 2024-2033, ISSN 1548-7091
Wydawca: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02439-8

Other (5)

Uukuniemi virus infection causes a pervasive remodelling of the RNA-binding proteome in tick cells

Autorzy: Alexandra Wilson, Wael Kamel, Kelsey Davies, Zaydah R. De Laurent, Rozeena Arif, Lesley Bell-Sakyi, Douglas Lamont, Yana Demyanenko, Marko Noerenberg, Alain Kohl, Shabaz Mohammed, Alfredo Castello, Benjamin Brennan
Opublikowane w: BioRxiv, Numer Preprint, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.09.06.611624

Compositional analysis of Sindbis virus ribonucleoproteins reveals an extensive co-opting of key nuclear RNA-binding proteins

Autorzy: Wael Kamel, Vincenzo Ruscica, Manuel Garcia Moreno, Natasha Palmalux, Louisa Iselin, Maximilian Hannan, Aino Jarvelin, Marko Noerenberg, Samantha Moore, Andres Merits, Ilan Davis, Javier Martinez, Shabaz Mohammed, Alfredo Castello
Opublikowane w: BioRxiv, Numer Preprint, 2023
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2021.10.06.463336

XRN1 supplies free nucleotides to feed alphavirus replication

Autorzy: Vincenzo Ruscica, Louisa Iselin, Ryan Hull, Azman Embarc-Buh, Samyukta Narayanan, Natasha Palmalux, Namah Raut, Quan Gu, Honglin Chen, Marko Noerenberg, Zaydah R. de Laurent, Josmi Joseph, Michelle Noble, Catia Igreja, David L. Robertson, Joseph Hughes, Shabaz Mohammed, Vicent Pelechano, Ilan Davis, Alfredo Castello
Opublikowane w: BioRxiv, Numer Preprint, 2024
Wydawca: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.12.09.625895

Incorporation of genome-bound cellular proteins into HIV-1 particles regulates viral infection

Autorzy: Manuel Garcia-Moreno, Robin Truman, Honglin Chen, Louisa Iselin, Caroline E. Lenz, Jeffrey Y. Lee, Kate Dicker, Marko Noerenberg, Thibault J.M. Sohier, Natasha Palmalux, Aino I. Järvelin, Wael Kamel, Vincenzo Ruscica, Emiliano P. Ricci, Ilan Davis, Shabaz Mohammed and Alfredo Castello
Opublikowane w: BioRxiv, Numer Preprint, 2023
Wydawca: BioRxiv
DOI: 10.1101/2023.06.14.544764

The molecular dissection of TRIM25‘s RNA-binding mechanism provides key insights into its antiviral activity

Autorzy: Lucía Álvarez, Kevin Haubrich, Louisa Iselin, Laurent Gillioz, Vincenzo Ruscica, Karine Lapouge. Sandra Augsten, Ina Huppertz, Nila Roy Choudhury, Bernd Simon, Pawel Masiewicz, Mathilde Lethier, Stephen Cusack, Katrin Rittinger, Frank Gabel, Alexander Leitner, Gracjan Michlewski, Matthias W. Hentze, Frédéric H. T. Allain, Alfredo Castello, Janosch Hennig
Opublikowane w: Research Square, Numer Preprint, 2023
Wydawca: Research Scuare
DOI: 10.21203/rs.3.rs-3692619/v1